From 8ece3ddc0d81cb73456d79552c68c609c49e6719 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Jhenifer <jhenicaet@gmail.com>
Date: Tue, 15 Mar 2016 17:46:26 -0300
Subject: [PATCH] =?UTF-8?q?Modifica=20documenta=C3=A7=C3=A3o=20conforme=20?=
=?UTF-8?q?solicitado=20no=20MR?=
MIME-Version: 1.0
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8
Content-Transfer-Encoding: 8bit
---
R/RamalhoEx3.1.R | 7 +++---
R/RamalhoTb1.2.R | 4 ++--
R/RamalhoTb3.1.R | 6 ++---
R/RamalhoTb3.4.R | 22 ++++++++++--------
R/RamalhoTb3.6.R | 8 +++----
data-raw/RamalhoEx3.1.txt | 46 +++++++++++++++++++++-----------------
data/RamalhoEx3.1.rda | Bin 258 -> 261 bytes
man/RamalhoEx1.7.Rd | 4 +++-
man/RamalhoEx3.1.Rd | 11 +++++----
man/RamalhoTb1.2.Rd | 8 ++++---
man/RamalhoTb3.1.Rd | 10 +++++----
man/RamalhoTb3.4.Rd | 26 ++++++++++++---------
man/RamalhoTb3.6.Rd | 12 +++++-----
13 files changed, 95 insertions(+), 69 deletions(-)
diff --git a/R/RamalhoEx3.1.R b/R/RamalhoEx3.1.R
index 523ea0f..257db97 100644
--- a/R/RamalhoEx3.1.R
+++ b/R/RamalhoEx3.1.R
@@ -7,11 +7,12 @@
#'
#' \describe{
#'
-#' \item{fugic}{Tipo de fungicida aplicado.}
+#' \item{\code{fugic}}{Fator que indica o tipo de tratamento aplicado.
+#' Fungicida (A, B, C, D, E) ou controle (Fc).}
#'
-#' \item{rept}{Repetições de inoculação do fungicida.}
+#' \item{\code{rept}}{Repetições de inoculação do fungicida.}
#'
-#' \item{plant}{Número de plantas de milho observadas.}
+#' \item{\code{plant}}{Número de plantas de milho observadas.}
#'
#' }
#' @keywords contagem
diff --git a/R/RamalhoTb1.2.R b/R/RamalhoTb1.2.R
index 23667c6..57eb31f 100644
--- a/R/RamalhoTb1.2.R
+++ b/R/RamalhoTb1.2.R
@@ -6,9 +6,9 @@
#'
#' \describe{
#'
-#' \item{varied}{Fator de níveis nominais das variedades de milho.}
+#' \item{\code{varied}}{Fator de níveis nominais das variedades de milho.}
#'
-#' \item{prod}{Produtividade média de espiga (ton ha\eqn{^{-1}}).}
+#' \item{\code{prod}}{Produtividade média de espiga (ton ha\eqn{^{-1}}).}
#'
#' }
#' @keywords ASS
diff --git a/R/RamalhoTb3.1.R b/R/RamalhoTb3.1.R
index 5407cc8..6f96f47 100644
--- a/R/RamalhoTb3.1.R
+++ b/R/RamalhoTb3.1.R
@@ -7,11 +7,11 @@
#'
#' \describe{
#'
-#' \item{dias}{Idade de inoculação, tratamento.}
+#' \item{\code{dias}}{Idade de inoculação, tratamento.}
#'
-#' \item{rept}{Número que indica as repetições de cada tratamento.}
+#' \item{\code{rept}}{Número que indica as repetições de cada tratamento.}
#'
-#' \item{nemat}{Número de nematóides por vaso coletado.}
+#' \item{\code{nemat}}{Número de nematóides por vaso coletado.}
#'
#' }
#' @keywords DIC contagem
diff --git a/R/RamalhoTb3.4.R b/R/RamalhoTb3.4.R
index 3921b2d..801f61e 100644
--- a/R/RamalhoTb3.4.R
+++ b/R/RamalhoTb3.4.R
@@ -1,21 +1,25 @@
#' @name RamalhoTb3.4
#' @title Incidênica de \emph{Colletotrichum} no feijoeiro
-#' @description Neste experimento foram avaliados 16 tratamentos com 3
-#' observações em blocos casualizados referentes a incidência de
-#' Colletotrichum no feijoeiro, as notas foram dadas por 3
-#' avaliadores.
+#' @description Experimento para verificar a incidência de patógenos do
+#' tipo \emph{Colletotrichum} nas cultivares de feijão, foi utilizada
+#' uma escala de notas variando de 1 (resistente) a 5 (completamente
+#' suscetível), estas notas foram dadas por três avaliadores. Neste
+#' experimento foram avaliados 16 tratamentos com 3 repetições em
+#' blocos casualizados.
#' @format data.frame com 48 observações e 4 variáveis, em que
#'
#' \describe{
#'
-#' \item{trat}{Tratamento.}
+#' \item{\code{trat}}{Fator de níveis numéricos. Tratamento aplicado
+#' para verificar a incidência de \emph{Colletotrichum}.}
#'
-#' \item{bloc}{Blocos onde são aplicados os tratamentos.}
+#' \item{\code{bloc}}{Fator de 3 níveis quantitativos, usado para
+#' controle local}
#'
-#' \item{cult}{Cultivar de feijão.}
+#' \item{\code{cult}}{Cultivar de feijão.}
#'
-#' \item{nota}{Variável reposta que é a nota atribuída pelos avaliadores
-#' para a incidência e \emph{Colletotrichum}.}
+#' \item{\code{nota}}{Variável reposta, nota atribuída pelos avaliadores
+#' para a incidência de \emph{Colletotrichum}.}
#'
#' }
#' @keywords DBC
diff --git a/R/RamalhoTb3.6.R b/R/RamalhoTb3.6.R
index d9bd824..6623da2 100644
--- a/R/RamalhoTb3.6.R
+++ b/R/RamalhoTb3.6.R
@@ -6,14 +6,14 @@
#'
#' \describe{
#'
-#' \item{amostra}{Número identificador da amostra.}
+#' \item{\code{amostra}}{Número identificador da amostra.}
#'
-#' \item{isol}{Isolados do fungo (A, B e C).}
+#' \item{\code{isol}}{Isolados do fungo (A, B e C).}
#'
-#' \item{larg}{Largura dos ascos dos isolados (TODO unidade de medida).}
+#' \item{\code{larg}}{Largura dos ascos dos isolados.}
#'
#' }
-#' @keywords TODO
+#' @keywords DBC
#' @source Ramalho, M. A. P., Ferreira, D. F., Oliveira, A. C. (2005).
#' Experimentação em Genética e Melhoramento de Plantas (2th ed.).
#' Lavras: UFLA. (pg 48)
diff --git a/data-raw/RamalhoEx3.1.txt b/data-raw/RamalhoEx3.1.txt
index 3c0ef43..99b0833 100644
--- a/data-raw/RamalhoEx3.1.txt
+++ b/data-raw/RamalhoEx3.1.txt
@@ -1,21 +1,25 @@
-repet fungic plant contr
-1 A 8 1
-2 A 8 1
-3 A 9 2
-4 A 7 1
-1 B 16 1
-2 B 19 1
-3 B 24 2
-4 B 24 1
-1 C 14 1
-2 C 16 1
-3 C 14 2
-4 C 13 1
-1 D 10 1
-2 D 11 1
-3 D 2 2
-4 D 8 1
-1 E 8 1
-2 E 8 1
-3 E 3 2
-4 E 3 1
+repet fungic plant
+1 A 8
+2 A 8
+3 A 9
+4 A 7
+1 B 16
+2 B 19
+3 B 24
+4 B 24
+1 C 14
+2 C 16
+3 C 14
+4 C 13
+1 D 10
+2 D 11
+3 D 2
+4 D 8
+1 E 8
+2 E 8
+3 E 3
+4 E 3
+1 Fc 1
+2 Fc 1
+3 Fc 2
+4 Fc 1
diff --git a/data/RamalhoEx3.1.rda b/data/RamalhoEx3.1.rda
index cb52abd3951d203e3fd1c4b7240faabbccfd33b4..b2000c8810894b40a1443f0e50dd28000253e33b 100644
GIT binary patch
literal 261
zcmZ>Y%CIzaj8qGbe6vUG0RyA_|AYVkdpIyKS}@o%2sr3Jzkk4ifx&@+aRb8*$5oY@
z%lxm*Tfob>z&LP0RsW?diHytzYz@o~3`SBcT|Sdd1k~Jm7?~YRs%9pNEmZMLNiI`z
z5f;7fE?fSn;ljPB7b2HsPc0~486YYe%hb7BeqVO|@|X>&mQPLn{O72*O;jw)I`7ag
z_tviPPl8HDg2XJ5?fDOnPi@`Y+M~u9*K#YvDI=42Vp7<)3ll2sd<By@TBd&6dD*Q&
zSM~6w>ltTXe<}=E_&)s7l`e^$R<G4I34NN@&B1wF%-v6O{o5rEE4`Ic6Ccl=AseDS
T=`j1B*png;ot!s)nB4#Xqx5gk
literal 258
zcmZ>Y%CIzaj8qGbym^iBG6SP={lWkLeH<7VEg0+=1RV6A-#_5Mz`(-5xPjr;gshC^
zi={d)`#3vDO7XH?xz#2mmBF}x;Q|9sTcc7(vswcK0|SHDBEe>lqL$EU=2ogA!mc6_
zlalr@@pi4+GF@n?Q!j&?@<c^nb<xi=AC<T=30~ODq`CLtg%u1;J>^LgSM%`+`CVv?
zO<1{6vn2ECx_tlE4%gNYE)CyhD$LFTH?2M9Zc}9YzIBn?1da)P)00aI46G-={&?Nx
z`-5Be<m~J#7P%c<DY5mdNY|fz+}0dy-mIC;nrE)LPMT_4A#!}Kr>U{>?x^2_Sx)uc
PJC){Wc;vihc-a5|fK+7+
diff --git a/man/RamalhoEx1.7.Rd b/man/RamalhoEx1.7.Rd
index 51c7d85..3a77972 100644
--- a/man/RamalhoEx1.7.Rd
+++ b/man/RamalhoEx1.7.Rd
@@ -1,4 +1,4 @@
-% Generated by roxygen2 (4.1.1): do not edit by hand
+% Generated by roxygen2: do not edit by hand
% Please edit documentation in R/RamalhoEx1.7.R
\name{RamalhoEx1.7}
\alias{RamalhoEx1.7}
@@ -19,6 +19,7 @@ Amostra da altura média, medida aos 17 meses de vida, de
Gerais.
}
\examples{
+
hist(RamalhoEx1.7,
labels = TRUE,
xlim = c(4.5, 7),
@@ -27,6 +28,7 @@ hist(RamalhoEx1.7,
ylab = "Frequência absoluta",
xlab = "Altura (m)")
rug(RamalhoEx1.7)
+
}
\keyword{AAS}
diff --git a/man/RamalhoEx3.1.Rd b/man/RamalhoEx3.1.Rd
index 68ce4ea..99bd4a1 100644
--- a/man/RamalhoEx3.1.Rd
+++ b/man/RamalhoEx3.1.Rd
@@ -1,4 +1,4 @@
-% Generated by roxygen2 (4.1.1): do not edit by hand
+% Generated by roxygen2: do not edit by hand
% Please edit documentation in R/RamalhoEx3.1.R
\name{RamalhoEx3.1}
\alias{RamalhoEx3.1}
@@ -7,11 +7,12 @@
\describe{
-\item{fugic}{Tipo de fungicida aplicado.}
+\item{\code{fugic}}{Fator que indica o tipo de tratamento aplicado.
+ Fungicida (A, B, C, D, E) ou controle (Fc).}
-\item{rept}{Repetições de inoculação do fungicida.}
+\item{\code{rept}}{Repetições de inoculação do fungicida.}
-\item{plant}{Número de plantas de milho observadas.}
+\item{\code{plant}}{Número de plantas de milho observadas.}
}}
\source{
@@ -25,6 +26,7 @@ Experimento referente ao número de plantas de milho,
avaliação de fungicidas para tratamento de sementes.
}
\examples{
+
library(lattice)
data(RamalhoEx3.1)
@@ -32,6 +34,7 @@ data(RamalhoEx3.1)
xyplot(jitter(plant) ~ fungic, data = RamalhoEx3.1,
groups = repet, auto.key = TRUE,
xlab = "Fungicida", ylab = "Número de plantas")
+
}
\keyword{contagem}
diff --git a/man/RamalhoTb1.2.Rd b/man/RamalhoTb1.2.Rd
index 9a36893..d3ffe8b 100644
--- a/man/RamalhoTb1.2.Rd
+++ b/man/RamalhoTb1.2.Rd
@@ -1,4 +1,4 @@
-% Generated by roxygen2 (4.1.1): do not edit by hand
+% Generated by roxygen2: do not edit by hand
% Please edit documentation in R/RamalhoTb1.2.R
\name{RamalhoTb1.2}
\alias{RamalhoTb1.2}
@@ -7,9 +7,9 @@
\describe{
-\item{varied}{Fator de níveis nominais das variedades de milho.}
+\item{\code{varied}}{Fator de níveis nominais das variedades de milho.}
-\item{prod}{Produtividade média de espiga (ton ha\eqn{^{-1}}).}
+\item{\code{prod}}{Produtividade média de espiga (ton ha\eqn{^{-1}}).}
}}
\source{
@@ -22,6 +22,7 @@ Experimento da produtividade média de espigas de milho
de diversas cultivares obtidas por Ferreira et al (1995).
}
\examples{
+
bk <- c(2.5, 4.25, 6, 7.75, 9.5)
ht <- hist(RamalhoTb1.2$prod,
xlab = expression("Produtividade"~(ton~ha^{-1})),
@@ -38,6 +39,7 @@ plot(ecdf(RamalhoTb1.2$prod),
xlab = expression("Produtividade"~(ton~ha^{-1})),
ylab = "Frequência relativa acumulada",
main = NULL)
+
}
\keyword{ASS}
diff --git a/man/RamalhoTb3.1.Rd b/man/RamalhoTb3.1.Rd
index 98da94f..5e27edd 100644
--- a/man/RamalhoTb3.1.Rd
+++ b/man/RamalhoTb3.1.Rd
@@ -1,4 +1,4 @@
-% Generated by roxygen2 (4.1.1): do not edit by hand
+% Generated by roxygen2: do not edit by hand
% Please edit documentation in R/RamalhoTb3.1.R
\name{RamalhoTb3.1}
\alias{RamalhoTb3.1}
@@ -7,11 +7,11 @@
\describe{
-\item{dias}{Idade de inoculação, tratamento.}
+\item{\code{dias}}{Idade de inoculação, tratamento.}
-\item{rept}{Número que indica as repetições de cada tratamento.}
+\item{\code{rept}}{Número que indica as repetições de cada tratamento.}
-\item{nemat}{Número de nematóides por vaso coletado.}
+\item{\code{nemat}}{Número de nematóides por vaso coletado.}
}}
\source{
@@ -25,6 +25,7 @@ Experimento do número de nematóides (vermes que estão
diferentes idades de inoculação, experimento com 4 repetições.
}
\examples{
+
library(lattice)
data(RamalhoTb3.1)
@@ -60,6 +61,7 @@ xyplot(nemat ~ dias, data = RamalhoTb3.1,
scales = list(y = list(log = TRUE)),
ylab = "Número de nematóides",
xlab = "Tempo (dias)")
+
}
\keyword{DIC}
\keyword{contagem}
diff --git a/man/RamalhoTb3.4.Rd b/man/RamalhoTb3.4.Rd
index c7727ea..81e30a2 100644
--- a/man/RamalhoTb3.4.Rd
+++ b/man/RamalhoTb3.4.Rd
@@ -1,4 +1,4 @@
-% Generated by roxygen2 (4.1.1): do not edit by hand
+% Generated by roxygen2: do not edit by hand
% Please edit documentation in R/RamalhoTb3.4.R
\name{RamalhoTb3.4}
\alias{RamalhoTb3.4}
@@ -7,14 +7,16 @@
\describe{
-\item{trat}{Tratamento.}
+\item{\code{trat}}{Fator de níveis numéricos. Tratamento aplicado
+para verificar a incidência de \emph{Colletotrichum}.}
-\item{bloc}{Blocos onde são aplicados os tratamentos.}
+\item{\code{bloc}}{Fator de 3 níveis quantitativos, usado para
+controle local}
-\item{cult}{Cultivar de feijão.}
+\item{\code{cult}}{Cultivar de feijão.}
-\item{nota}{Variável reposta que é a nota atribuída pelos avaliadores
- para a incidência e \emph{Colletotrichum}.}
+\item{\code{nota}}{Variável reposta, nota atribuída pelos avaliadores
+ para a incidência de \emph{Colletotrichum}.}
}}
\source{
@@ -23,12 +25,15 @@ Ramalho, M. A. P., Ferreira, D. F., Oliveira, A. C. (2005).
Lavras: UFLA. (pg 45)
}
\description{
-Neste experimento foram avaliados 16 tratamentos com 3
- observações em blocos casualizados referentes a incidência de
- Colletotrichum no feijoeiro, as notas foram dadas por 3
- avaliadores.
+Experimento para verificar a incidência de patógenos do
+ tipo \emph{Colletotrichum} nas cultivares de feijão, foi utilizada
+ uma escala de notas variando de 1 (resistente) a 5 (completamente
+ suscetível), estas notas foram dadas por três avaliadores. Neste
+ experimento foram avaliados 16 tratamentos com 3 repetições em
+ blocos casualizados.
}
\examples{
+
library(lattice)
data(RamalhoTb3.1)
@@ -37,6 +42,7 @@ xyplot(nota ~ cult, data = RamalhoTb3.4,
groups = bloc, auto.key = TRUE, jitter.x = TRUE,
xlab = "Cultivares",
ylab = "Notas")
+
}
\keyword{DBC}
diff --git a/man/RamalhoTb3.6.Rd b/man/RamalhoTb3.6.Rd
index 4056a3b..e608689 100644
--- a/man/RamalhoTb3.6.Rd
+++ b/man/RamalhoTb3.6.Rd
@@ -1,4 +1,4 @@
-% Generated by roxygen2 (4.1.1): do not edit by hand
+% Generated by roxygen2: do not edit by hand
% Please edit documentation in R/RamalhoTb3.6.R
\name{RamalhoTb3.6}
\alias{RamalhoTb3.6}
@@ -7,11 +7,11 @@
\describe{
-\item{amostra}{Número identificador da amostra.}
+\item{\code{amostra}}{Número identificador da amostra.}
-\item{isol}{Isolados do fungo (A, B e C).}
+\item{\code{isol}}{Isolados do fungo (A, B e C).}
-\item{larg}{Largura dos ascos dos isolados (TODO unidade de medida).}
+\item{\code{larg}}{Largura dos ascos dos isolados.}
}}
\source{
@@ -24,10 +24,12 @@ Experimento referente a largura dos ascos de três
isolados do fungo \emph{Colletotrichum lindemuthianum}.
}
\examples{
+
data(RamalhoTb3.6)
aggregate(larg ~ isol, data = RamalhoTb3.6,
FUN = function(x) { c(mean = mean(x), var = var(x)) })
+
}
-\keyword{TODO}
+\keyword{DBC}
--
GitLab