diff --git a/R/nematoide.R b/R/nematoide.R index 1a5ba0161d16c4aada7c0cb2682cb022e972396a..661bf0a58372d523151c1403aaebc51bf3c73845 100644 --- a/R/nematoide.R +++ b/R/nematoide.R @@ -38,3 +38,30 @@ #' O nome das cultivares, a espécie do nematóide e outras informações #' não foram dadas para preservar a originalidade da Pesquisa. #' @examples +#' +#' m0 <- glm(nema ~ offset(log(off)) + cult, +#' data = nematoide, +#' family = poisson) +#' +#' # Diagnóstico. +#' par(mfrow = c(2, 2)) +#' plot(m0); layout(1) +#' +#' # Estimativas dos parâmetros. +#' summary(m0) +#' +#' # Quadro de deviance. +#' anova(m0, test = "Chisq") +#' +#' library(bbmle) +#' +#' # Poisson Generalizada. +#' m1 <- pgnz(formula(m0), data = nematoide) +#' +#' # Diferença de deviance. +#' 2 * diff(c(logLik(m0), logLik(m1))) +#' +#' # Estimativas dos parâmetros. +#' summary(m1) +#' +NULL diff --git a/man/nematoide.Rd b/man/nematoide.Rd new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f789c7c54ed0b7ea889b80df7c7b8ab54b6e8167 --- /dev/null +++ b/man/nematoide.Rd @@ -0,0 +1,75 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/nematoide.R +\name{nematoide} +\alias{nematoide} +\title{Número de Nematóides em Raízes de Feijoeiro} +\format{Um \code{data.frame} com 94 observações e 4 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{cult}}{Fator categórico que indica a linhagem de + feijoeiro semeada em vasos com solo contaminado com nematóide.} + +\item{\code{mfr}}{Massa fresca de raízes (g) produzida por parcela + (duas plantas) que foi lavada, triturada, peneirada e diluída + para fazer a contagem dos nematóides.} + +\item{\code{vol}}{Volume (ml) usado para diluir a massa fresca de + raízes. Esse volume foi agitado para homogeneização e depois uma + alíquota de 1 ml foi extraída e colocada em uma lâmina de + contagem.} + +\item{\code{nema}}{Número de nematóides na alíquota de 1 ml, + determinado por contagem direta na lâmina.} + +\item{\code{off}}{É o offset da contagem, o equivalente em massa de + fresca de raízes de uma aliquota de 1 ml, ou seja, é + \code{off = mfr/vol}.} + +}} +\source{ +Cedido para fins acadêmicos por Andressa Cristina Zamboni + Machado, pesquisadora do Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR), + e pelo técnico agrícola do IAPAR Santino Aleandro da Silva. + +O nome das cultivares, a espécie do nematóide e outras informações + não foram dadas para preservar a originalidade da Pesquisa. +} +\description{ +Resultados de um experimento em casa de vegetação que + estudou a reprodução de nematóides em cultivares/linhagens de + feijoeiro. O solo dos vasos foi inicialmente contaminado com + namatóides e as parcelas tiveram duas plantas. Ao final do + experimento, as raízes das duas plantas por parcela foram + lavadas, trituradas, peneiradas e diluídas para fazer a contagem + dos nematóides em aliquotas dessa solução. +} +\examples{ + +m0 <- glm(nema ~ offset(log(off)) + cult, + data = nematoide, + family = poisson) + +# Diagnóstico. +par(mfrow = c(2, 2)) +plot(m0); layout(1) + +# Estimativas dos parâmetros. +summary(m0) + +# Quadro de deviance. +anova(m0, test = "Chisq") + +library(bbmle) + +# Poisson Generalizada. +m1 <- pgnz(formula(m0), data = nematoide) + +# Diferença de deviance. +2 * diff(c(logLik(m0), logLik(m1))) + +# Estimativas dos parâmetros. +summary(m1) + +} +