From 8c496fd52f6c498ac8cd2e89e7c25c0c5e6f4431 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Fri, 2 Sep 2016 16:19:04 -0300 Subject: [PATCH 01/14] Adiciona tabela do exercicio 19 --- R/SoaresEx19.R | 49 ++++++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/SoaresEx19.txt | 5 ++++ data/SoaresEx19.rda | Bin 0 -> 217 bytes man/SoaresEx19.Rd | 57 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 4 files changed, 111 insertions(+) create mode 100644 R/SoaresEx19.R create mode 100644 data-raw/SoaresEx19.txt create mode 100644 data/SoaresEx19.rda create mode 100644 man/SoaresEx19.Rd diff --git a/R/SoaresEx19.R b/R/SoaresEx19.R new file mode 100644 index 00000000..a32c9f7d --- /dev/null +++ b/R/SoaresEx19.R @@ -0,0 +1,49 @@ +#' @name SoaresEx19 +#' @title Eficácia do exame clínico neurológico +#' @description A hemorragia peri-intraventricular (HPIV) é uma das +#' causas mais frequentes de agressão ao sistema nervoso central no +#' período de neonatal e a segunda causa mais frequente de morte em +#' prematuros. Atualmente, o método de escolha para diagnóstico +#' consiste em técnicas não invasivas (ultra-sonografia e tomografia +#' computacionalizada). Tavares (1995) estudou a ocorrência desta +#' enfermidade em 120 dos 129 recém-nascidos com peso menor que +#' 2000 g, nascidos no Hospital das Clínias da UFMG, no peíodo de +#' 18/01/1994 a 17/05/1995. Para avaliar a eficácia do exame clínico +#' neurológico, as crianças foram examinadas por um pediatra clínico +#' com formação em neonatologia, sem o conhecimento prévio dos +#' exames ultrasonográficos, que confirmam ou não diagnóstico +#' fornecido pelo médico. +#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{hpiv}}{Hemorragia peri-intraventricular presente ou não.} +#' +#' \item{\code{ex}}{Exame neurológico alterado ou normal.} +#' +#' \item{ef}{Eficiência do exame.} +#' +#' } +#' @keywords AAS +#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e +#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. +#' Ex 19, pg 128. +#' @examples +#' +#' library(lattice) +#' data(SoaresEx19) +#' +#' a <- xtabs(ef ~ hpiv + ex, data = SoaresEx19) +#' barchart(a, horizontal = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' scales=list(x=list(labels=c("Ausente","Presente"))), +#' ylab = "Frequência", +#' xlab = "HPIV", +#' main = "Eficácia do exame clínico neurológico", +#' auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), +#' text = c("Exame Neurológico Alterado", +#' 'Exame Neurológico Normal'))) +#' +#' +#' +NULL diff --git a/data-raw/SoaresEx19.txt b/data-raw/SoaresEx19.txt new file mode 100644 index 00000000..93ab5f99 --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresEx19.txt @@ -0,0 +1,5 @@ +hpiv ex ef +p a 25 +p n 13 +a a 31 +a n 50 diff --git a/data/SoaresEx19.rda b/data/SoaresEx19.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..ccbd78e3e2e67ea7319057f55eb6b8c2e94b8a5e GIT binary patch literal 217 zcmZ>Y%CIzaj8qGb+}5D<gMneg{{#PxJQNxj4HVcIBpme9?;dbqU|`+Auq|P#^F=jb zUulh$iyapZzT)-eNMT@LV8~DjwfAUTaDmO?vcm~kl_tI>Lk;GID%+YJuTLn}Rb#GS zn8YDadE#fH=9G?*O~&~XRX?|#RyE(9$gnJFGUGJ)eHSf+JF`6vL=1H}a!n*6c|5{) zNis8T3Z1EZSn6)!r-@nG6}vOP9(jH5MCX$9{%3KuS;sy$-m%R3)b{4_nw{rU19>z> YRa)bhF?MvQJ$mP{oJ&aT0!ust0HwHBRR910 literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/SoaresEx19.Rd b/man/SoaresEx19.Rd new file mode 100644 index 00000000..2d068d7f --- /dev/null +++ b/man/SoaresEx19.Rd @@ -0,0 +1,57 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/SoaresEx19.R +\name{SoaresEx19} +\alias{SoaresEx19} +\title{Eficácia do exame clínico neurológico} +\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{hpiv}}{Hemorragia peri-intraventricular presente ou não.} + +\item{\code{ex}}{Exame neurológico alterado ou normal.} + +\item{ef}{Eficiência do exame.} + +}} +\source{ +Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e + Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. + Ex 19, pg 128. +} +\description{ +A hemorragia peri-intraventricular (HPIV) é uma das + causas mais frequentes de agressão ao sistema nervoso central no + período de neonatal e a segunda causa mais frequente de morte em + prematuros. Atualmente, o método de escolha para diagnóstico + consiste em técnicas não invasivas (ultra-sonografia e tomografia + computacionalizada). Tavares (1995) estudou a ocorrência desta + enfermidade em 120 dos 129 recém-nascidos com peso menor que + 2000 g, nascidos no Hospital das Clínias da UFMG, no peíodo de + 18/01/1994 a 17/05/1995. Para avaliar a eficácia do exame clínico + neurológico, as crianças foram examinadas por um pediatra clínico + com formação em neonatologia, sem o conhecimento prévio dos + exames ultrasonográficos, que confirmam ou não diagnóstico + fornecido pelo médico. +} +\examples{ + +library(lattice) +data(SoaresEx19) + +a <- xtabs(ef ~ hpiv + ex, data = SoaresEx19) +barchart(a, horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales=list(x=list(labels=c("Ausente","Presente"))), + ylab = "Frequência", + xlab = "HPIV", + main = "Eficácia do exame clínico neurológico", + auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), + text = c("Exame Neurológico Alterado", + 'Exame Neurológico Normal'))) + + + +} +\keyword{AAS} + -- GitLab From e69b3f8ba83e54f01c9162d1cd95d4d62f9824e0 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Mon, 12 Sep 2016 16:21:19 -0300 Subject: [PATCH 02/14] Adiciona description ao commit --- .RData | Bin 0 -> 5907 bytes DESCRIPTION | 2 +- data-raw/SoaresTb4.9.csv | 5 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+ multcomp VignetteBuilder: knitr RoxygenNote: 5.0.1 diff --git a/data-raw/SoaresTb4.9.csv b/data-raw/SoaresTb4.9.csv new file mode 100644 index 00000000..baaaa2f6 --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresTb4.9.csv @@ -0,0 +1,5 @@ +teste sem esp +uts 80 60 +tmg 90 90 +aobp 98 54 +aebp 72 96 diff --git a/man/labestData.Rd b/man/labestData.Rd index 24932f76..8a8c53af 100644 --- a/man/labestData.Rd +++ b/man/labestData.Rd @@ -1,4 +1,4 @@ -% Generated by roxygen2 (4.1.1): do not edit by hand +% Generated by roxygen2: do not edit by hand % Please edit documentation in R/labestData.R \docType{package} \name{labestData} -- GitLab From df79272eb3bd2bdeee839a914c77dd78153fc68d Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Mon, 12 Sep 2016 16:27:28 -0300 Subject: [PATCH 03/14] Adiciona tabela 18 ao pacote --- R/SoaresEx18.R | 40 ++++++++++++++++++++++ data-raw/SoaresEx18.txt | 7 ++++ data/SoaresEx18.rda | Bin 0 -> 256 bytes man/SoaresEx18.Rd | 74 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 4 files changed, 121 insertions(+) create mode 100644 R/SoaresEx18.R create mode 100644 data-raw/SoaresEx18.txt create mode 100644 data/SoaresEx18.rda create mode 100644 man/SoaresEx18.Rd diff --git a/R/SoaresEx18.R b/R/SoaresEx18.R new file mode 100644 index 00000000..427bee64 --- /dev/null +++ b/R/SoaresEx18.R @@ -0,0 +1,40 @@ +#' @name SoaresEx18 +#' @title Valores de creatinina fosfocinase (CFC) em 360 pacientes. +#' @description Em um hospital do coração, foram analisados os valores +#' de CFC (crestinina fosfocinase) de 360 pacientes, sendo 230 com +#' infarto agudo do miocárdio. +#' @format Um \code{data.frame} com 6 observações e 3 variáveis. +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{cfc}}{Indice dos valores de CFC.} +#' +#' \item{\code{ia}}{Infarto agudo presente ou não presente.} +#' +#' \item{exp}{Variável explicativa com os valores obtidos.} +#' +#' } +#' @keywords AAS +#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e +#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. +#' Ex 18, pg 127. +#' @examples +#' +#' library(lattice) +#' data(SoaresEx18) +#' +#' coleta <- xtabs(exp ~ cfc + ia, data = SoaresEx18) +#' barchart(coleta, horizontal = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' scales = list(x = list(labels = c("CFC < 80","CFC >= 280", +#' "80 <= CFC < 280"))), +#' ylab = "Frequência", +#' xlab = "CFC", +#' main = "Valores de creatinina fosfocinase (CFC) em 360 pacientes", +#' auto.key = list(corner = c(0.75, 0.95), +#' text = c("não", +#' 'sim'))) +#' +#' +#' +NULL diff --git a/data-raw/SoaresEx18.txt b/data-raw/SoaresEx18.txt new file mode 100644 index 00000000..2259f023 --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresEx18.txt @@ -0,0 +1,7 @@ +cfc ia exp +< 80 sim 15 +< 80 não 114 +80-279 sim 118 +80-279 não 15 +>279 sim 97 +>279 não 1 diff --git a/data/SoaresEx18.rda b/data/SoaresEx18.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..aef79019dfe543cb37ac7231c44612988a88775f GIT binary patch literal 256 zcmZ>Y%CIzaj8qGb%=a{&&A@Q1{>p!&6ATW_1y9)+BpmeB?;dbq;9%fjU=ZBEa4k(r zD|6Ybs+n@jGEI2-eSKF>_%eSbv&-d>ipg%x0vDv%9GA@w$kj@fTh_q9*1%xGq;T(= zm_tgQL&k)bzQ{sWwVABSj6Q1*-%+~ErmxTadHU%G+B^YUm$8IOh+CY!H-n+WWNO%? zmv&LvhrFX*CW*C}sT>qcSSBoSsLZjWW4+mo4oQZ*OY2v2>aGvieYBrjqV#FO-U&X= z0TG?@9>v1e%v{sl*psuB&izu;R9~;NN?JPZW6(mYbCZ`DI#kCutM`UKW?~Fb|5&aP M+{(%JWwPZ40M7Yf&Hw-a literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/SoaresEx18.Rd b/man/SoaresEx18.Rd new file mode 100644 index 00000000..4526c8ac --- /dev/null +++ b/man/SoaresEx18.Rd @@ -0,0 +1,74 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/SoaresEx18.R, R/SoaresTb4.9.R +\name{SoaresEx18} +\alias{SoaresEx18} +\title{Valores de creatinina fosfocinase (CFC) em 360 pacientes.} +\format{Um \code{data.frame} com 6 observações e 3 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{cfc}}{Indice dos valores de CFC.} + +\item{\code{ia}}{Infarto agudo presente ou não presente.} + +\item{exp}{Variável explicativa com os valores obtidos.} + +}} +\source{ +Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e + Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. + Ex 18, pg 127. + +Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e + Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. + Ex 18, pg 127. +} +\description{ +Em um hospital do coração, foram analisados os valores + de CFC (crestinina fosfocinase) de 360 pacientes, sendo 230 com + infarto agudo do miocárdio. + +Em um hospital do coração, foram analisados os valores + de CFC (crestinina fosfocinase) de 360 pacientes, sendo 230 com + infarto agudo do miocárdio. +} +\examples{ + +library(lattice) +data(SoaresEx18) + +coleta <- xtabs(exp ~ cfc + ia, data = SoaresEx18) +barchart(coleta, horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales = list(x = list(labels = c("CFC < 80","CFC >= 280", + "80 <= CFC < 280"))), + ylab = "Frequência", + xlab = "CFC", + main = "Valores de creatinina fosfocinase (CFC) em 360 pacientes", + auto.key = list(corner = c(0.75, 0.95), + text = c("não", + 'sim'))) + + + + +library(lattice) +data(SoaresEx18) + +coleta <- xtabs(exp ~ cfc + ia, data = SoaresEx18) +barchart(coleta, horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales = list(x = list(labels = c("CFC >= 280","CFC < 80", + "80 <= CFC < 280"))), + ylab = "Frequência", + xlab = "CFC", + main = "Valores de creatinina fosfocinase (CFC) em 360 pacientes", + auto.key = list(corner = c(0.75, 0.95), + text = c("não", + 'sim'))) + + + +} +\keyword{AAS} + -- GitLab From 23d8357dca3d01b7e575e553023118c53475f15c Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Mon, 12 Sep 2016 16:29:55 -0300 Subject: [PATCH 04/14] Deletar data-raw --- data-raw/SoaresTb4.9.csv | 5 ----- 1 file changed, 5 deletions(-) delete mode 100644 data-raw/SoaresTb4.9.csv diff --git a/data-raw/SoaresTb4.9.csv b/data-raw/SoaresTb4.9.csv deleted file mode 100644 index baaaa2f6..00000000 --- a/data-raw/SoaresTb4.9.csv +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -teste sem esp -uts 80 60 -tmg 90 90 -aobp 98 54 -aebp 72 96 -- GitLab From 6399d0ad98f04b5baceb34ef7ce5790e9c149275 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Mon, 12 Sep 2016 17:03:41 -0300 Subject: [PATCH 05/14] Adiciona tabela 6.1 ao pacote --- R/SoaresTb6.1.R | 49 +++++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/SoaresTb6.1.txt | 5 ++++ data/SoaresTb6.1.rda | Bin 0 -> 241 bytes man/SoaresEx18.Rd | 28 +------------------ man/SoaresTb6.1.Rd | 58 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 5 files changed, 113 insertions(+), 27 deletions(-) create mode 100644 R/SoaresTb6.1.R create mode 100644 data-raw/SoaresTb6.1.txt create mode 100644 data/SoaresTb6.1.rda create mode 100644 man/SoaresTb6.1.Rd diff --git a/R/SoaresTb6.1.R b/R/SoaresTb6.1.R new file mode 100644 index 00000000..41e9ac3b --- /dev/null +++ b/R/SoaresTb6.1.R @@ -0,0 +1,49 @@ +#' @name SoaresTb6.1 +#' @title Número de pacientes tratados com AZT ou placebo. +#' @description Em 1987, FISCHL publicou o primeiro relato de um ensaio +#' clínico que comprovou a eficácia do fármaco zidovudina (AZT) para +#' prolongar a vida de pacientes com AIDS. Na tabela é apresentado +#' os dados entre a relação dos pacientes que receberam o AZT e o +#' placebo e permaneceram vivos ou mortos durante o experimento. +#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{grp}}{Grupo de pacientes que receberam o zidozudina +#' (AZT) ou placebo.} +#' +#' \item{\code{sit}}{Situação dos pacientes com AIDS após o uso dos +#' fármacos no que diz respeito ao prolongamento de suas vidas.} +#' +#' \item{exp}{Variável explicativa dos valores obtidos.} +#' +#' } +#' @keywords AAS +#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e +#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. +#' Tb 6.1, pg 177. +#' +#' @references FISCHL, M. A., RICHMAN, D. D., GRIECO, M. H. et al. The +#' efficacy of azidothymidine (AZT) in treatment of patients with +#' AIDS and AIDS-related complez. A doubleblind, placebo-controlled +#' trial. The New England Journal of Medicine, v.317, n.4 p.185-91, +#' 1987. +#' @examples +#' +#' library(lattice) +#' data(SoaresTb6.1) +#' +#' dados <- xtabs(exp ~ grp + sit, data = SoaresTb6.1) +#' barchart(dados, horizontal = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' scales=list(x=list(labels=c("AZT","Placebo"))), +#' ylab = "Frequência", +#' xlab = "Grupo", +#' main = "Número de pacientes tratados com AZT ou placebo", +#' auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), +#' text = c("Morto", +#' 'Vivo'))) +#' +#' +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/SoaresTb6.1.txt b/data-raw/SoaresTb6.1.txt new file mode 100644 index 00000000..30a4b8da --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresTb6.1.txt @@ -0,0 +1,5 @@ +grp;sit;exp +azt;vivo;144 +azt;morto;1 +placebo;vivo;121 +placebo;morto;16 diff --git a/data/SoaresTb6.1.rda b/data/SoaresTb6.1.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7854cdb920e058bb80fa9f1c68b61e4befca437e GIT binary patch literal 241 zcmZ>Y%CIzaj8qGbjO}Il!oaZp|AYU#JQx@l4H;M%WE||5-~Hgg;K0DZx`E-wgsc9S zW>xy6+B#o$GC8^UN>%TYPl^pD7cMRqoWRQ<C7}}R68LiB5;g`mH|Hz2{FFJh+srK| zoiuv0X@_E@O8>eWC%1h#nI98d@!Uy2b@TUz8P}hFJXLo2n~+DFNW%QDQ&z1qSRBfb z>S-XF<1*n^X5fT_svoy`u`wpROzO`|pEtvLUM2S;omo7mUd?k1Jm<!>tb^O<NV4UX zxm|PC-VcAo9oH(>EzIe&&E(*U%fV_J%IEd&oABACVTp_2o!FBi51ky#OoT500I+Ur A<p2Nx literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/SoaresEx18.Rd b/man/SoaresEx18.Rd index 4526c8ac..96c058bf 100644 --- a/man/SoaresEx18.Rd +++ b/man/SoaresEx18.Rd @@ -1,5 +1,5 @@ % Generated by roxygen2: do not edit by hand -% Please edit documentation in R/SoaresEx18.R, R/SoaresTb4.9.R +% Please edit documentation in R/SoaresEx18.R \name{SoaresEx18} \alias{SoaresEx18} \title{Valores de creatinina fosfocinase (CFC) em 360 pacientes.} @@ -15,19 +15,11 @@ }} \source{ -Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e - Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. - Ex 18, pg 127. - Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. Ex 18, pg 127. } \description{ -Em um hospital do coração, foram analisados os valores - de CFC (crestinina fosfocinase) de 360 pacientes, sendo 230 com - infarto agudo do miocárdio. - Em um hospital do coração, foram analisados os valores de CFC (crestinina fosfocinase) de 360 pacientes, sendo 230 com infarto agudo do miocárdio. @@ -51,24 +43,6 @@ barchart(coleta, horizontal = FALSE, - -library(lattice) -data(SoaresEx18) - -coleta <- xtabs(exp ~ cfc + ia, data = SoaresEx18) -barchart(coleta, horizontal = FALSE, - stack = FALSE, - scales = list(x = list(labels = c("CFC >= 280","CFC < 80", - "80 <= CFC < 280"))), - ylab = "Frequência", - xlab = "CFC", - main = "Valores de creatinina fosfocinase (CFC) em 360 pacientes", - auto.key = list(corner = c(0.75, 0.95), - text = c("não", - 'sim'))) - - - } \keyword{AAS} diff --git a/man/SoaresTb6.1.Rd b/man/SoaresTb6.1.Rd new file mode 100644 index 00000000..b6bcb607 --- /dev/null +++ b/man/SoaresTb6.1.Rd @@ -0,0 +1,58 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/SoaresTb6.1.R +\name{SoaresTb6.1} +\alias{SoaresTb6.1} +\title{Número de pacientes tratados com AZT ou placebo.} +\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{grp}}{Grupo de pacientes que receberam o zidozudina + (AZT) ou placebo.} + +\item{\code{sit}}{Situação dos pacientes com AIDS após o uso dos + fármacos no que diz respeito ao prolongamento de suas vidas.} + +\item{exp}{Variável explicativa dos valores obtidos.} + +}} +\source{ +Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e + Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. + Tb 6.1, pg 177. +} +\description{ +Em 1987, FISCHL publicou o primeiro relato de um ensaio + clínico que comprovou a eficácia do fármaco zidovudina (AZT) para + prolongar a vida de pacientes com AIDS. Na tabela é apresentado + os dados entre a relação dos pacientes que receberam o AZT e o + placebo e permaneceram vivos ou mortos durante o experimento. +} +\examples{ + +library(lattice) +data(SoaresTb6.1) + +dados <- xtabs(exp ~ grp + sit, data = SoaresTb6.1) +barchart(dados, horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales=list(x=list(labels=c("AZT","Placebo"))), + ylab = "Frequência", + xlab = "Grupo", + main = "Número de pacientes tratados com AZT ou placebo", + auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), + text = c("Morto", + 'Vivo'))) + + + +} +\references{ +FISCHL, M. A., RICHMAN, D. D., GRIECO, M. H. et al. The + efficacy of azidothymidine (AZT) in treatment of patients with + AIDS and AIDS-related complez. A doubleblind, placebo-controlled + trial. The New England Journal of Medicine, v.317, n.4 p.185-91, + 1987. +} +\keyword{AAS} + -- GitLab From bc06a545dc99426a4e7d903bb8cdb32a4d004501 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Mon, 12 Sep 2016 17:24:15 -0300 Subject: [PATCH 06/14] Adiciona tabela do exercicio 17 capitulo 6 ao pacote --- R/SoaresEx6.17.R | 50 +++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/SoaresEx6.17.txt | 5 ++++ data/SoaresEx6.17.rda | Bin 0 -> 235 bytes man/SoaresEx6.17.Rd | 60 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 4 files changed, 115 insertions(+) create mode 100644 R/SoaresEx6.17.R create mode 100644 data-raw/SoaresEx6.17.txt create mode 100644 data/SoaresEx6.17.rda create mode 100644 man/SoaresEx6.17.Rd diff --git a/R/SoaresEx6.17.R b/R/SoaresEx6.17.R new file mode 100644 index 00000000..282e9689 --- /dev/null +++ b/R/SoaresEx6.17.R @@ -0,0 +1,50 @@ +#' @name SoaresEx6.17 +#' @title Relação entre a depressão e o desejo pela morte de pacientes +#' com câncer terminal. +#' @description Um estudo feito por Chochinov et al. (1995) contou com a +#' participação de 190 pacientes de dois hospitais em Winnipeg, +#' Canadá, com diagnóstico primário de câncer terminal, admitidos no +#' período de coletas de dados. Uma das preocupações era verificar a +#' existência de relação entre o desejo de morte relatado por alguns +#' deles e a depressão diagnosticada em alguns casos. +#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{dpm}}{Desejo pela morte ausente ou presente nos pacientes +#' do estudo.} +#' +#' \item{\code{dpss}}{Depressão presente ou ausente nos pacientes do +#' estudo.} +#' +#' \item{exp}{Variável explicativa entre o desejo pela morte e a +#' depressão.} +#' +#' } +#' @keywords AAS +#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e +#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. +#' Ex 17, pg 230. +#' @references CHOCHINOV, H. M., WILSON, K.G., ENNS, M. et al. Desire +#' for death in the terminal ill. The American Journal of Psychiatry, +#' v.152, p.1185-91, 1995. +#' @examples +#' +#' library(lattice) +#' data(SoaresEx6.17) +#' +#' dado <- xtabs(exp ~ dpm + dpss, data = SoaresEx6.17) +#' barchart(dado, horizontal = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' scales = list(x = list(labels = c("Ausente","Presente"))), +#' ylab = "Frequência", +#' xlab = "Depressão", +#' main = "Relação entre a depressão e o desejo pela morte de +#' pacientes com câncer terminal", +#' auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), +#' text = c("Desejo pela morte ausente", +#' 'Desejo pela morte presente'))) +#' +#' +#' +NULL diff --git a/data-raw/SoaresEx6.17.txt b/data-raw/SoaresEx6.17.txt new file mode 100644 index 00000000..caf6ddba --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresEx6.17.txt @@ -0,0 +1,5 @@ +dpm;dpss;exp +presente;presente;10 +presente;ausente;7 +ausente;presente;14 +ausente;ausente;168 diff --git a/data/SoaresEx6.17.rda b/data/SoaresEx6.17.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f8c808b10ef81ed99b0ca076d7246d78db01aff6 GIT binary patch literal 235 zcmZ>Y%CIzaj8qGb)S7+QfPrCS{e}PEJs21m4I9`PBpmeF?;mhrU~phy-N108QHv`{ zF8GQeuT;jxEzQ1N5|V5Vj2#zJjF?$ER=!y5`^xRY3<aqK;Zu&hsS-Cm>ms^-9`%ef z&@zcQC;s$Mbl$rNYyC4EXHKrWX~>&@*u}>^(m^xPP3hL>MH*2~8x?k{TykBjBycNf zvFbwAy?;!V8Ex-NznDI!JiPUMo9oUAEe3XB#{F)0rg%+=cw*Mmt+e`&rEu;A!GhCS r4fEL5OioS>TB<6fKG){ZLYG@l*2K?pI+!i~C-$VsLnnt-`6UMch?!xc literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/SoaresEx6.17.Rd b/man/SoaresEx6.17.Rd new file mode 100644 index 00000000..14be0f5f --- /dev/null +++ b/man/SoaresEx6.17.Rd @@ -0,0 +1,60 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/SoaresEx6.17.R +\name{SoaresEx6.17} +\alias{SoaresEx6.17} +\title{Relação entre a depressão e o desejo pela morte de pacientes + com câncer terminal.} +\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{dpm}}{Desejo pela morte ausente ou presente nos pacientes + do estudo.} + +\item{\code{dpss}}{Depressão presente ou ausente nos pacientes do + estudo.} + +\item{exp}{Variável explicativa entre o desejo pela morte e a + depressão.} + +}} +\source{ +Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e + Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. + Ex 17, pg 230. +} +\description{ +Um estudo feito por Chochinov et al. (1995) contou com a + participação de 190 pacientes de dois hospitais em Winnipeg, + Canadá, com diagnóstico primário de câncer terminal, admitidos no + período de coletas de dados. Uma das preocupações era verificar a + existência de relação entre o desejo de morte relatado por alguns + deles e a depressão diagnosticada em alguns casos. +} +\examples{ + +library(lattice) +data(SoaresEx6.17) + +dado <- xtabs(exp ~ dpm + dpss, data = SoaresEx6.17) +barchart(dado, horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales = list(x = list(labels = c("Ausente","Presente"))), + ylab = "Frequência", + xlab = "Depressão", + main = "Relação entre a depressão e o desejo pela morte de + pacientes com câncer terminal", + auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), + text = c("Desejo pela morte ausente", + 'Desejo pela morte presente'))) + + + +} +\references{ +CHOCHINOV, H. M., WILSON, K.G., ENNS, M. et al. Desire + for death in the terminal ill. The American Journal of Psychiatry, + v.152, p.1185-91, 1995. +} +\keyword{AAS} + -- GitLab From 6a839c0d6af17fbde852d67c035e14730a441029 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Mon, 12 Sep 2016 18:05:52 -0300 Subject: [PATCH 07/14] Adiciona tabela 6.18 ao pacote --- R/SoaresTb6.18.R | 32 ++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/SoaresTb6.18.txt | 25 ++++++++++++++++++++++++ data/SoaresTb6.18.rda | Bin 0 -> 270 bytes man/SoaresTb6.18.Rd | 40 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 4 files changed, 97 insertions(+) create mode 100644 R/SoaresTb6.18.R create mode 100644 data-raw/SoaresTb6.18.txt create mode 100644 data/SoaresTb6.18.rda create mode 100644 man/SoaresTb6.18.Rd diff --git a/R/SoaresTb6.18.R b/R/SoaresTb6.18.R new file mode 100644 index 00000000..973e7c65 --- /dev/null +++ b/R/SoaresTb6.18.R @@ -0,0 +1,32 @@ +#' @name SoaresTb6.18 +#' @title Níveis de colesterol no início e no final do programa. +#' @description O presente estudo teve como objetivo avaliar a +#' efetividade de uma dieta combinada com um programa de exercícios +#' físicos na redução dos níveis de colesterol. Foram registrados os +#' níveis de colesterol no início e no final do programa de 12 +#' participantes. +#' @format Um \code{data.frame} com 24 observações e 2 variáveis. +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{prg}}{Expecificação do programa: início e final.} +#' +#' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} +#' +#' } +#' @keywords AAS +#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e +#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. +#' Tb 6.18, pg 203. +#' @examples +#' +#' library(lattice) +#' data(SoaresTb6.18) +#' SoaresTb6.18$n <- seq(1:12) +#' xyplot(exp~n|prg, data = SoaresTb6.18, +#' xlab = 'Indivíduos que participaram do programa', +#' ylab = 'Níveis de colesterol') +#' +#' +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/SoaresTb6.18.txt b/data-raw/SoaresTb6.18.txt new file mode 100644 index 00000000..7ce23b96 --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresTb6.18.txt @@ -0,0 +1,25 @@ +prg exp +início 201 +início 231 +início 221 +início 260 +início 228 +início 237 +início 326 +início 235 +início 240 +início 267 +início 284 +início 201 +final 200 +final 236 +final 216 +final 233 +final 224 +final 216 +final 296 +final 195 +final 207 +final 247 +final 210 +final 209 diff --git a/data/SoaresTb6.18.rda b/data/SoaresTb6.18.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..0cb2369dff5d0a3464d87c612212ef6e4f1ebd95 GIT binary patch literal 270 zcmZ>Y%CIzaj8qGb{Ma?Wk%8g#|LgzjJX{<c4INk+WE||5-#y^Kz`(?ju))dYokQaW zhFfdfI@KB&7&3Sn7&5-vI{U8NYU{LorIf9j;$((d%)SPU5^4^%3P}?gG8dR!U;qJ= zWKIr?CI|7@NjFLlN;22V?4QEn%wJG>_RoXgkFOtpc66Tnn)qo^aYhOfcSWRLGRQw@ z=<U6<JS>Gl;o(Um*%_A{wlLOA>0+7KDiGnsu*5mnK<t77%NOT16-j1;);V11ne!&C zEZ<Yu7<g3rnby)mGil?SKaM<(`ew#+@k4uCxS?pnS)B-t@+TtaXU`N!5n^WPOlGgy Zy@o}pqeEzh<e%7+A`hLMk7?Dh008U6Y9s&v literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/SoaresTb6.18.Rd b/man/SoaresTb6.18.Rd new file mode 100644 index 00000000..5d74392d --- /dev/null +++ b/man/SoaresTb6.18.Rd @@ -0,0 +1,40 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/SoaresTb6.18.R +\name{SoaresTb6.18} +\alias{SoaresTb6.18} +\title{Níveis de colesterol no início e no final do programa.} +\format{Um \code{data.frame} com 24 observações e 2 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{prg}}{Expecificação do programa: início e final.} + +\item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} + +}} +\source{ +Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e + Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. + Tb 6.18, pg 203. +} +\description{ +O presente estudo teve como objetivo avaliar a + efetividade de uma dieta combinada com um programa de exercícios + físicos na redução dos níveis de colesterol. Foram registrados os + níveis de colesterol no início e no final do programa de 12 + participantes. +} +\examples{ + +library(lattice) +data(SoaresTb6.18) +SoaresTb6.18$n <- seq(1:12) +xyplot(exp~n|prg, data = SoaresTb6.18, + xlab = 'Indivíduos que participaram do programa', + ylab = 'Níveis de colesterol') + + + +} +\keyword{AAS} + -- GitLab From db980c70933d785834d58f4e9d4fe8dedda20e65 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Tue, 13 Sep 2016 14:55:57 -0300 Subject: [PATCH 08/14] Adiciona tabela do exercicio 6 capitulo 6 --- .RData | Bin 5907 -> 4531 bytes R/SoaresEx6.6.R | 38 ++++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/SoaresEx6.6.txt | 19 ++++++++++++++++ data/SoaresEx6.6.rda | Bin 0 -> 227 bytes man/SoaresEx6.6.Rd | 46 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 5 files changed, 103 insertions(+) create mode 100644 R/SoaresEx6.6.R create mode 100644 data-raw/SoaresEx6.6.txt create mode 100644 data/SoaresEx6.6.rda create mode 100644 man/SoaresEx6.6.Rd diff --git a/.RData b/.RData index 0e75516338e02c68c952c765beca174a8153a29e..70c6796daf9dff8f049169fa38f85a8098b89bc5 100644 GIT binary patch literal 4531 zcmb2|=3oE==C@Yd7E_|H8>ijTe>%-euk()IBx}o=E)S=uSUMS<u};p)JIkY}qB+%N zg^1PCNij-ZLNkR$Wm~6Q@>Ep1;u!SvQqB7rmF&sSmaH%S_xb<-&z191-+!;YelPoN z>Fw;dw(H8|+=S$W3?zIw+8hofI&p017Ge5-FwtX%#f`2XlQ|h=d7BlNMEWPkCm3jP z7&|x=-%^+t$iXv@!|YPBaC85gGNCSs4kssJMyVg3^P0_zd8YrB-FfE39idmztD_~H zcp@eAl4=u^H@o#FPS83(LGh7^*hkMJEtXR(k}WF!Mb!I+bDWPlDSj{TAB#zE`IG_! 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Nesse estudo, os +#' nove indivíduos participaram da corrida de 800 metros em 2 +#' momentos: um deles em condições normais (sem hiperventilação) e +#' no outro após a hiperentilação voluntária. +#' @format Um \code{data.frame} com 18 observações e 2 variáveis. +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{hpv}}{Hiperventilação presente ou não presente.} +#' +#' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} +#' +#' } +#' @keywords AAS +#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e +#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. +#' Ex.6, cap.6, pg.223. +#' @examples +#' +#' library(lattice) +#' data(SoaresEx6.6) +#' SoaresEx6.6$n <- seq(1:9) +#' xyplot(exp~n|hpv, data = SoaresEx6.6, +#' type = c('g','b'), +#' xlab = 'Indivíduos que participaram da pesquisa', +#' ylab = 'Valores observados', +#' main = "Presença e ausência da hiperventilação no aumento da +#' capacidade física") +#' +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/SoaresEx6.6.txt b/data-raw/SoaresEx6.6.txt new file mode 100644 index 00000000..68df902c --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresEx6.6.txt @@ -0,0 +1,19 @@ +hpv exp +com 155 +com 150 +com 174 +com 158 +com 155 +com 148 +com 142 +com 164 +com 143 +sem 151 +sem 152 +sem 172 +sem 150 +sem 152 +sem 150 +sem 144 +sem 169 +sem 144 diff --git a/data/SoaresEx6.6.rda b/data/SoaresEx6.6.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..7bc895cfa34a6cab63018c7b31f7ec31e7597d76 GIT binary patch literal 227 zcmZ>Y%CIzaj8qGb{G2Pt&cLww|HuDU5ey8Bf(&d75)S(AcMmu)9zDsT%D~9LxPf8E zqQwqU3>O#}7?>4%d3hNmc^McO7=%<!md%^|Re`6$<f{?mEB58fR$4F}%E^<8l4t1^ z=AIS)<ke{(!{2xNO!{A!2QSu2op1iOa`i2hU4IrRf3``~iD)q0X);$XQ&mxXi6O^_ zOeZO}qq!3r<?S}C$+Ubp?fc%kZTvCY^d||hYFbM#>T_#i)R^AP$+v(<CrNvvIxAy{ j)V?*h9WCCf*Q{Gp@me5o^@9G7<to9gocv}N9~1xp+~-uv literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/SoaresEx6.6.Rd b/man/SoaresEx6.6.Rd new file mode 100644 index 00000000..54645029 --- /dev/null +++ b/man/SoaresEx6.6.Rd @@ -0,0 +1,46 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/SoaresEx6.6.R +\name{SoaresEx6.6} +\alias{SoaresEx6.6} +\title{Presença e ausência da hiperventilação no aumento da + capacidade física.} +\format{Um \code{data.frame} com 18 observações e 2 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{hpv}}{Hiperventilação presente ou não presente.} + +\item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} + +}} +\source{ +Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e + Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. + Ex.6, cap.6, pg.223. +} +\description{ +Nove indivíduos do sexo masculino, sadios, com idade + média de 21 anos participaram, voluntariamente, de uma pesquisa + cujo objetivo era verificar se a alcalose respiratória, induzida + por hiperventilação voluntária, aumenta a capacidade física + avaliada pelo tempo de corrida de 800 metros. Nesse estudo, os + nove indivíduos participaram da corrida de 800 metros em 2 + momentos: um deles em condições normais (sem hiperventilação) e + no outro após a hiperentilação voluntária. +} +\examples{ + +library(lattice) +data(SoaresEx6.6) +SoaresEx6.6$n <- seq(1:9) +xyplot(exp~n|hpv, data = SoaresEx6.6, + type = c('g','b'), + xlab = 'Indivíduos que participaram da pesquisa', + ylab = 'Valores observados', + main = "Presença e ausência da hiperventilação no aumento da + capacidade física") + + +} +\keyword{AAS} + -- GitLab From f5c2530b299f6e6f44712b38f332e43e03536f79 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Tue, 13 Sep 2016 17:39:45 -0300 Subject: [PATCH 09/14] Adiciona tabela do exercicio 19 capitulo 6 e txt modificado tabela 18 --- R/SoaresEx6.19.R | 48 +++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/SoaresEx6.19.txt | 5 ++++ data-raw/SoaresTb6.18.txt | 24 ++++++++-------- data/SoaresEx6.19.rda | Bin 0 -> 256 bytes man/SoaresEx6.19.Rd | 58 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 5 files changed, 123 insertions(+), 12 deletions(-) create mode 100644 R/SoaresEx6.19.R create mode 100644 data-raw/SoaresEx6.19.txt create mode 100644 data/SoaresEx6.19.rda create mode 100644 man/SoaresEx6.19.Rd diff --git a/R/SoaresEx6.19.R b/R/SoaresEx6.19.R new file mode 100644 index 00000000..bf9a9fb8 --- /dev/null +++ b/R/SoaresEx6.19.R @@ -0,0 +1,48 @@ +#' @name SoaresEx6.19 +#' @title Incidência de suicídio como causa de morte para poetas e +#' escritores de ficção. +#' @description Em 1992, Ludwig fez um estudo na qual compara o +#' comportamento criativo e psicopatologico entre diversos grupos +#' profissionais, a partir de pelo menos um fonte bibliogŕafica bem +#' documentada e bem estudada. Mais de 1000 personalidades +#' eminentes, já falecidas e que viveram pelo menos uma parte de suas +#' vidas no século XX foram divididas em dezenove categorias +#' profissionais e observações comportamentais. Uma característica +#' estudada foi a existência de diferenças na psicopatologia para +#' imigrantes do grupo artístico, tais como poetas e escritores de +#' ficção. +#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{cm}}{Causa de morte.} +#' +#' \item{\code{prof}}{Profissão avaliada.} +#' +#' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores obtidos.} +#' +#' } +#' @keywords AAS +#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e +#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. +#' Ex.19, cap.6, pg.231. +#' @references LUDWING, A. M. Creative achievement and psychology: +#' comparison among professions. The American Journal of +#' Psychotherapy, v.46, p.330-56, 1992. +#' @examples +#' +#' library(lattice) +#' data(SoaresEx6.19) +#' a <- xtabs(exp ~ cm + prof, data = SoaresEx6.19) +#' barchart(a, horizontal = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' scales = list(x=list(labels = c("Outras",'Suicídio'))), +#' ylab = "Frequência", +#' xlab = "Causa da morte", +#' main = "Incidência de suicídio como causa de morte para poetas e +#' escritores de ficção", +#' auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), +#' text = c("Escritores de ficção", +#' 'Poetas'))) +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/SoaresEx6.19.txt b/data-raw/SoaresEx6.19.txt new file mode 100644 index 00000000..027a4a2e --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresEx6.19.txt @@ -0,0 +1,5 @@ +cm prof exp +suicidio poetas 10 +suicidio escritores de ficcao 7 +outras poetas 43 +outras escritores de ficcao 173 diff --git a/data-raw/SoaresTb6.18.txt b/data-raw/SoaresTb6.18.txt index 7ce23b96..329db27c 100644 --- a/data-raw/SoaresTb6.18.txt +++ b/data-raw/SoaresTb6.18.txt @@ -1,16 +1,16 @@ prg exp -início 201 -início 231 -início 221 -início 260 -início 228 -início 237 -início 326 -início 235 -início 240 -início 267 -início 284 -início 201 +inicio 201 +inicio 231 +inicio 221 +inicio 260 +inicio 228 +inicio 237 +inicio 326 +inicio 235 +inicio 240 +inicio 267 +inicio 284 +inicio 201 final 200 final 236 final 216 diff --git a/data/SoaresEx6.19.rda b/data/SoaresEx6.19.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..d4f3c2c2785c8c8570ffb28fd935a315387e74a6 GIT binary patch literal 256 zcmZ>Y%CIzaj8qGboD#B$i-BQN{e}PEd>9-!4HeiJBpmeB?;mhrU|?ck-N108apk0$ zE1w!D`^-u?VQ9iTIp9FXi422=47OPej7qb*sxp@?%eZoYg?;5RVUvk!t0ivQSS{09 ze@#i$h^ef~`1{dMxjT;Me|^_4rYL5leOs8fc;D@1)9f}h1YC4>^w*obsK!Fkm5DpZ zhqZBuC-1T;Mp91U_H7F?S-d*_q_5+yi<{|Z{_IujI{DSj$+MZ;cdIV(Tw=cVnG)|b z?|z5V8uc9CrFPAEaogo(o%Tu|>weB77iK+<znT50pvf`IZJ{Yw3d`s1Y7=A*1quI& OJt^|g$tf`Cga!bw!)m$! literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/SoaresEx6.19.Rd b/man/SoaresEx6.19.Rd new file mode 100644 index 00000000..9f34ce0f --- /dev/null +++ b/man/SoaresEx6.19.Rd @@ -0,0 +1,58 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/SoaresEx6.19.R +\name{SoaresEx6.19} +\alias{SoaresEx6.19} +\title{Incidência de suicídio como causa de morte para poetas e + escritores de ficção.} +\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{cm}}{Causa de morte.} + +\item{\code{prof}}{Profissão avaliada.} + +\item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores obtidos.} + +}} +\source{ +Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e + Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. + Ex.19, cap.6, pg.231. +} +\description{ +Em 1992, Ludwig fez um estudo na qual compara o + comportamento criativo e psicopatologico entre diversos grupos + profissionais, a partir de pelo menos um fonte bibliogŕafica bem + documentada e bem estudada. Mais de 1000 personalidades + eminentes, já falecidas e que viveram pelo menos uma parte de suas + vidas no século XX foram divididas em dezenove categorias + profissionais e observações comportamentais. Uma característica + estudada foi a existência de diferenças na psicopatologia para + imigrantes do grupo artístico, tais como poetas e escritores de + ficção. +} +\examples{ + +library(lattice) +data(SoaresEx6.19) +a <- xtabs(exp ~ cm + prof, data = SoaresEx6.19) +barchart(a, horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales = list(x=list(labels = c("Outras",'Suicídio'))), + ylab = "Frequência", + xlab = "Causa da morte", + main = "Incidência de suicídio como causa de morte para poetas e + escritores de ficção", + auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), + text = c("Escritores de ficção", + 'Poetas'))) + +} +\references{ +LUDWING, A. M. Creative achievement and psychology: + comparison among professions. The American Journal of + Psychotherapy, v.46, p.330-56, 1992. +} +\keyword{AAS} + -- GitLab From 23b6ddae1aae413d3a2b11dd383d88d6c5be44ce Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Wed, 14 Sep 2016 15:20:34 -0300 Subject: [PATCH 10/14] Adiciona tabela exercicio 16 capitulo 6 --- R/SoaresEx6.18.R | 54 ++++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/SoaresEx6.18.txt | 5 +++ data/SoaresEx6.18.rda | Bin 0 -> 352 bytes man/SoaresEx6.18.Rd | 64 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 4 files changed, 123 insertions(+) create mode 100644 R/SoaresEx6.18.R create mode 100644 data-raw/SoaresEx6.18.txt create mode 100644 data/SoaresEx6.18.rda create mode 100644 man/SoaresEx6.18.Rd diff --git a/R/SoaresEx6.18.R b/R/SoaresEx6.18.R new file mode 100644 index 00000000..911d0bfb --- /dev/null +++ b/R/SoaresEx6.18.R @@ -0,0 +1,54 @@ +#' @name SoaresEx6.18 +#' @title A transferência do álcool para o leite humano. +#' @description O consumo de pequenas quantidades de álcool tem sido +#' recomendado a mulheres que amamentam a fim de ajudar à lactação. +#' A ocorrência de alteração nas características sensoriais do leite +#' ou no comportamento dos lactentes foi objeto de estudo de +#' Mennella e Beauchamp (1991). Durante dois dias, com intervalo de +#' uma semana, doze mulheres consumiram suco de laranja puro ou +#' contendo etanol antes de amamentarem suas crianças e meia-hora +#' após ter sido obtida uma amostra do leite. Amostras de leite para +#' o estudo foram obtidas 30 minutos, 1, 2, e 3 horas após o consumo +#' da bebida, de modo a interromper o mínimo possível a amamentação. +#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 6 variáveis. +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{var}}{Variável analisada no estudo. Neste caso, o leite +#' ingerido pela criança e o tempo de duração da amamentação.} +#' +#' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} +#' +#' \item{\code{ba}}{Bebida alcoólica ingerida ou não ingerida..} +#' +#' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores obtidos.} +#' +#' \item{\code{teste.t}}{Valor obtido com o teste-t.} +#' +#' \item{\code{valor.p}}{Valor-p utilizado no estudo.} +#' +#' } +#' @keywords AAS +#' @source SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 18, pg.231. +#' @references MENNELLA, J. A., BEAUCHAMP, G. K. The transfer of alcohol +#' to human milk. The New England Journal of Medicine, v.325, +#' p.981-5, 1991 . +#' @examples +#' +#' library(lattice) +#' data(SoaresEx6.18) +#' +#' dados <- xtabs(exp ~ var + ba, data = SoaresEx6.18) +#' barchart(dados, horizontal = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' scales = list(x = list(labels = c("Leite ingerido (mL)", +#' 'Tempo (min)'))), +#' ylab = "Frequência", +#' xlab = "Variável", +#' main = "A transferência do álcool para o leite humano", +#' auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), +#' text = c("Bebida alcoólica não ingerida", +#' 'Bebida alcoólica ingerida'))) +#' +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/SoaresEx6.18.txt b/data-raw/SoaresEx6.18.txt new file mode 100644 index 00000000..25ac7c3d --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresEx6.18.txt @@ -0,0 +1,5 @@ +var ba exp ep teste t valor-p +leite ingerido sim 156.4 8.2 4.69 0.0003 +leite ingerido nao 120.4 9.5 4.69 0.0003 +tempo sim 28.6 7.7 0.15 0.88 +tempo nao 28.2 7.3 0.15 0.88 diff --git a/data/SoaresEx6.18.rda b/data/SoaresEx6.18.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..98365a63fc28bc7deb2e27e6f0a09c52f84e09eb GIT binary patch literal 352 zcmZ>Y%CIzaj8qGboENaelY!ys|F8eIM<{y~R=ONxkaD$Oe)oU_OM?M}f&?1_3lr-G zMhO>F-<6Bf7Q3&U?6`n|fq~h9eF>jY%E^u+2RJ9QoM2qcaX{dJ%4Cn3J_=RM4h#$? zDVZ%97rx2`bt;R6vq{c95!tCb={B?Q9rmc813bp7=Iz*UOzW1<wM#CyHa_WaNtXNk zpjTp(mB8GI$|_O4Kh9?zWD81dnv|&YqH$8>|AeO34DXpV^0u<FIBwh!v5{qhT<r!w zBiBa~2`jSt1D1Tcetxs*<Kylf6|9TSZ`sZteNRBGC0l#qzYT63di!n6zZFR>?BI;u z5F_riS~Kay`r^a|GG1G~c#o@HIWVcLXnBOe=h|m0=5y^bH+VPcNc)}SV&f?<N;UQ> zr7*J9^q)DupeaH{D02G44{5U|ENYy;;DlC<?WX&h+6FvnqNTnjOB20Y*=G0u(|giY Luu#!vVZkH-x!0K_ literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/SoaresEx6.18.Rd b/man/SoaresEx6.18.Rd new file mode 100644 index 00000000..c8bfa6d7 --- /dev/null +++ b/man/SoaresEx6.18.Rd @@ -0,0 +1,64 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/SoaresEx6.18.R +\name{SoaresEx6.18} +\alias{SoaresEx6.18} +\title{A transferência do álcool para o leite humano.} +\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 6 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{var}}{Variável analisada no estudo. Neste caso, o leite + ingerido pela criança e o tempo de duração da amamentação.} + +\item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} + +\item{\code{ba}}{Bebida alcoólica ingerida ou não ingerida..} + +\item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores obtidos.} + +\item{\code{teste.t}}{Valor obtido com o teste-t.} + +\item{\code{valor.p}}{Valor-p utilizado no estudo.} + +}} +\source{ +SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 18, pg.231. +} +\description{ +O consumo de pequenas quantidades de álcool tem sido + recomendado a mulheres que amamentam a fim de ajudar à lactação. + A ocorrência de alteração nas características sensoriais do leite + ou no comportamento dos lactentes foi objeto de estudo de + Mennella e Beauchamp (1991). Durante dois dias, com intervalo de + uma semana, doze mulheres consumiram suco de laranja puro ou + contendo etanol antes de amamentarem suas crianças e meia-hora + após ter sido obtida uma amostra do leite. Amostras de leite para + o estudo foram obtidas 30 minutos, 1, 2, e 3 horas após o consumo + da bebida, de modo a interromper o mínimo possível a amamentação. +} +\examples{ + +library(lattice) +data(SoaresEx6.18) + +dados <- xtabs(exp ~ var + ba, data = SoaresEx6.18) +barchart(dados, horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales = list(x = list(labels = c("Leite ingerido (mL)", + 'Tempo (min)'))), + ylab = "Frequência", + xlab = "Variável", + main = "A transferência do álcool para o leite humano", + auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), + text = c("Bebida alcoólica não ingerida", + 'Bebida alcoólica ingerida'))) + + +} +\references{ +MENNELLA, J. A., BEAUCHAMP, G. K. The transfer of alcohol + to human milk. The New England Journal of Medicine, v.325, + p.981-5, 1991 . +} +\keyword{AAS} + -- GitLab From 95a9519d5bbd00080443e4921613960d41e1ca95 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Wed, 14 Sep 2016 15:51:35 -0300 Subject: [PATCH 11/14] adiciona tabela 20 capitulo 6 --- .RData | Bin 4531 -> 3078 bytes R/SoaresTb6.20.R | 42 ++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/SoaresTb6.20.txt | 33 ++++++++++++++++++++++++ data/SoaresTb6.20.rda | Bin 0 -> 269 bytes man/SoaresTb6.20.Rd | 52 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 5 files changed, 127 insertions(+) create mode 100644 R/SoaresTb6.20.R create mode 100644 data-raw/SoaresTb6.20.txt create mode 100644 data/SoaresTb6.20.rda create mode 100644 man/SoaresTb6.20.Rd diff --git a/.RData b/.RData index 70c6796daf9dff8f049169fa38f85a8098b89bc5..da983b9fec055a5d48a0bfaf4070a94eb1fd0533 100644 GIT binary patch literal 3078 zcmb2|=3oE==BeS87E`jN<+G=46m~r^&(`~!RM5@sD&B^dXKXY%GsDn=$2V%lgb6vR z_PsnO<$_zf_$8NxyozxDW_sFi<xjUlznbSU&ui-c-1{9__x+pA`Rds3Z&Ti_I{Ne! 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Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio +#' clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de +#' comparar a tianeptina com o placebo. O ensaio consistiu em +#' administrar a droga a dois grupos de pacientes, compostos de +#' forma aleatória, e quantificar a depressão através da escala de +#' Montgomery-Asberg (MADRS). Além disso, Rocha verificou se houve +#' diminuição do escore de depressão entre os pacientes de um dos +#' grupos (tianeptina) durante o desenvolvimento do estudo. Os dados +#' apresentados são escores atribuídos a 16 pacientes do grupo +#' tianeptina que foram admitidos em Belo Horizonte no primeiro dia +#' e no último dia. +#' @format Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis. +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{per}}{Período de tempo na qual o dado foi coletado.} +#' +#' \item{\code{esc}}{Escore obtido pelo paciente tanto no primeiro dia +#' quanto no segundo dia.} +#' +#' } +#' @keywords AAS +#' @source SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 20, pg.207. +#' @references ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de +#' episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, +#' controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da +#' UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva +#' e Social). +#' @examples +#' library(lattice) +#' +#' SoaresTb6.20$n <- seq(1:16) +#' xyplot(esc~n|per, data = SoaresTb6.20, +#' type = c('g','b'), +#' xlab = 'Pacientes do grupo tianeptina', +#' ylab = 'Escores dos pacientes') +#' +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/SoaresTb6.20.txt b/data-raw/SoaresTb6.20.txt new file mode 100644 index 00000000..ead48b04 --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresTb6.20.txt @@ -0,0 +1,33 @@ +per esc +primeiro dia 24 +primeiro dia 46 +primeiro dia 26 +primeiro dia 44 +primeiro dia 27 +primeiro dia 34 +primeiro dia 33 +primeiro dia 25 +primeiro dia 35 +primeiro dia 30 +primeiro dia 38 +primeiro dia 38 +primeiro dia 31 +primeiro dia 27 +primeiro dia 34 +primeiro dia 32 +ultimo dia 6 +ultimo dia 33 +ultimo dia 21 +ultimo dia 26 +ultimo dia 10 +ultimo dia 29 +ultimo dia 33 +ultimo dia 29 +ultimo dia 37 +ultimo dia 15 +ultimo dia 2 +ultimo dia 21 +ultimo dia 7 +ultimo dia NA +ultimo dia NA +ultimo dia 26 diff --git a/data/SoaresTb6.20.rda b/data/SoaresTb6.20.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..3f3362333d400db8a984f195c5abb109ef8d2e5d GIT binary patch literal 269 zcmZ>Y%CIzaj8qGb<c(rl%)s!a{^0*@r>cLm1~RZP$T--m-*0eWaA06y+`w>awt$AR zTbr-RS4l(Ll}5Y_QYnd|W{WvzGD<LTwn$|*RY`G*Xc_yuotW2h;bg~Ug|ub<!Gg>6 zZY)_6aO}a670bk{xJxeho$lH5Dlz?AL~(kYXXlZr@|hXGMAEi4o!xS2(%;?D(hM$+ zArkWL{D*B%u(-<QOm_LuvDU&vY)TuaF0Y2-0%<S9CYIc~vw}%EK^Ydj%8&BO);_-* z8(mr%p7{G``-F>Lp(gLV4+oe%Vsf$XTgATF<^{)TvjW+xO=_tutIzgc+~h44n4yrv a$7<ZEcQ={oW8*!&CtU>#6{NPXx&Z(taBLU= literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/SoaresTb6.20.Rd b/man/SoaresTb6.20.Rd new file mode 100644 index 00000000..3aaf179a --- /dev/null +++ b/man/SoaresTb6.20.Rd @@ -0,0 +1,52 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/SoaresTb6.20.R +\name{SoaresTb6.20} +\alias{SoaresTb6.20} +\title{Escores do grupo tianeptina nos primeiro e ultimos dias.} +\format{Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{per}}{Período de tempo na qual o dado foi coletado.} + +\item{\code{esc}}{Escore obtido pelo paciente tanto no primeiro dia + quanto no segundo dia.} + +}} +\source{ +SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 20, pg.207. +} +\description{ +A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos + tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio + clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de + comparar a tianeptina com o placebo. O ensaio consistiu em + administrar a droga a dois grupos de pacientes, compostos de + forma aleatória, e quantificar a depressão através da escala de + Montgomery-Asberg (MADRS). Além disso, Rocha verificou se houve + diminuição do escore de depressão entre os pacientes de um dos + grupos (tianeptina) durante o desenvolvimento do estudo. Os dados + apresentados são escores atribuídos a 16 pacientes do grupo + tianeptina que foram admitidos em Belo Horizonte no primeiro dia + e no último dia. +} +\examples{ +library(lattice) + +SoaresTb6.20$n <- seq(1:16) +xyplot(esc~n|per, data = SoaresTb6.20, + type = c('g','b'), + xlab = 'Pacientes do grupo tianeptina', + ylab = 'Escores dos pacientes') + + +} +\references{ +ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de + episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, + controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da + UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva + e Social). +} +\keyword{AAS} + -- GitLab From 51744842d0c81fcb89c31b3dde9fbe2a7aa8f2e1 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Wed, 14 Sep 2016 16:16:37 -0300 Subject: [PATCH 12/14] Adiciona tabela 6.15 capitulo 6 --- R/SoaresTb6.15.R | 41 ++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/SoaresTb6.15.txt | 33 ++++++++++++++++++++++++ data/SoaresTb6.15.rda | Bin 0 -> 264 bytes man/SoaresTb6.15.Rd | 51 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 4 files changed, 125 insertions(+) create mode 100644 R/SoaresTb6.15.R create mode 100644 data-raw/SoaresTb6.15.txt create mode 100644 data/SoaresTb6.15.rda create mode 100644 man/SoaresTb6.15.Rd diff --git a/R/SoaresTb6.15.R b/R/SoaresTb6.15.R new file mode 100644 index 00000000..a630b357 --- /dev/null +++ b/R/SoaresTb6.15.R @@ -0,0 +1,41 @@ +#' @name SoaresTb6.15 +#' @title Escore final na escala MADRS de pacientes dos dois grupos +#' admitidos em Belo Horizonte. +#' @description A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos +#' tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio +#' clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de +#' comparar a tianeptina com o placebo. Participaram deste ensaio +#' pacientes de Belo Horizonte, Rio de Janeiro, e Campinas. O ensaio +#' consistiu em administrar a droga a dois grupos de pacientes, +#' compostos de forma aleatória, e quantificar a depressão através +#' da escala de Montgomery-Asberg (MADRS), em que os valores maiores +#' indicam maior gravidade da depressão. O escore foi obtido para +#' cada paciente 7, 14, 21, 28 e 42 dias após o início do ensaio. +#' @format Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis. +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{grp}}{Grupos de pacientes.} +#' +#' \item{\code{esc}}{Escore final obtido pelo paciente.} +#' +#' } +#' @keywords AAS +#' @source SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 6.15, pg.207. +#' @references ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de +#' episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, +#' controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da +#' UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva +#' e Social). +#' @examples +#' library(lattice) +#' data(SoaresTb6.15) +#' +#' SoaresTb6.15$n <- seq(1:16) +#' xyplot(esc~n|grp, data = SoaresTb6.15, +#' type = c('g','b'), +#' xlab = 'Pacientes do ensaio', +#' ylab = 'Escores dos pacientes') +#' +#' +NULL diff --git a/data-raw/SoaresTb6.15.txt b/data-raw/SoaresTb6.15.txt new file mode 100644 index 00000000..91b629d5 --- /dev/null +++ b/data-raw/SoaresTb6.15.txt @@ -0,0 +1,33 @@ +grp,esc +placebo,6 +placebo,33 +placebo,21 +placebo,26 +placebo,10 +placebo,29 +placebo,33 +placebo,29 +placebo,37 +placebo,15 +placebo,2 +placebo,21 +placebo,7 +placebo,26 +placebo,13 +placebo, +tianeptina,10 +tianeptina,8 +tianeptina,17 +tianeptina,4 +tianeptina,17 +tianeptina,14 +tianeptina,9 +tianeptina,4 +tianeptina,21 +tianeptina,3 +tianeptina,7 +tianeptina,10 +tianeptina,29 +tianeptina,13 +tianeptina,14 +tianeptina,2 diff --git a/data/SoaresTb6.15.rda b/data/SoaresTb6.15.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..f29557e870c0cb233caedf928b7fe026485d3dc5 GIT binary patch literal 264 zcmZ>Y%CIzaj8qGbym4*Ic?O2h{}2BE{z@o`(U^gSLB_#;`P~Kw1_uTP#tjVD47xIx zwS37?f91P?QHs~V*FZo+n6qv90%6XD6DKb0Y*gxW_W9~8d~wB>j9CU(@&nnVX1Ofr zSS27JD9O+xGhy-TW(_Y!m6z;7%ppHaGFpy*sm++O`t8nnTjeS@{CKF`u>Qo;GM%do znpur((M*N+E(w`zb@ra4#5?CMr<U6V1E-BkSxlG{$}F}_QkRgPrIE?IFj{-<-p|KM z-hbOvYxU*n!h~DK*=u>f{c|^8-6A40Q!YiLwcU6{KxE0rcO|TM6}|0u7<s5LGr5G> U-!9tfF_pDayvWreU;@bJ06NBRxBvhE literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/SoaresTb6.15.Rd b/man/SoaresTb6.15.Rd new file mode 100644 index 00000000..0d514507 --- /dev/null +++ b/man/SoaresTb6.15.Rd @@ -0,0 +1,51 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/SoaresTb6.15.R +\name{SoaresTb6.15} +\alias{SoaresTb6.15} +\title{Escore final na escala MADRS de pacientes dos dois grupos + admitidos em Belo Horizonte.} +\format{Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis. + +\describe{ + +\item{\code{grp}}{Grupos de pacientes.} + +\item{\code{esc}}{Escore final obtido pelo paciente.} + +}} +\source{ +SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 6.15, pg.207. +} +\description{ +A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos + tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio + clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de + comparar a tianeptina com o placebo. Participaram deste ensaio + pacientes de Belo Horizonte, Rio de Janeiro, e Campinas. O ensaio + consistiu em administrar a droga a dois grupos de pacientes, + compostos de forma aleatória, e quantificar a depressão através + da escala de Montgomery-Asberg (MADRS), em que os valores maiores + indicam maior gravidade da depressão. O escore foi obtido para + cada paciente 7, 14, 21, 28 e 42 dias após o início do ensaio. +} +\examples{ +library(lattice) +data(SoaresTb6.15) + +SoaresTb6.15$n <- seq(1:16) +xyplot(esc~n|grp, data = SoaresTb6.15, + type = c('g','b'), + xlab = 'Pacientes do ensaio', + ylab = 'Escores dos pacientes') + + +} +\references{ +ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de + episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, + controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da + UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva + e Social). +} +\keyword{AAS} + -- GitLab From d3b7697e2b48ed969e33598c71e6e0bf2898f8f3 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Walmes Zeviani <walmes@ufpr.br> Date: Sat, 22 Oct 2016 15:28:01 -0200 Subject: [PATCH 13/14] Faz correcoes na documentacao. --- R/SoaresEx6.17.R | 56 +++++++++++++++--------------- R/SoaresEx6.18.R | 70 ++++++++++++++++++++------------------ R/SoaresEx6.19.R | 69 +++++++++++++++++++------------------ R/SoaresEx6.6.R | 53 +++++++++++++++-------------- R/SoaresTb6.1.R | 59 +++++++++++++++----------------- R/SoaresTb6.15.R | 60 +++++++++++++++++--------------- R/SoaresTb6.18.R | 45 ++++++++++++++---------- R/SoaresTb6.20.R | 65 ++++++++++++++++++++--------------- data-raw/SoaresEx6.19.txt | 2 +- data-raw/SoaresEx6.6.txt | 2 +- data-raw/SoaresTb6.1.txt | 10 +++--- data/SoaresEx6.19.rda | Bin 256 -> 257 bytes data/SoaresEx6.6.rda | Bin 227 -> 231 bytes data/SoaresTb6.1.rda | Bin 241 -> 238 bytes man/SoaresEx6.17.Rd | 52 ++++++++++++++-------------- man/SoaresEx6.18.Rd | 54 +++++++++++++++-------------- man/SoaresEx6.19.Rd | 61 +++++++++++++++++---------------- man/SoaresEx6.6.Rd | 45 ++++++++++++------------ man/SoaresTb6.1.Rd | 52 ++++++++++++++-------------- man/SoaresTb6.15.Rd | 56 ++++++++++++++++-------------- man/SoaresTb6.18.Rd | 30 ++++++++-------- man/SoaresTb6.20.Rd | 52 +++++++++++++++------------- 22 files changed, 465 insertions(+), 428 deletions(-) diff --git a/R/SoaresEx6.17.R b/R/SoaresEx6.17.R index 282e9689..213b8779 100644 --- a/R/SoaresEx6.17.R +++ b/R/SoaresEx6.17.R @@ -1,50 +1,48 @@ #' @name SoaresEx6.17 -#' @title Relação entre a depressão e o desejo pela morte de pacientes -#' com câncer terminal. +#' @title Relação entre a Depressão e o Desejo pela Morte de Pacientes +#' com Câncer Terminal #' @description Um estudo feito por Chochinov et al. (1995) contou com a -#' participação de 190 pacientes de dois hospitais em Winnipeg, +#' participação de 190 pacientes de dois hospitais em Winnipeg, #' Canadá, com diagnóstico primário de câncer terminal, admitidos no -#' período de coletas de dados. Uma das preocupações era verificar a -#' existência de relação entre o desejo de morte relatado por alguns +#' período de coletas de dados. Uma das preocupações era verificar a +#' existência de relação entre o desejo de morte relatado por alguns #' deles e a depressão diagnosticada em alguns casos. -#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. +#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis, em que #' #' \describe{ #' -#' \item{\code{dpm}}{Desejo pela morte ausente ou presente nos pacientes +#' \item{\code{dpm}}{Desejo pela morte ausente ou presente nos pacientes #' do estudo.} #' -#' \item{\code{dpss}}{Depressão presente ou ausente nos pacientes do +#' \item{\code{dpss}}{Depressão presente ou ausente nos pacientes do #' estudo.} #' -#' \item{exp}{Variável explicativa entre o desejo pela morte e a -#' depressão.} +#' \item{freq}{Frequência de casos em cada combinação.} #' #' } #' @keywords AAS -#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e -#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. -#' Ex 17, pg 230. +#' @source SOARES; SIQUEIRA (2002), exercício 17, pág. 230. #' @references CHOCHINOV, H. M., WILSON, K.G., ENNS, M. et al. Desire -#' for death in the terminal ill. The American Journal of Psychiatry, -#' v.152, p.1185-91, 1995. +#' for death in the terminal ill. \emph{The American Journal of +#' Psychiatry}, v.152, p.1185-91, 1995. #' @examples #' #' library(lattice) -#' data(SoaresEx6.17) #' -#' dado <- xtabs(exp ~ dpm + dpss, data = SoaresEx6.17) -#' barchart(dado, horizontal = FALSE, -#' stack = FALSE, -#' scales = list(x = list(labels = c("Ausente","Presente"))), -#' ylab = "Frequência", -#' xlab = "Depressão", -#' main = "Relação entre a depressão e o desejo pela morte de -#' pacientes com câncer terminal", -#' auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), -#' text = c("Desejo pela morte ausente", -#' 'Desejo pela morte presente'))) -#' -#' +#' data(SoaresEx6.17) +#' str(SoaresEx6.17) +#' +#' names(SoaresEx6.17)[3] <- "freq" +#' dado <- xtabs(freq ~ dpm + dpss, data = SoaresEx6.17) +#' mosaicplot(dado) +#' +#' barchart(dado, +#' horizontal = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' scales = list(x = list(labels = c("Ausente", "Presente"))), +#' ylab = "Frequência", +#' xlab = "Depressão", +#' auto.key = list(text = c("Desejo pela morte ausente", +#' "Desejo pela morte presente"))) #' NULL diff --git a/R/SoaresEx6.18.R b/R/SoaresEx6.18.R index 911d0bfb..ff9e5f04 100644 --- a/R/SoaresEx6.18.R +++ b/R/SoaresEx6.18.R @@ -1,54 +1,58 @@ #' @name SoaresEx6.18 -#' @title A transferência do álcool para o leite humano. -#' @description O consumo de pequenas quantidades de álcool tem sido -#' recomendado a mulheres que amamentam a fim de ajudar à lactação. +#' @title A Transferência do Álcool para o Leite Materno +#' @description O consumo de pequenas quantidades de álcool tem sido +#' recomendado a mulheres que amamentam a fim de ajudar à lactação. #' A ocorrência de alteração nas características sensoriais do leite -#' ou no comportamento dos lactentes foi objeto de estudo de -#' Mennella e Beauchamp (1991). Durante dois dias, com intervalo de -#' uma semana, doze mulheres consumiram suco de laranja puro ou -#' contendo etanol antes de amamentarem suas crianças e meia-hora +#' ou no comportamento dos lactentes foi objeto de estudo de +#' Mennella e Beauchamp (1991). Durante dois dias, com intervalo de +#' uma semana, doze mulheres consumiram suco de laranja puro ou +#' contendo etanol antes de amamentarem suas crianças e meia-hora #' após ter sido obtida uma amostra do leite. Amostras de leite para -#' o estudo foram obtidas 30 minutos, 1, 2, e 3 horas após o consumo -#' da bebida, de modo a interromper o mínimo possível a amamentação. -#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 6 variáveis. +#' o estudo foram obtidas 30 minutos, 1, 2, e 3 horas após o consumo +#' da bebida, de modo a interromper o mínimo possível a +#' amamentação. TODO Não entendi os dados da tabela, não foi +#' possível associar com o enunciado. +#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 6 variáveis, em que #' #' \describe{ #' -#' \item{\code{var}}{Variável analisada no estudo. Neste caso, o leite +#' \item{\code{var}}{Variável analisada no estudo. Neste caso, o leite #' ingerido pela criança e o tempo de duração da amamentação.} #' #' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} -#' -#' \item{\code{ba}}{Bebida alcoólica ingerida ou não ingerida..} -#' +#' +#' \item{\code{ba}}{Bebida alcoólica ingerida ou não ingerida.} +#' #' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores obtidos.} -#' +#' #' \item{\code{teste.t}}{Valor obtido com o teste-t.} -#' +#' #' \item{\code{valor.p}}{Valor-p utilizado no estudo.} #' #' } #' @keywords AAS -#' @source SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 18, pg.231. +#' @source SOARES; SIQUEIRA, (2002), tabela 18, pág. 231. #' @references MENNELLA, J. A., BEAUCHAMP, G. K. The transfer of alcohol -#' to human milk. The New England Journal of Medicine, v.325, -#' p.981-5, 1991 . +#' to human milk. \emph{The New England Journal of Medicine}, v.325, +#' p.981-5, 1991. #' @examples #' #' library(lattice) +#' #' data(SoaresEx6.18) -#' +#' str(SoaresEx6.18) +#' #' dados <- xtabs(exp ~ var + ba, data = SoaresEx6.18) -#' barchart(dados, horizontal = FALSE, -#' stack = FALSE, -#' scales = list(x = list(labels = c("Leite ingerido (mL)", -#' 'Tempo (min)'))), -#' ylab = "Frequência", -#' xlab = "Variável", -#' main = "A transferência do álcool para o leite humano", -#' auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), -#' text = c("Bebida alcoólica não ingerida", -#' 'Bebida alcoólica ingerida'))) -#' -#' -NULL \ No newline at end of file +#' addmargins(dados) +#' +#' barchart(dados, +#' horizontal = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' scales = list(x = list(labels = c("Leite ingerido (mL)", +#' "Tempo (min)"))), +#' ylab = "Frequência", +#' xlab = "Variável", +#' auto.key = list(text = c("Bebida alcoólica não ingerida", +#' "Bebida alcoólica ingerida"))) +#' +NULL diff --git a/R/SoaresEx6.19.R b/R/SoaresEx6.19.R index bf9a9fb8..d3253bbc 100644 --- a/R/SoaresEx6.19.R +++ b/R/SoaresEx6.19.R @@ -1,48 +1,49 @@ #' @name SoaresEx6.19 -#' @title Incidência de suicídio como causa de morte para poetas e -#' escritores de ficção. -#' @description Em 1992, Ludwig fez um estudo na qual compara o -#' comportamento criativo e psicopatologico entre diversos grupos -#' profissionais, a partir de pelo menos um fonte bibliogŕafica bem -#' documentada e bem estudada. Mais de 1000 personalidades -#' eminentes, já falecidas e que viveram pelo menos uma parte de suas -#' vidas no século XX foram divididas em dezenove categorias -#' profissionais e observações comportamentais. Uma característica -#' estudada foi a existência de diferenças na psicopatologia para -#' imigrantes do grupo artístico, tais como poetas e escritores de +#' @title Incidência de Suicídio como Causa de Morte para Poetas e +#' Escritores de Ficção +#' @description Em 1992, Ludwig fez um estudo na qual compara o +#' comportamento criativo e psicopatológico entre diversos grupos +#' profissionais, a partir de pelo menos um fonte bibliográfica bem +#' documentada e bem estudada. Mais de 1000 personalidades +#' eminentes, já falecidas e que viveram pelo menos uma parte de +#' suas vidas no século XX foram divididas em dezenove categorias +#' profissionais e observações comportamentais. Uma característica +#' estudada foi a existência de diferenças na psicopatologia para +#' imigrantes do grupo artístico, tais como poetas e escritores de #' ficção. -#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. +#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis, em que #' #' \describe{ #' #' \item{\code{cm}}{Causa de morte.} #' #' \item{\code{prof}}{Profissão avaliada.} -#' -#' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores obtidos.} +#' +#' \item{\code{freq}}{Frequência de casos tem cada situação.} #' #' } -#' @keywords AAS -#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e -#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. -#' Ex.19, cap.6, pg.231. -#' @references LUDWING, A. M. Creative achievement and psychology: -#' comparison among professions. The American Journal of -#' Psychotherapy, v.46, p.330-56, 1992. +#' @keywords AAS +#' @source SOARES; SIQUEIRA (2002), exercício 19, capítulo 6, pág. 231. +#' @references LUDWING, A. M. Creative achievement and psychology: +#' comparison among professions. \emph{The American Journal of +#' Psychotherapy}, v.46, p.330-56, 1992. #' @examples #' #' library(lattice) +#' #' data(SoaresEx6.19) -#' a <- xtabs(exp ~ cm + prof, data = SoaresEx6.19) -#' barchart(a, horizontal = FALSE, -#' stack = FALSE, -#' scales = list(x=list(labels = c("Outras",'Suicídio'))), -#' ylab = "Frequência", -#' xlab = "Causa da morte", -#' main = "Incidência de suicídio como causa de morte para poetas e -#' escritores de ficção", -#' auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), -#' text = c("Escritores de ficção", -#' 'Poetas'))) -#' -NULL \ No newline at end of file +#' str(SoaresEx6.19) +#' +#' a <- xtabs(freq ~ cm + prof, data = SoaresEx6.19) +#' addmargins(a) +#' +#' barchart(a, +#' horizontal = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' scales = list(x = list(labels = c("Outras", "Suicídio"))), +#' ylab = "Frequência", +#' xlab = "Causa da morte", +#' auto.key = list(text = c("Escritores de ficção", +#' "Poetas"))) +#' +NULL diff --git a/R/SoaresEx6.6.R b/R/SoaresEx6.6.R index 0803ca05..26f10c6f 100644 --- a/R/SoaresEx6.6.R +++ b/R/SoaresEx6.6.R @@ -1,38 +1,39 @@ #' @name SoaresEx6.6 -#' @title Presença e ausência da hiperventilação no aumento da -#' capacidade física. -#' @description Nove indivíduos do sexo masculino, sadios, com idade -#' média de 21 anos participaram, voluntariamente, de uma pesquisa -#' cujo objetivo era verificar se a alcalose respiratória, induzida -#' por hiperventilação voluntária, aumenta a capacidade física -#' avaliada pelo tempo de corrida de 800 metros. Nesse estudo, os -#' nove indivíduos participaram da corrida de 800 metros em 2 -#' momentos: um deles em condições normais (sem hiperventilação) e -#' no outro após a hiperentilação voluntária. -#' @format Um \code{data.frame} com 18 observações e 2 variáveis. +#' @title Presença e Ausência da Hiperventilação no Aumento da +#' Capacidade Física +#' @description Nove indivíduos do sexo masculino, sadios, com idade +#' média de 21 anos participaram, voluntariamente, de uma pesquisa +#' cujo objetivo era verificar se a alcalose respiratória, induzida +#' por hiperventilação voluntária, aumenta a capacidade física +#' avaliada pelo tempo de corrida de 800 metros. Nesse estudo, os +#' nove indivíduos participaram da corrida de 800 metros em 2 +#' momentos: um deles em condições normais (sem hiperventilação) e +#' no outro após a hiperentilação voluntária. +#' @format Um \code{data.frame} com 18 observações e 2 variáveis, em que #' #' \describe{ #' #' \item{\code{hpv}}{Hiperventilação presente ou não presente.} #' -#' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} +#' \item{\code{tempo}}{Tempo para completar a corrida de 800 metros, em +#' segundos.} #' #' } -#' @keywords AAS -#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e -#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. -#' Ex.6, cap.6, pg.223. +#' @keywords AAS +#' @source SOARES; SIQUEIRA (2002), exercício 6, capítulo 6, pág. 223. #' @examples #' #' library(lattice) +#' #' data(SoaresEx6.6) -#' SoaresEx6.6$n <- seq(1:9) -#' xyplot(exp~n|hpv, data = SoaresEx6.6, -#' type = c('g','b'), -#' xlab = 'Indivíduos que participaram da pesquisa', -#' ylab = 'Valores observados', -#' main = "Presença e ausência da hiperventilação no aumento da -#' capacidade física") -#' -#' -NULL \ No newline at end of file +#' str(SoaresEx6.6) +#' +#' xyplot(tempo ~ hpv, +#' data = SoaresEx6.6, +#' type = c("p", "a"), +#' grid = TRUE, +#' jitter.x = TRUE, +#' xlab = "Hiperventilação", +#' ylab = "Tempo na corrida de 800 metros (s)") +#' +NULL diff --git a/R/SoaresTb6.1.R b/R/SoaresTb6.1.R index 41e9ac3b..cda42424 100644 --- a/R/SoaresTb6.1.R +++ b/R/SoaresTb6.1.R @@ -1,49 +1,46 @@ #' @name SoaresTb6.1 -#' @title Número de pacientes tratados com AZT ou placebo. -#' @description Em 1987, FISCHL publicou o primeiro relato de um ensaio +#' @title Sobreviência de Pacientes Tratados com AZT ou Placebo +#' @description Em 1987, FISCHL publicou o primeiro relato de um ensaio #' clínico que comprovou a eficácia do fármaco zidovudina (AZT) para -#' prolongar a vida de pacientes com AIDS. Na tabela é apresentado -#' os dados entre a relação dos pacientes que receberam o AZT e o +#' prolongar a vida de pacientes com AIDS. Na tabela é apresentado +#' os dados entre a relação dos pacientes que receberam o AZT e o #' placebo e permaneceram vivos ou mortos durante o experimento. -#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. +#' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis, em que #' #' \describe{ #' -#' \item{\code{grp}}{Grupo de pacientes que receberam o zidozudina -#' (AZT) ou placebo.} +#' \item{\code{grp}}{Grupo de pacientes que receberam o zidozudina (AZT) +#' ou placebo.} #' -#' \item{\code{sit}}{Situação dos pacientes com AIDS após o uso dos +#' \item{\code{sit}}{Situação dos pacientes com AIDS após o uso dos #' fármacos no que diz respeito ao prolongamento de suas vidas.} #' -#' \item{exp}{Variável explicativa dos valores obtidos.} +#' \item{freq}{Número de casos em cada situação.} #' #' } #' @keywords AAS -#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e -#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. -#' Tb 6.1, pg 177. -#' -#' @references FISCHL, M. A., RICHMAN, D. D., GRIECO, M. H. et al. The -#' efficacy of azidothymidine (AZT) in treatment of patients with +#' @source SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.1, pág. 177. +#' @references FISCHL, M. A., RICHMAN, D. D., GRIECO, M. H. et al. The +#' efficacy of azidothymidine (AZT) in treatment of patients with #' AIDS and AIDS-related complez. A doubleblind, placebo-controlled -#' trial. The New England Journal of Medicine, v.317, n.4 p.185-91, -#' 1987. +#' trial. \emph{The New England Journal of Medicine}, v.317, n.4 +#' p.185-91, 1987. #' @examples #' #' library(lattice) +#' #' data(SoaresTb6.1) +#' str(SoaresTb6.1) +#' +#' dados <- xtabs(freq ~ grp + sit, data = SoaresTb6.1) +#' addmargins(dados) +#' +#' barchart(dados, +#' horizontal = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' scales = list(x = list(labels = c("AZT", "Placebo"))), +#' ylab = "Frequência", +#' xlab = "Grupo", +#' auto.key = list(text = c("Morto", "Vivo"))) #' -#' dados <- xtabs(exp ~ grp + sit, data = SoaresTb6.1) -#' barchart(dados, horizontal = FALSE, -#' stack = FALSE, -#' scales=list(x=list(labels=c("AZT","Placebo"))), -#' ylab = "Frequência", -#' xlab = "Grupo", -#' main = "Número de pacientes tratados com AZT ou placebo", -#' auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), -#' text = c("Morto", -#' 'Vivo'))) -#' -#' -#' -NULL \ No newline at end of file +NULL diff --git a/R/SoaresTb6.15.R b/R/SoaresTb6.15.R index a630b357..4fcc2ab0 100644 --- a/R/SoaresTb6.15.R +++ b/R/SoaresTb6.15.R @@ -1,41 +1,47 @@ #' @name SoaresTb6.15 -#' @title Escore final na escala MADRS de pacientes dos dois grupos -#' admitidos em Belo Horizonte. -#' @description A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos -#' tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio -#' clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de -#' comparar a tianeptina com o placebo. Participaram deste ensaio -#' pacientes de Belo Horizonte, Rio de Janeiro, e Campinas. O ensaio -#' consistiu em administrar a droga a dois grupos de pacientes, -#' compostos de forma aleatória, e quantificar a depressão através -#' da escala de Montgomery-Asberg (MADRS), em que os valores maiores -#' indicam maior gravidade da depressão. O escore foi obtido para -#' cada paciente 7, 14, 21, 28 e 42 dias após o início do ensaio. -#' @format Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis. +#' @title Escore Final na Escala MADRS de Pacientes dos Dois Grupos +#' Admitidos Tratados com Tianeptina +#' @description A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos +#' tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio +#' clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de +#' comparar a tianeptina com o placebo. Participaram deste ensaio +#' pacientes de Belo Horizonte, Rio de Janeiro, e Campinas. O ensaio +#' consistiu em administrar a droga a dois grupos de pacientes, +#' compostos de forma aleatória, e quantificar a depressão através +#' da escala de Montgomery-Asberg (MADRS), em que os valores maiores +#' indicam maior gravidade da depressão. O escore foi obtido para +#' cada paciente 7, 14, 21, 28 e 42 dias após o início do ensaio. +#' @format Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis, em que #' #' \describe{ #' -#' \item{\code{grp}}{Grupos de pacientes.} +#' \item{\code{grp}}{Grupos de pacientes segundo recebimento da +#' tieneptina.} #' -#' \item{\code{esc}}{Escore final obtido pelo paciente.} +#' \item{\code{esc}}{Escore final obtido pelo paciente. TODO os escores +#' dessa tabela são que de dias? todos os paciêntes no dia 7?.} #' #' } #' @keywords AAS -#' @source SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 6.15, pg.207. -#' @references ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de -#' episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, -#' controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da -#' UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva +#' @source SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.15, pág. 207. +#' @references ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de +#' episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, +#' controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da +#' UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva #' e Social). #' @examples +#' #' library(lattice) +#' #' data(SoaresTb6.15) -#' -#' SoaresTb6.15$n <- seq(1:16) -#' xyplot(esc~n|grp, data = SoaresTb6.15, -#' type = c('g','b'), -#' xlab = 'Pacientes do ensaio', -#' ylab = 'Escores dos pacientes') -#' +#' str(SoaresTb6.15) +#' +#' xyplot(esc ~ grp, +#' data = SoaresTb6.15, +#' type = c("p", "a"), +#' grid = TRUE, +#' jitter.x = TRUE, +#' xlab = "Tratamento com tieneptina", +#' ylab = "Escores dos pacientes") #' NULL diff --git a/R/SoaresTb6.18.R b/R/SoaresTb6.18.R index 973e7c65..643ec029 100644 --- a/R/SoaresTb6.18.R +++ b/R/SoaresTb6.18.R @@ -1,32 +1,41 @@ #' @name SoaresTb6.18 -#' @title Níveis de colesterol no início e no final do programa. -#' @description O presente estudo teve como objetivo avaliar a -#' efetividade de uma dieta combinada com um programa de exercícios -#' físicos na redução dos níveis de colesterol. Foram registrados os -#' níveis de colesterol no início e no final do programa de 12 +#' @title Níveis de Colesterol no Início e no Final do Programa +#' @description O presente estudo teve como objetivo avaliar a +#' efetividade de uma dieta combinada com um programa de exercícios +#' físicos na redução dos níveis de colesterol. Foram registrados os +#' níveis de colesterol no início e no final do programa de 12 #' participantes. -#' @format Um \code{data.frame} com 24 observações e 2 variáveis. +#' @format Um \code{data.frame} com 24 observações e 2 variáveis, em que #' #' \describe{ #' #' \item{\code{prg}}{Expecificação do programa: início e final.} #' -#' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} +#' \item{\code{col}}{Colesterol dos pacientes.} #' #' } #' @keywords AAS -#' @source Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e -#' Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. -#' Tb 6.18, pg 203. +#' @source SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.18, pág. 203. #' @examples #' #' library(lattice) +#' #' data(SoaresTb6.18) -#' SoaresTb6.18$n <- seq(1:12) -#' xyplot(exp~n|prg, data = SoaresTb6.18, -#' xlab = 'Indivíduos que participaram do programa', -#' ylab = 'Níveis de colesterol') -#' -#' -#' -NULL \ No newline at end of file +#' str(SoaresTb6.18) +#' +#' xyplot(exp ~ prg, +#' data = SoaresTb6.18, +#' type = c("p", "a"), +#' xlab = "Indivíduos que participaram do programa", +#' ylab = "Níveis de colesterol") +#' +NULL + +# TODO: Esses dados parecem ser uma amostra pareada, ou seja, os +# indivíduos foram medidos duas vezes gerando um par de valores (antes, +# depois). Sendo assim, o mais apropriado é ter um data.frame com duas +# colunas, {antes, depois} com os valores de colesterol. Cada linha +# seria um indivíduo. Se os individuos estão na ordem correta, a função +# unstack() faz isso facilmente. +# +# unstack(SoaresTb6.18, exp ~ prg) diff --git a/R/SoaresTb6.20.R b/R/SoaresTb6.20.R index 26bbb703..82151b34 100644 --- a/R/SoaresTb6.20.R +++ b/R/SoaresTb6.20.R @@ -1,42 +1,51 @@ #' @name SoaresTb6.20 -#' @title Escores do grupo tianeptina nos primeiro e ultimos dias. -#' @description A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos -#' tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio -#' clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de -#' comparar a tianeptina com o placebo. O ensaio consistiu em -#' administrar a droga a dois grupos de pacientes, compostos de -#' forma aleatória, e quantificar a depressão através da escala de -#' Montgomery-Asberg (MADRS). Além disso, Rocha verificou se houve -#' diminuição do escore de depressão entre os pacientes de um dos -#' grupos (tianeptina) durante o desenvolvimento do estudo. Os dados -#' apresentados são escores atribuídos a 16 pacientes do grupo -#' tianeptina que foram admitidos em Belo Horizonte no primeiro dia +#' @title Escores do Grupo Tianeptina no Primeiro e Último Dia +#' @description A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos +#' tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio +#' clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de +#' comparar a tianeptina com o placebo. O ensaio consistiu em +#' administrar a droga a dois grupos de pacientes, compostos de +#' forma aleatória, e quantificar a depressão através da escala de +#' Montgomery-Asberg (MADRS). Além disso, Rocha verificou se houve +#' diminuição do escore de depressão entre os pacientes de um dos +#' grupos (tianeptina) durante o desenvolvimento do estudo. Os dados +#' apresentados são escores atribuídos a 16 pacientes do grupo +#' tianeptina que foram admitidos em Belo Horizonte no primeiro dia #' e no último dia. -#' @format Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis. +#' @format Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis, em que #' #' \describe{ #' #' \item{\code{per}}{Período de tempo na qual o dado foi coletado.} #' -#' \item{\code{esc}}{Escore obtido pelo paciente tanto no primeiro dia +#' \item{\code{esc}}{Escore obtido pelo paciente tanto no primeiro dia #' quanto no segundo dia.} #' #' } #' @keywords AAS -#' @source SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 20, pg.207. -#' @references ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de -#' episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, -#' controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da -#' UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva +#' @source SOARES; SIQUEIRA, (2002), tabela 20, pág. 207. +#' @references ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de +#' episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, +#' controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da +#' UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva #' e Social). #' @examples +#' #' library(lattice) -#' -#' SoaresTb6.20$n <- seq(1:16) -#' xyplot(esc~n|per, data = SoaresTb6.20, -#' type = c('g','b'), -#' xlab = 'Pacientes do grupo tianeptina', -#' ylab = 'Escores dos pacientes') -#' -#' -NULL \ No newline at end of file +#' +#' data(SoaresTb6.20) +#' str(SoaresTb6.20) +#' +#' xyplot(esc ~ per, +#' data = SoaresTb6.20, +#' type = c("p", "a"), +#' jitter.x = TRUE, +#' xlab = "Pacientes do grupo tianeptina", +#' ylab = "Escores dos pacientes") +#' +NULL + +# TODO Esse parece ser um dado pareado onde o indivíduo é medido duas +# vezes, no primeiro e no último dia. É mais apropriado representar em +# uma tabela com duas colunas, {primeiro, ultimo}, com os valores para o +# escore sendo que cada linha seria um indivíduo. diff --git a/data-raw/SoaresEx6.19.txt b/data-raw/SoaresEx6.19.txt index 027a4a2e..90bcb286 100644 --- a/data-raw/SoaresEx6.19.txt +++ b/data-raw/SoaresEx6.19.txt @@ -1,4 +1,4 @@ -cm prof exp +cm prof freq suicidio poetas 10 suicidio escritores de ficcao 7 outras poetas 43 diff --git a/data-raw/SoaresEx6.6.txt b/data-raw/SoaresEx6.6.txt index 68df902c..c18a4d0f 100644 --- a/data-raw/SoaresEx6.6.txt +++ b/data-raw/SoaresEx6.6.txt @@ -1,4 +1,4 @@ -hpv exp +hpv tempo com 155 com 150 com 174 diff --git a/data-raw/SoaresTb6.1.txt b/data-raw/SoaresTb6.1.txt index 30a4b8da..bcb99e63 100644 --- a/data-raw/SoaresTb6.1.txt +++ b/data-raw/SoaresTb6.1.txt @@ -1,5 +1,5 @@ -grp;sit;exp -azt;vivo;144 -azt;morto;1 -placebo;vivo;121 -placebo;morto;16 +grp sit freq +azt vivo 144 +azt morto 1 +placebo vivo 121 +placebo morto 16 diff --git a/data/SoaresEx6.19.rda b/data/SoaresEx6.19.rda index d4f3c2c2785c8c8570ffb28fd935a315387e74a6..90faa8c8f6b421440f5d26dc282d690c6541c543 100644 GIT binary patch literal 257 zcmZ>Y%CIzaj8qGb)RARxWnkD;f8qZ(9|i|bLj^Vl2?u@k{|6ix7?>DXH!$32Tve$# zYyJwUSt+-A*%}u+_WG_!V92=aAZfzZtYE^XxoF0$%w@d{3{sg3j4UiAn>aa)rap?? zu(_vS!IAq!c<wn*wRyAk0;3&S0-Aj{K74k1<;r*SZ!<BbxOgzC)+M;;A3M58h09Ze zA=#x}V4}+=o=%o4JCzO!br#Lf{`{{0<14Fo+y0-GkukW-*PhDVzW2=<|DLeLPXiPu ztLr#LURr+Hq<#6!i%g+To2$$?&McoCkm8bQl(6kmAydO<<%m@6KB3y_77d?77Oa2t O&SN>35Nq>-4+{VwwP~vW literal 256 zcmZ>Y%CIzaj8qGboD#B$i-BQN{e}PEd>9-!4HeiJBpmeB?;mhrU|?ck-N108apk0$ zE1w!D`^-u?VQ9iTIp9FXi422=47OPej7qb*sxp@?%eZoYg?;5RVUvk!t0ivQSS{09 ze@#i$h^ef~`1{dMxjT;Me|^_4rYL5leOs8fc;D@1)9f}h1YC4>^w*obsK!Fkm5DpZ zhqZBuC-1T;Mp91U_H7F?S-d*_q_5+yi<{|Z{_IujI{DSj$+MZ;cdIV(Tw=cVnG)|b z?|z5V8uc9CrFPAEaogo(o%Tu|>weB77iK+<znT50pvf`IZJ{Yw3d`s1Y7=A*1quI& OJt^|g$tf`Cga!bw!)m$! diff --git a/data/SoaresEx6.6.rda b/data/SoaresEx6.6.rda index 7bc895cfa34a6cab63018c7b31f7ec31e7597d76..2f55a92ae08f62600be4cd4f330a6aa633980d93 100644 GIT binary patch delta 206 zcmaFN_?(f?DJsL#&@oaiI5N}S&ut=~a{U6I*}f}gTu@)2#vpK5v6q*ZL6Vn&fq_9t zl~vkj*}MrCn0*<{mh~=Qwlas&F<ZKA>Umq$YirK%&a~XLn5VqpxTM>!9o~yIQ`5!2 z{9JxVWw*^k_qP*Ut#3I<-PQ3~*W@d*B*!C3@X@6f6W*>}icDsIoE9#5dsyq=@}G$% z$3qItle>(+{#m~zxr)`r@m=7THIE8}0?RJcD>yj2sw>uhh!0%!Ry5LHH;L0UMev{A Oldgh=3YYrk^Z)>#G*?*w delta 202 zcmaFP_?VH;DJsL#&@oaiIP!C@9Q#B*<@&`AQVbUu7#NrpdwF>oBzYMa7#M_9O_t4@ z{8fRc!Q`tE<16;%%T`)29m>g*ijrsP73Q85{^ZqZAH&~w`%L;@mj^G_N}X^1wsQ3? zm0f=pD1Wv|)QM;?-DxscE>l%ee2F2)hfF6awxhWd8s+UatjV-|IPLr1x^4V1+w><1 zuxc7xOE2nkYhu)x-pt9jfJY}ud!jlkV~EtgHMbot-m2HETT}5`AaM19{*UD<!L6M9 JW)~k6006GeO<e#0 diff --git a/data/SoaresTb6.1.rda b/data/SoaresTb6.1.rda index 7854cdb920e058bb80fa9f1c68b61e4befca437e..dc9d037d3deda1513785ac27b0b4419e1b07077b 100644 GIT binary patch literal 238 zcmZ>Y%CIzaj8qGb?0PX%n1Nya{|Enfc`z_A8Zxjj$T-+9|GU9~!GVE+bpyk-6w}}@ zom=Mhs;N);($*~H_~NJ`lcK=|H8%z(o{I}624A_v*4Dtlz}7HDF-?n!No5J|m!^fL zT&#~7<mVck=$Q6L{)V5CBTLAs^s`)r>rLG)UrsGxSlBYld29S`5ziJ=C#GMX4QmXA z6}McPtk~o|?dB97_MICK{JXVg*U#KtJK`BmmOOcV^+QwQnqUPj6Y&bK<zJew%)P3x x%WwOHbsN6u7zDlW-gk9|#>anIVQMKSPW+ttgq6ud`N!@_nul6i!d*_x004N`X-EJ7 literal 241 zcmZ>Y%CIzaj8qGbjO}Il!oaZp|AYU#JQx@l4H;M%WE||5-~Hgg;K0DZx`E-wgsc9S zW>xy6+B#o$GC8^UN>%TYPl^pD7cMRqoWRQ<C7}}R68LiB5;g`mH|Hz2{FFJh+srK| zoiuv0X@_E@O8>eWC%1h#nI98d@!Uy2b@TUz8P}hFJXLo2n~+DFNW%QDQ&z1qSRBfb z>S-XF<1*n^X5fT_svoy`u`wpROzO`|pEtvLUM2S;omo7mUd?k1Jm<!>tb^O<NV4UX zxm|PC-VcAo9oH(>EzIe&&E(*U%fV_J%IEd&oABACVTp_2o!FBi51ky#OoT500I+Ur A<p2Nx diff --git a/man/SoaresEx6.17.Rd b/man/SoaresEx6.17.Rd index 14be0f5f..736d5c6e 100644 --- a/man/SoaresEx6.17.Rd +++ b/man/SoaresEx6.17.Rd @@ -2,59 +2,57 @@ % Please edit documentation in R/SoaresEx6.17.R \name{SoaresEx6.17} \alias{SoaresEx6.17} -\title{Relação entre a depressão e o desejo pela morte de pacientes - com câncer terminal.} -\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. +\title{Relação entre a Depressão e o Desejo pela Morte de Pacientes + com Câncer Terminal} +\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis, em que \describe{ -\item{\code{dpm}}{Desejo pela morte ausente ou presente nos pacientes +\item{\code{dpm}}{Desejo pela morte ausente ou presente nos pacientes do estudo.} -\item{\code{dpss}}{Depressão presente ou ausente nos pacientes do +\item{\code{dpss}}{Depressão presente ou ausente nos pacientes do estudo.} -\item{exp}{Variável explicativa entre o desejo pela morte e a - depressão.} +\item{freq}{Frequência de casos em cada combinação.} }} \source{ -Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e - Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. - Ex 17, pg 230. +SOARES; SIQUEIRA (2002), exercício 17, pág. 230. } \description{ Um estudo feito por Chochinov et al. (1995) contou com a - participação de 190 pacientes de dois hospitais em Winnipeg, + participação de 190 pacientes de dois hospitais em Winnipeg, Canadá, com diagnóstico primário de câncer terminal, admitidos no - período de coletas de dados. Uma das preocupações era verificar a - existência de relação entre o desejo de morte relatado por alguns + período de coletas de dados. Uma das preocupações era verificar a + existência de relação entre o desejo de morte relatado por alguns deles e a depressão diagnosticada em alguns casos. } \examples{ library(lattice) -data(SoaresEx6.17) -dado <- xtabs(exp ~ dpm + dpss, data = SoaresEx6.17) -barchart(dado, horizontal = FALSE, - stack = FALSE, - scales = list(x = list(labels = c("Ausente","Presente"))), - ylab = "Frequência", - xlab = "Depressão", - main = "Relação entre a depressão e o desejo pela morte de - pacientes com câncer terminal", - auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), - text = c("Desejo pela morte ausente", - 'Desejo pela morte presente'))) +data(SoaresEx6.17) +str(SoaresEx6.17) +names(SoaresEx6.17)[3] <- "freq" +dado <- xtabs(freq ~ dpm + dpss, data = SoaresEx6.17) +mosaicplot(dado) +barchart(dado, + horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales = list(x = list(labels = c("Ausente", "Presente"))), + ylab = "Frequência", + xlab = "Depressão", + auto.key = list(text = c("Desejo pela morte ausente", + "Desejo pela morte presente"))) } \references{ CHOCHINOV, H. M., WILSON, K.G., ENNS, M. et al. Desire - for death in the terminal ill. The American Journal of Psychiatry, - v.152, p.1185-91, 1995. + for death in the terminal ill. \emph{The American Journal of + Psychiatry}, v.152, p.1185-91, 1995. } \keyword{AAS} diff --git a/man/SoaresEx6.18.Rd b/man/SoaresEx6.18.Rd index c8bfa6d7..95a3081d 100644 --- a/man/SoaresEx6.18.Rd +++ b/man/SoaresEx6.18.Rd @@ -2,17 +2,17 @@ % Please edit documentation in R/SoaresEx6.18.R \name{SoaresEx6.18} \alias{SoaresEx6.18} -\title{A transferência do álcool para o leite humano.} -\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 6 variáveis. +\title{A Transferência do Álcool para o Leite Materno} +\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 6 variáveis, em que \describe{ -\item{\code{var}}{Variável analisada no estudo. Neste caso, o leite +\item{\code{var}}{Variável analisada no estudo. Neste caso, o leite ingerido pela criança e o tempo de duração da amamentação.} \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} -\item{\code{ba}}{Bebida alcoólica ingerida ou não ingerida..} +\item{\code{ba}}{Bebida alcoólica ingerida ou não ingerida.} \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores obtidos.} @@ -22,43 +22,47 @@ }} \source{ -SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 18, pg.231. +SOARES; SIQUEIRA, (2002), tabela 18, pág. 231. } \description{ -O consumo de pequenas quantidades de álcool tem sido - recomendado a mulheres que amamentam a fim de ajudar à lactação. +O consumo de pequenas quantidades de álcool tem sido + recomendado a mulheres que amamentam a fim de ajudar à lactação. A ocorrência de alteração nas características sensoriais do leite - ou no comportamento dos lactentes foi objeto de estudo de - Mennella e Beauchamp (1991). Durante dois dias, com intervalo de - uma semana, doze mulheres consumiram suco de laranja puro ou - contendo etanol antes de amamentarem suas crianças e meia-hora + ou no comportamento dos lactentes foi objeto de estudo de + Mennella e Beauchamp (1991). Durante dois dias, com intervalo de + uma semana, doze mulheres consumiram suco de laranja puro ou + contendo etanol antes de amamentarem suas crianças e meia-hora após ter sido obtida uma amostra do leite. Amostras de leite para - o estudo foram obtidas 30 minutos, 1, 2, e 3 horas após o consumo - da bebida, de modo a interromper o mínimo possível a amamentação. + o estudo foram obtidas 30 minutos, 1, 2, e 3 horas após o consumo + da bebida, de modo a interromper o mínimo possível a + amamentação. TODO Não entendi os dados da tabela, não foi + possível associar com o enunciado. } \examples{ library(lattice) + data(SoaresEx6.18) +str(SoaresEx6.18) dados <- xtabs(exp ~ var + ba, data = SoaresEx6.18) -barchart(dados, horizontal = FALSE, - stack = FALSE, - scales = list(x = list(labels = c("Leite ingerido (mL)", - 'Tempo (min)'))), - ylab = "Frequência", - xlab = "Variável", - main = "A transferência do álcool para o leite humano", - auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), - text = c("Bebida alcoólica não ingerida", - 'Bebida alcoólica ingerida'))) +addmargins(dados) +barchart(dados, + horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales = list(x = list(labels = c("Leite ingerido (mL)", + "Tempo (min)"))), + ylab = "Frequência", + xlab = "Variável", + auto.key = list(text = c("Bebida alcoólica não ingerida", + "Bebida alcoólica ingerida"))) } \references{ MENNELLA, J. A., BEAUCHAMP, G. K. The transfer of alcohol - to human milk. The New England Journal of Medicine, v.325, - p.981-5, 1991 . + to human milk. \emph{The New England Journal of Medicine}, v.325, + p.981-5, 1991. } \keyword{AAS} diff --git a/man/SoaresEx6.19.Rd b/man/SoaresEx6.19.Rd index 9f34ce0f..977c3d1e 100644 --- a/man/SoaresEx6.19.Rd +++ b/man/SoaresEx6.19.Rd @@ -2,9 +2,9 @@ % Please edit documentation in R/SoaresEx6.19.R \name{SoaresEx6.19} \alias{SoaresEx6.19} -\title{Incidência de suicídio como causa de morte para poetas e - escritores de ficção.} -\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. +\title{Incidência de Suicídio como Causa de Morte para Poetas e + Escritores de Ficção} +\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis, em que \describe{ @@ -12,47 +12,48 @@ \item{\code{prof}}{Profissão avaliada.} -\item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores obtidos.} +\item{\code{freq}}{Frequência de casos tem cada situação.} }} \source{ -Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e - Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. - Ex.19, cap.6, pg.231. +SOARES; SIQUEIRA (2002), exercício 19, capítulo 6, pág. 231. } \description{ -Em 1992, Ludwig fez um estudo na qual compara o - comportamento criativo e psicopatologico entre diversos grupos - profissionais, a partir de pelo menos um fonte bibliogŕafica bem - documentada e bem estudada. Mais de 1000 personalidades - eminentes, já falecidas e que viveram pelo menos uma parte de suas - vidas no século XX foram divididas em dezenove categorias - profissionais e observações comportamentais. Uma característica - estudada foi a existência de diferenças na psicopatologia para - imigrantes do grupo artístico, tais como poetas e escritores de +Em 1992, Ludwig fez um estudo na qual compara o + comportamento criativo e psicopatológico entre diversos grupos + profissionais, a partir de pelo menos um fonte bibliográfica bem + documentada e bem estudada. Mais de 1000 personalidades + eminentes, já falecidas e que viveram pelo menos uma parte de + suas vidas no século XX foram divididas em dezenove categorias + profissionais e observações comportamentais. Uma característica + estudada foi a existência de diferenças na psicopatologia para + imigrantes do grupo artístico, tais como poetas e escritores de ficção. } \examples{ library(lattice) + data(SoaresEx6.19) -a <- xtabs(exp ~ cm + prof, data = SoaresEx6.19) -barchart(a, horizontal = FALSE, - stack = FALSE, - scales = list(x=list(labels = c("Outras",'Suicídio'))), - ylab = "Frequência", - xlab = "Causa da morte", - main = "Incidência de suicídio como causa de morte para poetas e - escritores de ficção", - auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), - text = c("Escritores de ficção", - 'Poetas'))) +str(SoaresEx6.19) + +a <- xtabs(freq ~ cm + prof, data = SoaresEx6.19) +addmargins(a) + +barchart(a, + horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales = list(x = list(labels = c("Outras", "Suicídio"))), + ylab = "Frequência", + xlab = "Causa da morte", + auto.key = list(text = c("Escritores de ficção", + "Poetas"))) } \references{ -LUDWING, A. M. Creative achievement and psychology: - comparison among professions. The American Journal of - Psychotherapy, v.46, p.330-56, 1992. +LUDWING, A. M. Creative achievement and psychology: + comparison among professions. \emph{The American Journal of + Psychotherapy}, v.46, p.330-56, 1992. } \keyword{AAS} diff --git a/man/SoaresEx6.6.Rd b/man/SoaresEx6.6.Rd index 54645029..05f10608 100644 --- a/man/SoaresEx6.6.Rd +++ b/man/SoaresEx6.6.Rd @@ -2,44 +2,45 @@ % Please edit documentation in R/SoaresEx6.6.R \name{SoaresEx6.6} \alias{SoaresEx6.6} -\title{Presença e ausência da hiperventilação no aumento da - capacidade física.} -\format{Um \code{data.frame} com 18 observações e 2 variáveis. +\title{Presença e Ausência da Hiperventilação no Aumento da + Capacidade Física} +\format{Um \code{data.frame} com 18 observações e 2 variáveis, em que \describe{ \item{\code{hpv}}{Hiperventilação presente ou não presente.} -\item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} +\item{\code{tempo}}{Tempo para completar a corrida de 800 metros, em + segundos.} }} \source{ -Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e - Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. - Ex.6, cap.6, pg.223. +SOARES; SIQUEIRA (2002), exercício 6, capítulo 6, pág. 223. } \description{ -Nove indivíduos do sexo masculino, sadios, com idade - média de 21 anos participaram, voluntariamente, de uma pesquisa - cujo objetivo era verificar se a alcalose respiratória, induzida - por hiperventilação voluntária, aumenta a capacidade física - avaliada pelo tempo de corrida de 800 metros. Nesse estudo, os - nove indivíduos participaram da corrida de 800 metros em 2 - momentos: um deles em condições normais (sem hiperventilação) e +Nove indivíduos do sexo masculino, sadios, com idade + média de 21 anos participaram, voluntariamente, de uma pesquisa + cujo objetivo era verificar se a alcalose respiratória, induzida + por hiperventilação voluntária, aumenta a capacidade física + avaliada pelo tempo de corrida de 800 metros. Nesse estudo, os + nove indivíduos participaram da corrida de 800 metros em 2 + momentos: um deles em condições normais (sem hiperventilação) e no outro após a hiperentilação voluntária. } \examples{ library(lattice) -data(SoaresEx6.6) -SoaresEx6.6$n <- seq(1:9) -xyplot(exp~n|hpv, data = SoaresEx6.6, - type = c('g','b'), - xlab = 'Indivíduos que participaram da pesquisa', - ylab = 'Valores observados', - main = "Presença e ausência da hiperventilação no aumento da - capacidade física") +data(SoaresEx6.6) +str(SoaresEx6.6) + +xyplot(tempo ~ hpv, + data = SoaresEx6.6, + type = c("p", "a"), + grid = TRUE, + jitter.x = TRUE, + xlab = "Hiperventilação", + ylab = "Tempo na corrida de 800 metros (s)") } \keyword{AAS} diff --git a/man/SoaresTb6.1.Rd b/man/SoaresTb6.1.Rd index b6bcb607..dce1b501 100644 --- a/man/SoaresTb6.1.Rd +++ b/man/SoaresTb6.1.Rd @@ -2,57 +2,55 @@ % Please edit documentation in R/SoaresTb6.1.R \name{SoaresTb6.1} \alias{SoaresTb6.1} -\title{Número de pacientes tratados com AZT ou placebo.} -\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis. +\title{Sobreviência de Pacientes Tratados com AZT ou Placebo} +\format{Um \code{data.frame} com 4 observações e 3 variáveis, em que \describe{ -\item{\code{grp}}{Grupo de pacientes que receberam o zidozudina - (AZT) ou placebo.} +\item{\code{grp}}{Grupo de pacientes que receberam o zidozudina (AZT) + ou placebo.} -\item{\code{sit}}{Situação dos pacientes com AIDS após o uso dos +\item{\code{sit}}{Situação dos pacientes com AIDS após o uso dos fármacos no que diz respeito ao prolongamento de suas vidas.} -\item{exp}{Variável explicativa dos valores obtidos.} +\item{freq}{Número de casos em cada situação.} }} \source{ -Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e - Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. - Tb 6.1, pg 177. +SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.1, pág. 177. } \description{ -Em 1987, FISCHL publicou o primeiro relato de um ensaio +Em 1987, FISCHL publicou o primeiro relato de um ensaio clínico que comprovou a eficácia do fármaco zidovudina (AZT) para - prolongar a vida de pacientes com AIDS. Na tabela é apresentado - os dados entre a relação dos pacientes que receberam o AZT e o + prolongar a vida de pacientes com AIDS. Na tabela é apresentado + os dados entre a relação dos pacientes que receberam o AZT e o placebo e permaneceram vivos ou mortos durante o experimento. } \examples{ library(lattice) -data(SoaresTb6.1) -dados <- xtabs(exp ~ grp + sit, data = SoaresTb6.1) -barchart(dados, horizontal = FALSE, - stack = FALSE, - scales=list(x=list(labels=c("AZT","Placebo"))), - ylab = "Frequência", - xlab = "Grupo", - main = "Número de pacientes tratados com AZT ou placebo", - auto.key = list(corner = c(0.95, 0.95), - text = c("Morto", - 'Vivo'))) +data(SoaresTb6.1) +str(SoaresTb6.1) +dados <- xtabs(freq ~ grp + sit, data = SoaresTb6.1) +addmargins(dados) +barchart(dados, + horizontal = FALSE, + stack = FALSE, + scales = list(x = list(labels = c("AZT", "Placebo"))), + ylab = "Frequência", + xlab = "Grupo", + auto.key = list(text = c("Morto", "Vivo"))) } \references{ -FISCHL, M. A., RICHMAN, D. D., GRIECO, M. H. et al. The - efficacy of azidothymidine (AZT) in treatment of patients with +FISCHL, M. A., RICHMAN, D. D., GRIECO, M. H. et al. The + efficacy of azidothymidine (AZT) in treatment of patients with AIDS and AIDS-related complez. A doubleblind, placebo-controlled - trial. The New England Journal of Medicine, v.317, n.4 p.185-91, - 1987. + trial. \emph{The New England Journal of Medicine}, v.317, n.4 + p.185-91, 1987. } \keyword{AAS} diff --git a/man/SoaresTb6.15.Rd b/man/SoaresTb6.15.Rd index 0d514507..9649f510 100644 --- a/man/SoaresTb6.15.Rd +++ b/man/SoaresTb6.15.Rd @@ -2,49 +2,55 @@ % Please edit documentation in R/SoaresTb6.15.R \name{SoaresTb6.15} \alias{SoaresTb6.15} -\title{Escore final na escala MADRS de pacientes dos dois grupos - admitidos em Belo Horizonte.} -\format{Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis. +\title{Escore Final na Escala MADRS de Pacientes dos Dois Grupos + Admitidos Tratados com Tianeptina} +\format{Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis, em que \describe{ -\item{\code{grp}}{Grupos de pacientes.} +\item{\code{grp}}{Grupos de pacientes segundo recebimento da + tieneptina.} -\item{\code{esc}}{Escore final obtido pelo paciente.} +\item{\code{esc}}{Escore final obtido pelo paciente. TODO os escores + dessa tabela são que de dias? todos os paciêntes no dia 7?.} }} \source{ -SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 6.15, pg.207. +SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.15, pág. 207. } \description{ -A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos - tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio - clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de - comparar a tianeptina com o placebo. Participaram deste ensaio - pacientes de Belo Horizonte, Rio de Janeiro, e Campinas. O ensaio - consistiu em administrar a droga a dois grupos de pacientes, - compostos de forma aleatória, e quantificar a depressão através - da escala de Montgomery-Asberg (MADRS), em que os valores maiores - indicam maior gravidade da depressão. O escore foi obtido para +A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos + tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio + clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de + comparar a tianeptina com o placebo. Participaram deste ensaio + pacientes de Belo Horizonte, Rio de Janeiro, e Campinas. O ensaio + consistiu em administrar a droga a dois grupos de pacientes, + compostos de forma aleatória, e quantificar a depressão através + da escala de Montgomery-Asberg (MADRS), em que os valores maiores + indicam maior gravidade da depressão. O escore foi obtido para cada paciente 7, 14, 21, 28 e 42 dias após o início do ensaio. } \examples{ + library(lattice) -data(SoaresTb6.15) -SoaresTb6.15$n <- seq(1:16) -xyplot(esc~n|grp, data = SoaresTb6.15, - type = c('g','b'), - xlab = 'Pacientes do ensaio', - ylab = 'Escores dos pacientes') +data(SoaresTb6.15) +str(SoaresTb6.15) +xyplot(esc ~ grp, + data = SoaresTb6.15, + type = c("p", "a"), + grid = TRUE, + jitter.x = TRUE, + xlab = "Tratamento com tieneptina", + ylab = "Escores dos pacientes") } \references{ -ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de - episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, - controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da - UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva +ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de + episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, + controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da + UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva e Social). } \keyword{AAS} diff --git a/man/SoaresTb6.18.Rd b/man/SoaresTb6.18.Rd index 5d74392d..b338ece6 100644 --- a/man/SoaresTb6.18.Rd +++ b/man/SoaresTb6.18.Rd @@ -2,38 +2,38 @@ % Please edit documentation in R/SoaresTb6.18.R \name{SoaresTb6.18} \alias{SoaresTb6.18} -\title{Níveis de colesterol no início e no final do programa.} -\format{Um \code{data.frame} com 24 observações e 2 variáveis. +\title{Níveis de Colesterol no Início e no Final do Programa} +\format{Um \code{data.frame} com 24 observações e 2 variáveis, em que \describe{ \item{\code{prg}}{Expecificação do programa: início e final.} -\item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} +\item{\code{col}}{Colesterol dos pacientes.} }} \source{ -Introdução à estatística médica/José Francisco Soares e - Arminda lucia Siqueira. 2.ed. Belo Horizonte: COOPMED, 2002. - Tb 6.18, pg 203. +SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.18, pág. 203. } \description{ -O presente estudo teve como objetivo avaliar a - efetividade de uma dieta combinada com um programa de exercícios - físicos na redução dos níveis de colesterol. Foram registrados os - níveis de colesterol no início e no final do programa de 12 +O presente estudo teve como objetivo avaliar a + efetividade de uma dieta combinada com um programa de exercícios + físicos na redução dos níveis de colesterol. Foram registrados os + níveis de colesterol no início e no final do programa de 12 participantes. } \examples{ library(lattice) -data(SoaresTb6.18) -SoaresTb6.18$n <- seq(1:12) -xyplot(exp~n|prg, data = SoaresTb6.18, - xlab = 'Indivíduos que participaram do programa', - ylab = 'Níveis de colesterol') +data(SoaresTb6.18) +str(SoaresTb6.18) +xyplot(exp ~ prg, + data = SoaresTb6.18, + type = c("p", "a"), + xlab = "Indivíduos que participaram do programa", + ylab = "Níveis de colesterol") } \keyword{AAS} diff --git a/man/SoaresTb6.20.Rd b/man/SoaresTb6.20.Rd index 3aaf179a..6c25dbdf 100644 --- a/man/SoaresTb6.20.Rd +++ b/man/SoaresTb6.20.Rd @@ -2,50 +2,54 @@ % Please edit documentation in R/SoaresTb6.20.R \name{SoaresTb6.20} \alias{SoaresTb6.20} -\title{Escores do grupo tianeptina nos primeiro e ultimos dias.} -\format{Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis. +\title{Escores do Grupo Tianeptina no Primeiro e Último Dia} +\format{Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis, em que \describe{ \item{\code{per}}{Período de tempo na qual o dado foi coletado.} -\item{\code{esc}}{Escore obtido pelo paciente tanto no primeiro dia +\item{\code{esc}}{Escore obtido pelo paciente tanto no primeiro dia quanto no segundo dia.} }} \source{ -SOARES; SIQUEIRA, (2002), Tb 20, pg.207. +SOARES; SIQUEIRA, (2002), tabela 20, pág. 207. } \description{ -A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos - tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio - clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de - comparar a tianeptina com o placebo. O ensaio consistiu em - administrar a droga a dois grupos de pacientes, compostos de - forma aleatória, e quantificar a depressão através da escala de - Montgomery-Asberg (MADRS). Além disso, Rocha verificou se houve - diminuição do escore de depressão entre os pacientes de um dos - grupos (tianeptina) durante o desenvolvimento do estudo. Os dados - apresentados são escores atribuídos a 16 pacientes do grupo - tianeptina que foram admitidos em Belo Horizonte no primeiro dia +A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos + tricíclicos. Rocha (1995) relata os resultados de um ensaio + clínico aleatorizado, duplo-cego, realizado com o objetivo de + comparar a tianeptina com o placebo. O ensaio consistiu em + administrar a droga a dois grupos de pacientes, compostos de + forma aleatória, e quantificar a depressão através da escala de + Montgomery-Asberg (MADRS). Além disso, Rocha verificou se houve + diminuição do escore de depressão entre os pacientes de um dos + grupos (tianeptina) durante o desenvolvimento do estudo. Os dados + apresentados são escores atribuídos a 16 pacientes do grupo + tianeptina que foram admitidos em Belo Horizonte no primeiro dia e no último dia. } \examples{ + library(lattice) -SoaresTb6.20$n <- seq(1:16) -xyplot(esc~n|per, data = SoaresTb6.20, - type = c('g','b'), - xlab = 'Pacientes do grupo tianeptina', - ylab = 'Escores dos pacientes') +data(SoaresTb6.20) +str(SoaresTb6.20) +xyplot(esc ~ per, + data = SoaresTb6.20, + type = c("p", "a"), + jitter.x = TRUE, + xlab = "Pacientes do grupo tianeptina", + ylab = "Escores dos pacientes") } \references{ -ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de - episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, - controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da - UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva +ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de + episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, + controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da + UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva e Social). } \keyword{AAS} -- GitLab From e2e62b9e0eefef17c294fbb350d2b8a834b4e630 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Vinicius <vinicius.cesar.pedroso@gmail.com> Date: Wed, 26 Oct 2016 16:06:58 -0200 Subject: [PATCH 14/14] Adiciona correcoes feitas --- R/SoaresEx6.17.R | 2 +- R/SoaresEx6.18.R | 19 +++++++++------ R/SoaresTb6.1.R | 2 +- R/SoaresTb6.15.R | 7 +++--- R/SoaresTb6.18.R | 19 ++++----------- R/SoaresTb6.20.R | 13 +++------- data-raw/SoaresTb6.18.txt | 38 ++++++++++------------------- data-raw/SoaresTb6.20.txt | 50 +++++++++++++------------------------- data/SoaresTb6.18.rda | Bin 270 -> 205 bytes data/SoaresTb6.20.rda | Bin 269 -> 196 bytes man/SoaresEx6.17.Rd | 2 +- man/SoaresTb6.1.Rd | 2 +- man/SoaresTb6.15.Rd | 7 +++--- man/SoaresTb6.18.Rd | 8 +++--- man/SoaresTb6.20.Rd | 9 +++---- 15 files changed, 68 insertions(+), 110 deletions(-) diff --git a/R/SoaresEx6.17.R b/R/SoaresEx6.17.R index 213b8779..b6a74eae 100644 --- a/R/SoaresEx6.17.R +++ b/R/SoaresEx6.17.R @@ -17,7 +17,7 @@ #' \item{\code{dpss}}{Depressão presente ou ausente nos pacientes do #' estudo.} #' -#' \item{freq}{Frequência de casos em cada combinação.} +#' \item{\code{freq}}{Frequência de casos em cada combinação.} #' #' } #' @keywords AAS diff --git a/R/SoaresEx6.18.R b/R/SoaresEx6.18.R index ff9e5f04..aeae829f 100644 --- a/R/SoaresEx6.18.R +++ b/R/SoaresEx6.18.R @@ -6,12 +6,14 @@ #' ou no comportamento dos lactentes foi objeto de estudo de #' Mennella e Beauchamp (1991). Durante dois dias, com intervalo de #' uma semana, doze mulheres consumiram suco de laranja puro ou -#' contendo etanol antes de amamentarem suas crianças e meia-hora -#' após ter sido obtida uma amostra do leite. Amostras de leite para -#' o estudo foram obtidas 30 minutos, 1, 2, e 3 horas após o consumo -#' da bebida, de modo a interromper o mínimo possível a -#' amamentação. TODO Não entendi os dados da tabela, não foi -#' possível associar com o enunciado. +#' contendo etanol (0.3 g/Kg de massa corporal) antes de amamentarem +#' suas crianças e meia-hora após ter sido obtida uma amostra do +#' leite. Metade das mulheres bebeu o etanol no suco de laranja no +#' primeiro dia de teste e o suco de laranja puro no segundo. A +#' ordem foi invertida para as seis mulheres remanescentes. Amostras +#' de leite para o estudo foram obtidas 30 minutos, 1, 2, e 3 horas +#' após o consumo da bebida, de modo a interromper o mínimo possível +#' a amamentação. #' @format Um \code{data.frame} com 4 observações e 6 variáveis, em que #' #' \describe{ @@ -19,7 +21,8 @@ #' \item{\code{var}}{Variável analisada no estudo. Neste caso, o leite #' ingerido pela criança e o tempo de duração da amamentação.} #' -#' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores.} +#' \item{\code{exp}}{Variável explicativa com os valores em ml diante do +#' leite ingerido e em minutos para o tempo.} #' #' \item{\code{ba}}{Bebida alcoólica ingerida ou não ingerida.} #' @@ -31,7 +34,7 @@ #' #' } #' @keywords AAS -#' @source SOARES; SIQUEIRA, (2002), tabela 18, pág. 231. +#' @source SOARES; SIQUEIRA, (2002), tabela 18, pág. 230. #' @references MENNELLA, J. A., BEAUCHAMP, G. K. The transfer of alcohol #' to human milk. \emph{The New England Journal of Medicine}, v.325, #' p.981-5, 1991. diff --git a/R/SoaresTb6.1.R b/R/SoaresTb6.1.R index cda42424..78b24944 100644 --- a/R/SoaresTb6.1.R +++ b/R/SoaresTb6.1.R @@ -18,7 +18,7 @@ #' \item{freq}{Número de casos em cada situação.} #' #' } -#' @keywords AAS +#' @keywords TC #' @source SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.1, pág. 177. #' @references FISCHL, M. A., RICHMAN, D. D., GRIECO, M. H. et al. The #' efficacy of azidothymidine (AZT) in treatment of patients with diff --git a/R/SoaresTb6.15.R b/R/SoaresTb6.15.R index 4fcc2ab0..bdc5546f 100644 --- a/R/SoaresTb6.15.R +++ b/R/SoaresTb6.15.R @@ -18,12 +18,11 @@ #' \item{\code{grp}}{Grupos de pacientes segundo recebimento da #' tieneptina.} #' -#' \item{\code{esc}}{Escore final obtido pelo paciente. TODO os escores -#' dessa tabela são que de dias? todos os paciêntes no dia 7?.} +#' \item{\code{esc}}{Escore final obtido pelo paciente após os 42 dias.} #' #' } -#' @keywords AAS -#' @source SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.15, pág. 207. +#' @keywords TC +#' @source SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.15, pág. 197. #' @references ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de #' episódios depressivos maiores: estudo multicêntrico, duplo-cego, #' controlado com placebo. Belo Horizonte: Faculdade de Medicina da diff --git a/R/SoaresTb6.18.R b/R/SoaresTb6.18.R index 643ec029..f2a2ff2e 100644 --- a/R/SoaresTb6.18.R +++ b/R/SoaresTb6.18.R @@ -5,16 +5,16 @@ #' físicos na redução dos níveis de colesterol. Foram registrados os #' níveis de colesterol no início e no final do programa de 12 #' participantes. -#' @format Um \code{data.frame} com 24 observações e 2 variáveis, em que +#' @format Um \code{data.frame} com 12 observações e 2 variáveis, em que #' #' \describe{ #' -#' \item{\code{prg}}{Expecificação do programa: início e final.} +#' \item{\code{inicio}}{Nível do colesterol no início do programa.} #' -#' \item{\code{col}}{Colesterol dos pacientes.} +#' \item{\code{final}}{Nível do colesterol no final do programa.} #' #' } -#' @keywords AAS +#' @keywords TC #' @source SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.18, pág. 203. #' @examples #' @@ -23,19 +23,10 @@ #' data(SoaresTb6.18) #' str(SoaresTb6.18) #' -#' xyplot(exp ~ prg, +#' xyplot(final ~ inicio, #' data = SoaresTb6.18, #' type = c("p", "a"), #' xlab = "Indivíduos que participaram do programa", #' ylab = "Níveis de colesterol") #' NULL - -# TODO: Esses dados parecem ser uma amostra pareada, ou seja, os -# indivíduos foram medidos duas vezes gerando um par de valores (antes, -# depois). Sendo assim, o mais apropriado é ter um data.frame com duas -# colunas, {antes, depois} com os valores de colesterol. Cada linha -# seria um indivíduo. Se os individuos estão na ordem correta, a função -# unstack() faz isso facilmente. -# -# unstack(SoaresTb6.18, exp ~ prg) diff --git a/R/SoaresTb6.20.R b/R/SoaresTb6.20.R index 82151b34..5a5b0f90 100644 --- a/R/SoaresTb6.20.R +++ b/R/SoaresTb6.20.R @@ -12,14 +12,13 @@ #' apresentados são escores atribuídos a 16 pacientes do grupo #' tianeptina que foram admitidos em Belo Horizonte no primeiro dia #' e no último dia. -#' @format Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis, em que +#' @format Um \code{data.frame} com 16 observações e 2 variáveis, em que #' #' \describe{ #' -#' \item{\code{per}}{Período de tempo na qual o dado foi coletado.} +#' \item{\code{pd}}{Escore obtido pelo paciente no primeiro dia.} #' -#' \item{\code{esc}}{Escore obtido pelo paciente tanto no primeiro dia -#' quanto no segundo dia.} +#' \item{\code{ud}}{Escore obtido pelo paciente no último dia.} #' #' } #' @keywords AAS @@ -36,7 +35,7 @@ #' data(SoaresTb6.20) #' str(SoaresTb6.20) #' -#' xyplot(esc ~ per, +#' xyplot(ud ~ pd, #' data = SoaresTb6.20, #' type = c("p", "a"), #' jitter.x = TRUE, @@ -45,7 +44,3 @@ #' NULL -# TODO Esse parece ser um dado pareado onde o indivíduo é medido duas -# vezes, no primeiro e no último dia. É mais apropriado representar em -# uma tabela com duas colunas, {primeiro, ultimo}, com os valores para o -# escore sendo que cada linha seria um indivíduo. diff --git a/data-raw/SoaresTb6.18.txt b/data-raw/SoaresTb6.18.txt index 329db27c..55dee0ce 100644 --- a/data-raw/SoaresTb6.18.txt +++ b/data-raw/SoaresTb6.18.txt @@ -1,25 +1,13 @@ -prg exp -inicio 201 -inicio 231 -inicio 221 -inicio 260 -inicio 228 -inicio 237 -inicio 326 -inicio 235 -inicio 240 -inicio 267 -inicio 284 -inicio 201 -final 200 -final 236 -final 216 -final 233 -final 224 -final 216 -final 296 -final 195 -final 207 -final 247 -final 210 -final 209 +inicio final +201 200 +231 236 +221 216 +260 233 +228 224 +237 216 +326 296 +235 195 +240 207 +267 247 +284 210 +201 209 diff --git a/data-raw/SoaresTb6.20.txt b/data-raw/SoaresTb6.20.txt index ead48b04..cf892c51 100644 --- a/data-raw/SoaresTb6.20.txt +++ b/data-raw/SoaresTb6.20.txt @@ -1,33 +1,17 @@ -per esc -primeiro dia 24 -primeiro dia 46 -primeiro dia 26 -primeiro dia 44 -primeiro dia 27 -primeiro dia 34 -primeiro dia 33 -primeiro dia 25 -primeiro dia 35 -primeiro dia 30 -primeiro dia 38 -primeiro dia 38 -primeiro dia 31 -primeiro dia 27 -primeiro dia 34 -primeiro dia 32 -ultimo dia 6 -ultimo dia 33 -ultimo dia 21 -ultimo dia 26 -ultimo dia 10 -ultimo dia 29 -ultimo dia 33 -ultimo dia 29 -ultimo dia 37 -ultimo dia 15 -ultimo dia 2 -ultimo dia 21 -ultimo dia 7 -ultimo dia NA -ultimo dia NA -ultimo dia 26 +pd ud +24 6 +46 33 +26 21 +44 26 +27 10 +34 29 +33 33 +25 29 +35 37 +30 15 +38 2 +38 21 +31 7 +27 +34 +32 26 diff --git a/data/SoaresTb6.18.rda b/data/SoaresTb6.18.rda index 0cb2369dff5d0a3464d87c612212ef6e4f1ebd95..495b541525cf3df45de1d3b1112229286c6b4025 100644 GIT binary patch literal 205 zcmZ>Y%CIzaj8qGbydR#e$G}ikfBe6l2MdFvp#v*}jDx-UoCXI5j)V<PF6&$x7cg}3 z3Mos?<dx!OT)=SI+1J1}Kvht2;R3d{UIt#1lZzb~7M0wK<~J=6YW&o@mHqv`+CMja zE??|?zp-Y~%r{;o6V{qrO<~fzU$sL)?dX{`U)F|X@GsI}T<Idg)!dtqa-yTU*GGbJ zD!<T@-m|a59zMV28Fa+3Pip0+)`b>FxV<h38^vy$B6#fW)osi?Jkm-m?2nb%|HPgY MdFbR^8@px)0FruAsQ>@~ literal 270 zcmZ>Y%CIzaj8qGb{Ma?Wk%8g#|LgzjJX{<c4INk+WE||5-#y^Kz`(?ju))dYokQaW zhFfdfI@KB&7&3Sn7&5-vI{U8NYU{LorIf9j;$((d%)SPU5^4^%3P}?gG8dR!U;qJ= zWKIr?CI|7@NjFLlN;22V?4QEn%wJG>_RoXgkFOtpc66Tnn)qo^aYhOfcSWRLGRQw@ z=<U6<JS>Gl;o(Um*%_A{wlLOA>0+7KDiGnsu*5mnK<t77%NOT16-j1;);V11ne!&C zEZ<Yu7<g3rnby)mGil?SKaM<(`ew#+@k4uCxS?pnS)B-t@+TtaXU`N!5n^WPOlGgy Zy@o}pqeEzh<e%7+A`hLMk7?Dh008U6Y9s&v diff --git a/data/SoaresTb6.20.rda b/data/SoaresTb6.20.rda index 3f3362333d400db8a984f195c5abb109ef8d2e5d..045371cec26dd456f814b60d4e5cdf05868f43ea 100644 GIT binary patch literal 196 zcmZ>Y%CIzaj8qGbJlFoqfPrCB{el16PF4SA4P;<pka4hQzt`Zv;J~<mp_A9w)TH0z z@|6se%g(157^I}HGI=_hFff?NEnuANkh$>7)q*)MlllT)iYe{d{X}cgy<}c?Z_f>< z*$qFmvV3n}C!SDJQd?!BJ2z<-qheOViL=}<YIrjZIEob?qzLT$#Hw77$iHDhBD-YW zrEZr?cPAGwUDSDg^7-&7-X1H})|Kj=%~`7ab1^3~&ulCC$1L1Gc2Ckg)Y4XBf3X1o Dz4uY8 literal 269 zcmZ>Y%CIzaj8qGb<c(rl%)s!a{^0*@r>cLm1~RZP$T--m-*0eWaA06y+`w>awt$AR zTbr-RS4l(Ll}5Y_QYnd|W{WvzGD<LTwn$|*RY`G*Xc_yuotW2h;bg~Ug|ub<!Gg>6 zZY)_6aO}a670bk{xJxeho$lH5Dlz?AL~(kYXXlZr@|hXGMAEi4o!xS2(%;?D(hM$+ zArkWL{D*B%u(-<QOm_LuvDU&vY)TuaF0Y2-0%<S9CYIc~vw}%EK^Ydj%8&BO);_-* z8(mr%p7{G``-F>Lp(gLV4+oe%Vsf$XTgATF<^{)TvjW+xO=_tutIzgc+~h44n4yrv a$7<ZEcQ={oW8*!&CtU>#6{NPXx&Z(taBLU= diff --git a/man/SoaresEx6.17.Rd b/man/SoaresEx6.17.Rd index 736d5c6e..5365fa9d 100644 --- a/man/SoaresEx6.17.Rd +++ b/man/SoaresEx6.17.Rd @@ -14,7 +14,7 @@ \item{\code{dpss}}{Depressão presente ou ausente nos pacientes do estudo.} -\item{freq}{Frequência de casos em cada combinação.} +\item{\code{freq}}{Frequência de casos em cada combinação.} }} \source{ diff --git a/man/SoaresTb6.1.Rd b/man/SoaresTb6.1.Rd index dce1b501..2ced6ba3 100644 --- a/man/SoaresTb6.1.Rd +++ b/man/SoaresTb6.1.Rd @@ -52,5 +52,5 @@ FISCHL, M. A., RICHMAN, D. D., GRIECO, M. H. et al. The trial. \emph{The New England Journal of Medicine}, v.317, n.4 p.185-91, 1987. } -\keyword{AAS} +\keyword{TC} diff --git a/man/SoaresTb6.15.Rd b/man/SoaresTb6.15.Rd index 9649f510..d70c593c 100644 --- a/man/SoaresTb6.15.Rd +++ b/man/SoaresTb6.15.Rd @@ -11,12 +11,11 @@ \item{\code{grp}}{Grupos de pacientes segundo recebimento da tieneptina.} -\item{\code{esc}}{Escore final obtido pelo paciente. TODO os escores - dessa tabela são que de dias? todos os paciêntes no dia 7?.} +\item{\code{esc}}{Escore final obtido pelo paciente após os 42 dias.} }} \source{ -SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.15, pág. 207. +SOARES; SIQUEIRA (2002), tabela 6.15, pág. 197. } \description{ A tianeptina é um fármaco antidepressivo do grupo dos @@ -53,5 +52,5 @@ ROCHA. F. L. Eficácia e tolerabilidade no tratamento de UFMG, 1995. 156 p. (Dissertação, Mestrado em Medicina Preventiva e Social). } -\keyword{AAS} +\keyword{TC} diff --git a/man/SoaresTb6.18.Rd b/man/SoaresTb6.18.Rd index b338ece6..dbb6d975 100644 --- a/man/SoaresTb6.18.Rd +++ b/man/SoaresTb6.18.Rd @@ -3,13 +3,13 @@ \name{SoaresTb6.18} \alias{SoaresTb6.18} \title{Níveis de Colesterol no Início e no Final do Programa} -\format{Um \code{data.frame} com 24 observações e 2 variáveis, em que +\format{Um \code{data.frame} com 12 observações e 2 variáveis, em que \describe{ -\item{\code{prg}}{Expecificação do programa: início e final.} +\item{\code{inicio}}{Nível do colesterol no início do programa.} -\item{\code{col}}{Colesterol dos pacientes.} +\item{\code{final}}{Nível do colesterol no final do programa.} }} \source{ @@ -36,5 +36,5 @@ xyplot(exp ~ prg, ylab = "Níveis de colesterol") } -\keyword{AAS} +\keyword{TC} diff --git a/man/SoaresTb6.20.Rd b/man/SoaresTb6.20.Rd index 6c25dbdf..b0f8dbb6 100644 --- a/man/SoaresTb6.20.Rd +++ b/man/SoaresTb6.20.Rd @@ -3,14 +3,13 @@ \name{SoaresTb6.20} \alias{SoaresTb6.20} \title{Escores do Grupo Tianeptina no Primeiro e Último Dia} -\format{Um \code{data.frame} com 32 observações e 2 variáveis, em que +\format{Um \code{data.frame} com 16 observações e 2 variáveis, em que \describe{ -\item{\code{per}}{Período de tempo na qual o dado foi coletado.} +\item{\code{pd}}{Escore obtido pelo paciente no primeiro dia.} -\item{\code{esc}}{Escore obtido pelo paciente tanto no primeiro dia - quanto no segundo dia.} +\item{\code{ud}}{Escore obtido pelo paciente no último dia.} }} \source{ @@ -37,7 +36,7 @@ library(lattice) data(SoaresTb6.20) str(SoaresTb6.20) -xyplot(esc ~ per, +xyplot(ud ~ pd, data = SoaresTb6.20, type = c("p", "a"), jitter.x = TRUE, -- GitLab