From 0c7ec4d226b9b14040c4e5a7a35740683913ae17 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Eduardo Junior <edujrrib@gmail.com>
Date: Thu, 17 Mar 2016 21:13:49 -0300
Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?Modifica=20o=20fonte=20e=20documenta=C3=A7?=
 =?UTF-8?q?=C3=A3o=20do=20dataset=20DemetrioTb1.5?=
MIME-Version: 1.0
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8
Content-Transfer-Encoding: 8bit

- A coluna direta foi trocada por metodo
- Alterou-se a documentação complementando com o experimento
  descrito no livro
- Na seção examples define gráficos que utilizam todas as
  variáveis observadas.
---
 R/DemetrioTb1.5.R          |  66 +++++++++++++++++++++++--------------
 data-raw/DemetrioTb1.5.txt |  66 ++++++++++++++++++-------------------
 data/DemetrioTb1.5.rda     | Bin 365 -> 413 bytes
 man/DemetrioTb1.5.Rd       |  62 +++++++++++++++++++++-------------
 4 files changed, 115 insertions(+), 79 deletions(-)

diff --git a/R/DemetrioTb1.5.R b/R/DemetrioTb1.5.R
index 0c74a13..6fd2155 100644
--- a/R/DemetrioTb1.5.R
+++ b/R/DemetrioTb1.5.R
@@ -1,32 +1,40 @@
 #' @name DemetrioTb1.5
-#' @title Valores de CTC direta e indereta
-#' 
-#' @description O experimento foi realizado em quatro blocos, sendo 
-#'  planejado para estudar o efeito da calagem sobre a CTC 
-#'  (Capacidade de troca catiônica) do solo medida por dois métodos 
-#'  diferentes.
-#' 
-#'  Os valores foram medidos 18 meses após a calagem incorporada ao
-#'  solo, segundo a dose de calcário, medida em tonelados por hectare 
-#'  (t/ha).
+#' @title Valores de CTC Direta e Indereta
 #' 
+#' @description O experimento foi realizado em quatro blocos, sendo
+#'     planejado para estudar o efeito da calagem sobre a CTC
+#'     (Capacidade de Troca Catiônica) do solo medida por dois métodos
+#'     diferentes. Os valores de CTC foram medidos 18 meses após a
+#'     calagem incorporada ao solo, na profundidade de 5 a 10 cm, segundo
+#'     a dose de calcário.
+#'
 #' @format Um \code{data.frame} de 32 linhas e 4 colunas.
 #' 
 #' \describe{
 #' 
-#'     \item{\code{bloco}}{Indica a qual bloco a amostra pertence.}
+#'     \item{\code{bloco}}{Fator que indica a qual bloco a amostra
+#'     pertence, usado para controle de variação.}
 #'     
-#'     \item{\code{dose}}{Indica a dose usada na referida observação.}
+#'     \item{\code{dose}}{Indica a dose de calcário usada na referida
+#'     observação, medida em tonelados por hectare (t/ha).}
 #'     
-#'     \item{\code{direta}}{Indica se é valor de CTC direta (1) ou 
-#'     indireta (0).}
+#'     \item{\code{metodo}}{Fator que indica o método para determinação
+#'     da CTC, direto (1) ou indireto (0).}
 #'     
 #'     \item{\code{ctc}}{É o valor observado de CTC, medido em 
-#'     mmol_{c}/kg.}
+#'     \eqn{mmol_{c}/kg}.}
 #' 
 #' }
-#' 
-#' @keywords CTC solo
+#'
+#' @details Na análise inicial do estudo do estudo foi detectada a
+#'     presença de um dado discrepante (177,00) correspondente ao
+#'     \code{bloco} I, \code{dose} 7,80 e \code{metodo} indireto. Em
+#'     conversa com o pesquisador verificou-se que se tratava de um erro
+#'     na transcrição dos dados e que o valor correto seria
+#'     124,00. Neste conjunto de dados mante-ve o valor discrepante para
+#'     efeitos didáticos.
+#'
+#' @keywords TODO
 #' 
 #' @source Demétrio, C. G. B., & Zocchi, S. S. (2011). Modelos de
 #'     Regressão. Piracicaba: ESALQ. (Tabela 1.5 pág. 12)
@@ -35,12 +43,22 @@
 #' 
 #' library(lattice)
 #' 
-#' data(DemetrioTb1.5)
+#' xyplot(ctc ~ dose | bloco, groups = metodo,
+#'        data = DemetrioTb1.5,
+#'        main = "Dose VS CTC",
+#'        xlab = "Dose", ylab = "CTC",
+#'        type = c("p", "r"),
+#'        auto.key = list(space = "right", title = "Método"))
+#' 
+#' # Corrigindo dado, conforme erro verificado pelo pesquisador
+#' select <- with(DemetrioTb1.5, bloco == 1 & dose == 7.8 & metodo == 0)
+#' DemetrioTb1.5$ctc[select] <- 124
 #' 
-#' xyplot(ctc ~ dose, data = DemetrioTb1.5,
-#'     main = "Dose VS CTC",
-#'     xlab = "Dose",
-#'     ylab = "CTC",
-#'     type = c("p", "r"), col.line = 3)
+#' xyplot(ctc ~ dose | bloco, groups  = metodo,
+#'        data = DemetrioTb1.5,
+#'        main = "Dose VS CTC",
+#'        xlab = "Dose", ylab = "CTC",
+#'        type = c("p","r"),
+#'        auto.key = list(space = "right", title = "Método"))
 #' 
-NULL
\ No newline at end of file
+NULL
diff --git a/data-raw/DemetrioTb1.5.txt b/data-raw/DemetrioTb1.5.txt
index ee8e2eb..a70150b 100644
--- a/data-raw/DemetrioTb1.5.txt
+++ b/data-raw/DemetrioTb1.5.txt
@@ -1,33 +1,33 @@
-bloco	dose	direta	ctc
-1	0	0	83
-2	0	0	90.7
-3	0	0	85.8
-4	0	0	85.5
-1	2	0	87.6
-2	2	0	84.6
-3	2	0	97.5
-4	2	0	80.8
-1	4.9	0	106.6
-2	4.9	0	111.4
-3	4.9	0	102.4
-4	4.9	0	112.4
-1	7.8	0	177
-2	7.8	0	112.2
-3	7.8	0	125.6
-4	7.8	0	106.4
-1	0	1	38.8
-2	0	1	38.8
-3	0	1	45.6
-4	0	1	50.2
-1	2	1	59.2
-2	2	1	53
-3	2	1	57.2
-4	2	1	62.8
-1	4.9	1	68.6
-2	4.9	1	73.3
-3	4.9	1	79.3
-4	4.9	1	77.9
-1	7.8	1	68.8
-2	7.8	1	90.7
-3	7.8	1	84.5
-4	7.8	1	73.8
+bloco	dose	metodo	ctc
+I	0	0	83
+II	0	0	90.7
+III	0	0	85.8
+IV	0	0	85.5
+I	2	0	87.6
+II	2	0	84.6
+III	2	0	97.5
+IV	2	0	80.8
+I	4.9	0	106.6
+II	4.9	0	111.4
+III	4.9	0	102.4
+IV	4.9	0	112.4
+I	7.8	0	177
+II	7.8	0	112.2
+III	7.8	0	125.6
+IV	7.8	0	106.4
+I	0	1	38.8
+II	0	1	38.8
+III	0	1	45.6
+IV	0	1	50.2
+I	2	1	59.2
+II	2	1	53
+III	2	1	57.2
+IV	2	1	62.8
+I	4.9	1	68.6
+II	4.9	1	73.3
+III	4.9	1	79.3
+IV	4.9	1	77.9
+I	7.8	1	68.8
+II	7.8	1	90.7
+III	7.8	1	84.5
+IV	7.8	1	73.8
diff --git a/data/DemetrioTb1.5.rda b/data/DemetrioTb1.5.rda
index c612691747ebf05d697aedfc7fb826e4bcbb3824..7e86c42a19ce8a6631bf89b5ec3fa88d337ca52e 100644
GIT binary patch
literal 413
zcmZ>Y%CIzaj8qGb?E5*HkAZP>{rCUo9x4YJs~CLE_SgJZpS!?;fx&>0#et1O!I6Q1
zaRXxo2d9h6DU*x6ZnJ~0TvlJg%#vinBk<MMeXD=Kvzd}SGZYtdHkn*pEMRhSVgo~y
zOGmIW=VAwD2Pp;yDQ1TYpLZTh>{XEUTQYggl%9#bH?%u1E2=SXb~#<lG(jc8>+zBz
z!AJi+{`suf9aHC?8(GrHnAq_4-h@tG<-Vt~lNWt|)55f{X|}+;J=?=)icU;j)u5t~
z#H09aA!pu}9zJ$K7M>ZJ=URMKEK=BNTD@{lh&emV_T*mmr`)Qo@gCEaXC8dJKJj&?
z{z%-BusO%cbYr=@f~4%9KSwXvwa!tS*`;gbCwSCCdbT=?p!%$e`|VF8Hsoo$ya{6U
z4Dsqp`J5nAv-z&Ux!SY&F5LUmf*bc1-~H3MFlvWjRS&~uuic5}?|tf`cNE`p+q872
z!lE-BUn5S;yBuZ_srw>(>ij^rN3&NuFx6U3t7&+pQC`u$YsISn2m2FLmG>`fRa(~P
W-fWrqaQ~xs9?Q9e1n(Oq9smGZu(IO-

literal 365
zcmZ>Y%CIzaj8qGboGn=Yoq^G-{`-G(50!(ARt#s&_SgJZpR>S$fx&>0#et1O!I6Q1
zaRZ};fU2)nmHGk(6Tt??g;G_5%hcHXgFOl-tIbL@GGb#%$~Y+DxY&n*L&amU+cLpr
z4Gbo{3{n{xyv&Zzi)VcA4Upw)RFBn|bf)yEf^O;=&c?h`;j-x}d$KO8`<yzKtK2hx
zy9!6tTZM!1JQEtWT!>2OkqdjFk+q0ZA%iFJ%fh%!rO#sO%pFba0ivE)IU9L4GOe0j
z<d~4bdUL<*87|X?$8%0H-t=i+7XI$>(X<;a*-zf~IT&sDeCwHB<0oB4lQR?7oV0NL
zdEm}X3x!Tw=KW0!_flr<YOr3JVEN|9@8@~zvbrW^dR_1QEj-QJhr!>0cf(@yIS+Qr
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XSqu4Ro#ht(6MItRp_5aN>;F3dgFc$b

diff --git a/man/DemetrioTb1.5.Rd b/man/DemetrioTb1.5.Rd
index 1c2ffe3..f292cb5 100644
--- a/man/DemetrioTb1.5.Rd
+++ b/man/DemetrioTb1.5.Rd
@@ -2,20 +2,22 @@
 % Please edit documentation in R/DemetrioTb1.5.R
 \name{DemetrioTb1.5}
 \alias{DemetrioTb1.5}
-\title{Valores de CTC direta e indereta}
+\title{Valores de CTC Direta e Indereta}
 \format{Um \code{data.frame} de 32 linhas e 4 colunas.
 
 \describe{
 
-    \item{\code{bloco}}{Indica a qual bloco a amostra pertence.}
+    \item{\code{bloco}}{Fator que indica a qual bloco a amostra
+    pertence, usado para controle de variação.}
     
-    \item{\code{dose}}{Indica a dose usada na referida observação.}
+    \item{\code{dose}}{Indica a dose de calcário usada na referida
+    observação, medida em tonelados por hectare (t/ha).}
     
-    \item{\code{direta}}{Indica se é valor de CTC direta (1) ou 
-    indireta (0).}
+    \item{\code{metodo}}{Fator que indica o método para determinação
+    da CTC, direto (1) ou indireto (0).}
     
     \item{\code{ctc}}{É o valor observado de CTC, medido em 
-    mmol_{c}/kg.}
+    \eqn{mmol_{c}/kg}.}
 
 }}
 \source{
@@ -23,28 +25,44 @@ Demétrio, C. G. B., & Zocchi, S. S. (2011). Modelos de
     Regressão. Piracicaba: ESALQ. (Tabela 1.5 pág. 12)
 }
 \description{
-O experimento foi realizado em quatro blocos, sendo 
- planejado para estudar o efeito da calagem sobre a CTC 
- (Capacidade de troca catiônica) do solo medida por dois métodos 
- diferentes.
-
- Os valores foram medidos 18 meses após a calagem incorporada ao
- solo, segundo a dose de calcário, medida em tonelados por hectare 
- (t/ha).
+O experimento foi realizado em quatro blocos, sendo
+    planejado para estudar o efeito da calagem sobre a CTC
+    (Capacidade de Troca Catiônica) do solo medida por dois métodos
+    diferentes. Os valores de CTC foram medidos 18 meses após a
+    calagem incorporada ao solo, na profundidade de 5 a 10 cm, segundo
+    a dose de calcário.
+}
+\details{
+Na análise inicial do estudo do estudo foi detectada a
+    presença de um dado discrepante (177,00) correspondente ao
+    \code{bloco} I, \code{dose} 7,80 e \code{metodo} indireto. Em
+    conversa com o pesquisador verificou-se que se tratava de um erro
+    na transcrição dos dados e que o valor correto seria
+    124,00. Neste conjunto de dados mante-ve o valor discrepante para
+    efeitos didáticos.
 }
 \examples{
 
 library(lattice)
 
-data(DemetrioTb1.5)
+xyplot(ctc ~ dose | bloco, groups = metodo,
+       data = DemetrioTb1.5,
+       main = "Dose VS CTC",
+       xlab = "Dose", ylab = "CTC",
+       type = c("p", "r"),
+       auto.key = list(space = "right", title = "Método"))
+
+# Corrigindo dado, conforme erro verificado pelo pesquisador
+select <- with(DemetrioTb1.5, bloco == 1 & dose == 7.8 & metodo == 0)
+DemetrioTb1.5$ctc[select] <- 124
 
-xyplot(ctc ~ dose, data = DemetrioTb1.5,
-    main = "Dose VS CTC",
-    xlab = "Dose",
-    ylab = "CTC",
-    type = c("p", "r"), col.line = 3)
+xyplot(ctc ~ dose | bloco, groups  = metodo,
+       data = DemetrioTb1.5,
+       main = "Dose VS CTC",
+       xlab = "Dose", ylab = "CTC",
+       type = c("p","r"),
+       auto.key = list(space = "right", title = "Método"))
 
 }
-\keyword{CTC}
-\keyword{solo}
+\keyword{TODO}
 
-- 
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