diff --git a/R/PaulinoTb10.4.R b/R/PaulinoTb10.4.R new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ef0335c9ba8cc2bda1ae5d338902672ce91abd51 --- /dev/null +++ b/R/PaulinoTb10.4.R @@ -0,0 +1,51 @@ +#' @name PaulinoTb10.4 +#' @title Suscetibilidade à Síndrome de Malária Celebral +#' @description Estudo de genética experimental cujo objetivo é mapear +#' a suscetibilidade à síndrome de malária celebral (SMC) em +#' camundongos. Para a realização do estudo, foram considerados os +#' genótipos em dois loci, identificados como relevantes para o +#' fenótipo (doença) em causas em animais de progenia F2 resultantes +#' do retrocruzamento da progenia F1 (obtida por cruzamento entre +#' uma estripe suscetível (s) e outra resistente (r)) com os seus +#' progenitores da estripe suscetível. +#' @format Um \code{data.frame} com 8 observações e 4 variáveis, em que +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{locus1}}{Genótipos localizados no locus 1.} +#' +#' \item{\code{locus2}}{Genótipos no locus 2.} +#' +#' \item{\code{smc}}{Suscetibilidade ao SMC (suscetíveis, resistentes).} +#' +#' \item{\code{freq}}{Número de camundongos.} +#' +#' } +#' @keywords TC binomial +#' @source PAULINO; SINGER (2006), Tabela 10.4, pág. 361. +#' @examples +#' +#' data(PaulinoTb10.4) +#' +#' str(PaulinoTb10.4) +#' +#' xt <- xtabs(freq ~ ., data = PaulinoTb10.4) +#' ftable(xt) +#' +#' library(lattice) +#' +#' barchart(freq ~ locus1 | locus2, groups = smc, +#' data = PaulinoTb10.4, +#' horizontal = FALSE, +#' beside = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' auto.key = list(space = "top", columns = 2, cex.title = 1, +#' rectangles = TRUE, points = FALSE, +#' title = "SMC"), +#' xlab = "Locus1", +#' ylab = "Frequências", +#' strip = strip.custom( +#' strip.names = TRUE, +#' var.name = "Locus2")) +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/PaulinoTb10.4.txt b/data-raw/PaulinoTb10.4.txt new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..622259968c98a488ebde1b3385183fb42140d897 --- /dev/null +++ b/data-raw/PaulinoTb10.4.txt @@ -0,0 +1,9 @@ +locus1 locus2 smc freq +s1s1 s2s2 suscetiveis 35 +s1s1 s2s2 resistentes 10 +s1s1 s2r2 suscetiveis 25 +s1s1 s2r2 resistentes 23 +s1r1 s2s2 suscetiveis 27 +s1r1 s2s2 resistentes 21 +s1r1 s2r2 suscetiveis 9 +s1r1 s2r2 resistentes 40 diff --git a/data/PaulinoTb10.4.rda b/data/PaulinoTb10.4.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..872cde8a9052b36385e548d09daf946008ec5e01 Binary files /dev/null and b/data/PaulinoTb10.4.rda differ diff --git a/man/PaulinoTb10.4.Rd b/man/PaulinoTb10.4.Rd new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..81914c1bdcf522bc129cbe87cc92263169ded8b1 --- /dev/null +++ b/man/PaulinoTb10.4.Rd @@ -0,0 +1,60 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/PaulinoTb10.4.R +\name{PaulinoTb10.4} +\alias{PaulinoTb10.4} +\title{Suscetibilidade à Síndrome de Malária Celebral} +\format{Um \code{data.frame} com 8 observações e 4 variáveis, em que + +\describe{ + +\item{\code{locus1}}{Genótipos localizados no locus 1.} + +\item{\code{locus2}}{Genótipos no locus 2.} + +\item{\code{smc}}{Suscetibilidade ao SMC (suscetíveis, resistentes).} + +\item{\code{freq}}{Número de camundongos.} + +}} +\source{ +PAULINO; SINGER (2006), Tabela 10.4, pág. 361. +} +\description{ +Estudo de genética experimental cujo objetivo é mapear + a suscetibilidade à síndrome de malária celebral (SMC) em + camundongos. Para a realização do estudo, foram considerados os + genótipos em dois loci, identificados como relevantes para o + fenótipo (doença) em causas em animais de progenia F2 resultantes + do retrocruzamento da progenia F1 (obtida por cruzamento entre + uma estripe suscetível (s) e outra resistente (r)) com os seus + progenitores da estripe suscetível. +} +\examples{ + +data(PaulinoTb10.4) + +str(PaulinoTb10.4) + +xt <- xtabs(freq ~ ., data = PaulinoTb10.4) +ftable(xt) + +library(lattice) + +barchart(freq ~ locus1 | locus2, groups = smc, + data = PaulinoTb10.4, + horizontal = FALSE, + beside = FALSE, + stack = FALSE, + auto.key = list(space = "top", columns = 2, cex.title = 1, + rectangles = TRUE, points = FALSE, + title = "SMC"), + xlab = "Locus1", + ylab = "Frequências", + strip = strip.custom( + strip.names = TRUE, + var.name = "Locus2")) + +} +\keyword{TC} +\keyword{binomial} +