From 62bf0d45b7e5ee672d2eff4bfd9448d7cc0608bf Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Jhenifer Caetano <jhenicaet@gmail.com> Date: Sun, 11 Sep 2016 11:19:18 -0300 Subject: [PATCH 1/7] Adiciona pacote vcd --- DESCRIPTION | 3 ++- 1 file changed, 2 insertions(+), 1 deletion(-) diff --git a/DESCRIPTION b/DESCRIPTION index 4092c831..030f2000 100644 --- a/DESCRIPTION +++ b/DESCRIPTION @@ -43,6 +43,7 @@ Suggests: reshape2, MASS, qcc, - multcomp + multcomp, + vcd VignetteBuilder: knitr RoxygenNote: 5.0.1 -- GitLab From 8f8e7b4bd4eaf57536115b35f0e06e508fcffe76 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Eduardo Junior <edujrrib@gmail.com> Date: Sat, 17 Sep 2016 12:39:21 -0300 Subject: [PATCH 2/7] Interrompe script se devtools::check der erro --- .build_package.R | 15 ++++++++++----- 1 file changed, 10 insertions(+), 5 deletions(-) diff --git a/.build_package.R b/.build_package.R index 96db031e..b242ed12 100755 --- a/.build_package.R +++ b/.build_package.R @@ -51,10 +51,15 @@ if (length(list.files("./vignettes"))) { #-------------------------------------------- # Checar conteúdo e organização do pacote. -check(cleanup = FALSE, - manual = TRUE, - vignettes = FALSE, - check_dir = "../") +checagem <- check(cleanup = FALSE, + manual = TRUE, + vignettes = FALSE, + check_dir = "../") + +if (length(checagem$errors) > 0) { + cat(checagem$errors, sep = "\n") + stop("Falha ao checar o pacote") +} #-------------------------------------------- # Construir pacote. @@ -75,4 +80,4 @@ install() unlink(lib, recursive = TRUE) -#-------------------------------------------- \ No newline at end of file +#-------------------------------------------- -- GitLab From 8996a33a45997d921b3768e9b66f9d03581f0ce9 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Jhenifer Caetano <jhenicaet@gmail.com> Date: Mon, 10 Oct 2016 18:51:18 -0300 Subject: [PATCH 3/7] Adiciona tabela PaulinoEx9.29 ao pacote --- R/PaulinoEx9.29.R | 44 ++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/PaulinoEx9.29.txt | 13 +++++++++ data/PaulinoEx9.29.rda | Bin 0 -> 271 bytes man/PaulinoEx9.29.Rd | 53 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 4 files changed, 110 insertions(+) create mode 100644 R/PaulinoEx9.29.R create mode 100644 data-raw/PaulinoEx9.29.txt create mode 100644 data/PaulinoEx9.29.rda create mode 100644 man/PaulinoEx9.29.Rd diff --git a/R/PaulinoEx9.29.R b/R/PaulinoEx9.29.R new file mode 100644 index 00000000..8517d3f1 --- /dev/null +++ b/R/PaulinoEx9.29.R @@ -0,0 +1,44 @@ +#' @name PaulinoEx9.29 +#' @title ???? +#' @description Em um estudo sobre a avaliação de políciais militares +#' brancos por soldados americanos negros na Segunda Guerra Mundial, +#' a resposta de cada soldado foi categorizada nos níveis 1 (quase +#' sempre imparcial), 2 (parcial e imparcial em proporções iguais) e +#' 3 (quase sempre parcial) +#' @format Um \code{data.frame} com 12 observações e 4 variáveis, em que +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{orig}}{Região de origem (Norte ou Sul).} +#' +#' \item{\code{unid}}{Região da unidade (Norte ou Sul).} +#' +#' \item{\code{condu}}{Avaliação da conduta. (1, 2, ou 3)} +#' +#' \item{\code{freq}}{Frequências observadas.} +#' +#' } +#' @keywords TC multinomial +#' @source PAULINO; SINGER (2006), Exercício 9.29, pág. 343. +#' @examples +#' +#' data(PaulinoEx9.29) +#' +#' str(PaulinoEx9.29) +#' +#' xt <- xtabs(freq ~ ., data = PaulinoEx9.29) +#' ftable(xt) +#' +#' library(lattice) +#' +#' barchart(xt, +#' horizontal = FALSE, +#' beside = FALSE, +#' stack = FALSE, +#' auto.key = list(space = "top", columns = 3, cex.title = 1, +#' rectangles = TRUE, points = FALSE, +#' title = "Avaliação da conduta"), +#' xlab = "Região de origem", +#' ylab = "Frequência") +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/PaulinoEx9.29.txt b/data-raw/PaulinoEx9.29.txt new file mode 100644 index 00000000..c6edbc26 --- /dev/null +++ b/data-raw/PaulinoEx9.29.txt @@ -0,0 +1,13 @@ +orig unid condu freq +norte norte 1 118 +norte norte 2 207 +norte norte 3 134 +norte sul 1 181 +norte sul 2 514 +norte sul 3 542 +sul norte 1 253 +sul norte 2 313 +sul norte 3 200 +sul sul 1 653 +sul sul 2 1006 +sul sul 3 760 diff --git a/data/PaulinoEx9.29.rda b/data/PaulinoEx9.29.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..1b69c88676a9aafc596ee9db523d3eb76e14efb7 GIT binary patch literal 271 zcmZ>Y%CIzaj8qGb3@g~XhJoSl|Fi$iJQx`m1r*pA0vz<0??2$k#Kgeh(7?#zyn*5C zWZvK_Cv5~x<d!+`GETU-<<^4B!B-aKI$Y*pVD@QtZ1R{j*@1z9f!TqLohgv#`6dAt zq4TVrEKEvH92`9QduEs(usW(~GEvZ)`)gJ0jw%1+7$%(ZWN3bROv6E1+=(SkX7QI@ z&c|1(a9lc}*y2;O_TKcgIf;G~d>Br0TsS1l)5<qj<*k~h>h<m}XN8QdE}_{G<;Rbf z*I01#<gJr$J`%IIVCM<GBcTV^g!wsK*PWS?YwGia-Dsi{D__DTE*8PI%*+i!M;<L@ dIe#(NZl%(NKa*KxnzqEA6nW_67<uU11^{<_YGwcc literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/PaulinoEx9.29.Rd b/man/PaulinoEx9.29.Rd new file mode 100644 index 00000000..769adeea --- /dev/null +++ b/man/PaulinoEx9.29.Rd @@ -0,0 +1,53 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/PaulinoEx9.29.R +\name{PaulinoEx9.29} +\alias{PaulinoEx9.29} +\title{????} +\format{Um \code{data.frame} com 12 observações e 4 variáveis, em que + +\describe{ + +\item{\code{orig}}{Região de origem (Norte ou Sul).} + +\item{\code{unid}}{Região da unidade (Norte ou Sul).} + +\item{\code{condu}}{Avaliação da conduta. (1, 2, ou 3)} + +\item{\code{freq}}{Frequências observadas.} + +}} +\source{ +PAULINO; SINGER (2006), Exercício 9.29, pág. 343. +} +\description{ +Em um estudo sobre a avaliação de políciais militares + brancos por soldados americanos negros na Segunda Guerra Mundial, + a resposta de cada soldado foi categorizada nos níveis 1 (quase + sempre imparcial), 2 (parcial e imparcial em proporções iguais) e + 3 (quase sempre parcial) +} +\examples{ + +data(PaulinoEx9.29) + +str(PaulinoEx9.29) + +xt <- xtabs(freq ~ ., data = PaulinoEx9.29) +ftable(xt) + +library(lattice) + +barchart(xt, + horizontal = FALSE, + beside = FALSE, + stack = FALSE, + auto.key = list(space = "top", columns = 3, cex.title = 1, + rectangles = TRUE, points = FALSE, + title = "Avaliação da conduta"), + xlab = "Região de origem", + ylab = "Frequência") + +} +\keyword{TC} +\keyword{multinomial} + -- GitLab From 389e5485f4846f9f5e0e15f3d70812d06be1f32d Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Jhenifer Caetano <jhenicaet@gmail.com> Date: Tue, 11 Oct 2016 09:52:54 -0300 Subject: [PATCH 4/7] Adiciona tabela PaulinoEx9.30 ao pacote --- R/PaulinoEx9.30.R | 51 +++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/PaulinoEx9.30.txt | 25 ++++++++++++++++ data/PaulinoEx9.30.rda | Bin 0 -> 385 bytes man/PaulinoEx9.30.Rd | 60 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 4 files changed, 136 insertions(+) create mode 100644 R/PaulinoEx9.30.R create mode 100644 data-raw/PaulinoEx9.30.txt create mode 100644 data/PaulinoEx9.30.rda create mode 100644 man/PaulinoEx9.30.Rd diff --git a/R/PaulinoEx9.30.R b/R/PaulinoEx9.30.R new file mode 100644 index 00000000..300d84f0 --- /dev/null +++ b/R/PaulinoEx9.30.R @@ -0,0 +1,51 @@ +#' @name PaulinoEx9.30 +#' @title Avaliação de Políciais Militares +#' @description Em um estudo sobre a avaliação de políciais militares +#' brancos por soldados americanos negros na Segunda Guerra Mundial, +#' os soldados do exército foram classificados segundo o nível +#' educacional, a atitude face à separação racial, a região de +#' naturalidade e a preferência oir missões de combate. +#' @format Um \code{data.frame} com 24 observações e 5 variáveis, em que +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{educ}}{Nível educacional (só grade school, alguma high +#' school, high school completa).} +#' +#' \item{\code{sep}}{Atitude perante separação racial (não contra ou +#' contra).} +#' +#' \item{\code{ntur}}{Região de naturalidade (sul, norte).} +#' +#' \item{\code{missao}}{Preferência por missão de combate (sim ou não).} +#' +#' \item{\code{freq}}{Frequências observadas.} +#' +#' } +#' @keywords TC dicotomica +#' @source PAULINO; SINGER (2006), Exercício 9.30, pág. 344. +#' @examples +#' +#' data(PaulinoEx9.30) +#' +#' str(PaulinoEx9.30) +#' +#' xt <- xtabs(freq ~ ., data = PaulinoEx9.30) +#' ftable(xt) +#' +#' library(lattice) +#' library(latticeExtra) +#' +#' useOuterStrips( +#' barchart(freq ~ educ | sep + natur, groups = missao, +#' horizontal = FALSE, +#' data = PaulinoEx9.30, +#' auto.key = list(space = "top", columns = 2, +#' cex.title = 1, rectangles = TRUE, +#' points = FALSE, +#' title = "Preferência por missão"), +#' xlab = "Nível educacional", +#' ylab = "Frequência") +#' ) +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/PaulinoEx9.30.txt b/data-raw/PaulinoEx9.30.txt new file mode 100644 index 00000000..28fabee0 --- /dev/null +++ b/data-raw/PaulinoEx9.30.txt @@ -0,0 +1,25 @@ +educ sep natur missao freq +grade school nao contra sul sim 2051 +grade school nao contra sul nao 20738 +grade school nao contra norte sim 518 +grade school nao contra norte nao 3182 +grade school contra sul sim 1050 +grade school contra sul nao 7027 +grade school contra norte sim 600 +grade school contra norte nao 2558 +al. high school nao contra sul sim 382 +al. high school nao contra sul nao 2165 +al. high school nao contra norte sim 320 +al. high school nao contra norte nao 960 +al. high school contra sul sim 349 +al. high school contra sul nao 1832 +al. high school contra norte sim 489 +al. high school contra norte nao 1141 +high school com. nao contra sul sim 351 +high school com. nao contra sul nao 1714 +high school com. nao contra norte sim 245 +high school com. nao contra norte nao 630 +high school com. contra sul sim 478 +high school com. contra sul nao 1798 +high school com. contra norte sim 609 +high school com. contra norte nao 1256 diff --git a/data/PaulinoEx9.30.rda b/data/PaulinoEx9.30.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..4ccf419581334d57f4c50e3a4fa45c75feee65fa GIT binary patch literal 385 zcmZ>Y%CIzaj8qGboc7W_fr0VT|MUO9orrL7j8Jf6C~#W;{Qp4*1_1^K1_nlk1SZA} zj1dA-E=Ph>?fnD&GkuMNuN>lcP+X?wb8JPij}L<ygBk;)0fR7$r<2M-`+y4!90m+h z3{_KoR2qehTor@_E^>G*{if*{GG(f(>HO@)Wu}`Qw8U?EeXqUPoWc>7RQ=<xyZq5d z{maj6zg_i!U9D}O*sUXmyJgJSzdd-gKYqK|>FN6U+m|VGXUg-~)X#{0D%-(%aj8Rh zjl)USnRP}v*OZ?NdLHMs%{sT{Df1jQ2Gt1xOPc1DY~h?~we&*ht8J~kcE7xvxRsLK zi?iQaDX*QAwtvbFdH1kCbNe1%Qtb4oJ)pkGMC?g$QQn`(s#`k8SWcXbJUP83?Lc8; zh`!h!*<Gg}lpj~#Br0%fmDDkzTO~Ii&6p_Av1d|{;4}eIZ)b+7i8qd?ZanAvAyJ>9 sc&Y9TW`XRZVXXcyF4u*I>WH71pR|-ghr_dp|6{pIa4RQg-sEo#0Mj&}d;kCd literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/PaulinoEx9.30.Rd b/man/PaulinoEx9.30.Rd new file mode 100644 index 00000000..ac036ec4 --- /dev/null +++ b/man/PaulinoEx9.30.Rd @@ -0,0 +1,60 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/PaulinoEx9.30.R +\name{PaulinoEx9.30} +\alias{PaulinoEx9.30} +\title{Avaliação de Políciais Militares} +\format{Um \code{data.frame} com 24 observações e 5 variáveis, em que + +\describe{ + +\item{\code{educ}}{Nível educacional (só grade school, alguma high + school, high school completa).} + +\item{\code{sep}}{Atitude perante separação racial (não contra ou + contra).} + +\item{\code{ntur}}{Região de naturalidade (sul, norte).} + +\item{\code{missao}}{Preferência por missão de combate (sim ou não).} + +\item{\code{freq}}{Frequências observadas.} + +}} +\source{ +PAULINO; SINGER (2006), Exercício 9.30, pág. 344. +} +\description{ +Em um estudo sobre a avaliação de políciais militares + brancos por soldados americanos negros na Segunda Guerra Mundial, + os soldados do exército foram classificados segundo o nível + educacional, a atitude face à separação racial, a região de + naturalidade e a preferência oir missões de combate. +} +\examples{ + +data(PaulinoEx9.30) + +str(PaulinoEx9.30) + +xt <- xtabs(freq ~ ., data = PaulinoEx9.30) +ftable(xt) + +library(lattice) +library(latticeExtra) + +useOuterStrips( + barchart(freq ~ educ | sep + natur, groups = missao, + horizontal = FALSE, + data = PaulinoEx9.30, + auto.key = list(space = "top", columns = 2, + cex.title = 1, rectangles = TRUE, + points = FALSE, + title = "Preferência por missão"), + xlab = "Nível educacional", + ylab = "Frequência") +) + +} +\keyword{TC} +\keyword{dicotomica} + -- GitLab From 9dc3a744aa0e054e26167db74395a73e92e1d081 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Jhenifer Caetano <jhenicaet@gmail.com> Date: Tue, 11 Oct 2016 09:54:54 -0300 Subject: [PATCH 5/7] =?UTF-8?q?Adiciona=20t=C3=ADtulo=20na=20documenta?= =?UTF-8?q?=C3=A7=C3=A3o?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- R/PaulinoEx9.29.R | 2 +- man/PaulinoEx9.29.Rd | 2 +- 2 files changed, 2 insertions(+), 2 deletions(-) diff --git a/R/PaulinoEx9.29.R b/R/PaulinoEx9.29.R index 8517d3f1..15b6447d 100644 --- a/R/PaulinoEx9.29.R +++ b/R/PaulinoEx9.29.R @@ -1,5 +1,5 @@ #' @name PaulinoEx9.29 -#' @title ???? +#' @title Avaliação de Políciais Militares #' @description Em um estudo sobre a avaliação de políciais militares #' brancos por soldados americanos negros na Segunda Guerra Mundial, #' a resposta de cada soldado foi categorizada nos níveis 1 (quase diff --git a/man/PaulinoEx9.29.Rd b/man/PaulinoEx9.29.Rd index 769adeea..7e8acf6d 100644 --- a/man/PaulinoEx9.29.Rd +++ b/man/PaulinoEx9.29.Rd @@ -2,7 +2,7 @@ % Please edit documentation in R/PaulinoEx9.29.R \name{PaulinoEx9.29} \alias{PaulinoEx9.29} -\title{????} +\title{Avaliação de Políciais Militares} \format{Um \code{data.frame} com 12 observações e 4 variáveis, em que \describe{ -- GitLab From d2b08b4cd56483d7f7ffa9f82755bbe7ced0da8a Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Jhenifer Caetano <jhenicaet@gmail.com> Date: Tue, 11 Oct 2016 14:05:36 -0300 Subject: [PATCH 6/7] Adiciona tabela 11.10 ao pacote --- R/PaulinoTb11.10.R | 51 +++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/PaulinoTb11.10.txt | 49 ++++++++++++++++++++++++++++++ data/PaulinoTb11.10.rda | Bin 0 -> 342 bytes man/PaulinoTb11.10.Rd | 59 ++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 4 files changed, 159 insertions(+) create mode 100644 R/PaulinoTb11.10.R create mode 100644 data-raw/PaulinoTb11.10.txt create mode 100644 data/PaulinoTb11.10.rda create mode 100644 man/PaulinoTb11.10.Rd diff --git a/R/PaulinoTb11.10.R b/R/PaulinoTb11.10.R new file mode 100644 index 00000000..7df4eac6 --- /dev/null +++ b/R/PaulinoTb11.10.R @@ -0,0 +1,51 @@ +#' @name PaulinoTb11.10 +#' @title Número de Animais Mortos por Contaminação do Petróleo +#' @description Estudo cuja finalidade é avaliar o efeito da +#' contaminação de um estuário por derramamento de petróleo na fauna +#' local. Cada animal foi submetido a um tratamento obtido da +#' classificação cruzada dos níveis contaminação por petróleo (sim +#' ou controle) e salinidade de aclimatação. Os animais foram +#' observados por 72 horas e o número de sobreviventes foi +#' registrado a cada 12 horas. +#' @format Um \code{data.frame} com 48 observações e 4 variáveis, em que +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{grupo}}{grupo em que pertnce o animal (petróleo ou +#' controle).} +#' +#' \item{\code{salin}}{Salinidade de aclimatação (0.8\%, 1.4\%, 2.4\%, +#' 3.4\%).} +#' +#' \item{\code{tempo}}{Tempo de exposição dos animais, em horas.} +#' +#' \item{\code{animais}}{Número de animais sobreviventes.} +#' +#' } +#' @keywords TC +#' @source PAULINO; SINGER (2006), Tabela 11.10, pág. 400. +#' @examples +#' +#' data(PaulinoTb11.10) +#' +#' str(PaulinoTb11.10) +#' +#' xt <- xtabs(animais ~ ., data = PaulinoTb11.10) +#' ftable(xt) +#' +#' library(lattice) +#' +#' barchart(animais ~ factor(tempo) | factor(salin), groups = grupo, +#' horizontal = FALSE, +#' data = PaulinoTb11.10, +#' auto.key = list(space = "top", columns = 2, +#' cex.title = 1, rectangles = TRUE, +#' points = FALSE, +#' title = "Grupo de animais"), +#' xlab = "Tempo de exposição", +#' strip = strip.custom( +#' strip.names = TRUE, +#' var.name = "Salinidade"), +#' ylab = "Frequência") +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/PaulinoTb11.10.txt b/data-raw/PaulinoTb11.10.txt new file mode 100644 index 00000000..b5be972e --- /dev/null +++ b/data-raw/PaulinoTb11.10.txt @@ -0,0 +1,49 @@ +grupo salin tempo animais +petroleo 0.8 12 30 +petroleo 0.8 24 26 +petroleo 0.8 36 20 +petroleo 0.8 48 17 +petroleo 0.8 60 16 +petroleo 0.8 72 15 +petroleo 1.4 12 32 +petroleo 1.4 24 31 +petroleo 1.4 36 31 +petroleo 1.4 48 29 +petroleo 1.4 60 27 +petroleo 1.4 72 22 +petroleo 2.4 12 32 +petroleo 2.4 24 30 +petroleo 2.4 36 29 +petroleo 2.4 48 26 +petroleo 2.4 60 26 +petroleo 2.4 72 21 +petroleo 3.4 12 32 +petroleo 3.4 24 30 +petroleo 3.4 36 29 +petroleo 3.4 48 27 +petroleo 3.4 60 27 +petroleo 3.4 72 21 +controle 0.8 12 31 +controle 0.8 24 27 +controle 0.8 36 25 +controle 0.8 48 19 +controle 0.8 60 18 +controle 0.8 72 18 +controle 1.4 12 32 +controle 1.4 24 31 +controle 1.4 36 31 +controle 1.4 48 31 +controle 1.4 60 31 +controle 1.4 72 30 +controle 2.4 12 32 +controle 2.4 24 31 +controle 2.4 36 31 +controle 2.4 48 28 +controle 2.4 60 27 +controle 2.4 72 26 +controle 3.4 12 32 +controle 3.4 24 32 +controle 3.4 36 30 +controle 3.4 48 30 +controle 3.4 60 29 +controle 3.4 72 28 diff --git a/data/PaulinoTb11.10.rda b/data/PaulinoTb11.10.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..26fbf9c66aa2db35146a48ae928df22e1f5ce2ad GIT binary patch literal 342 zcmZ>Y%CIzaj8qGbeE9EfKLeBC|HuFT|F1v7Siy3{A;iIc`TYh51_lEM1_lL2#tn?d zJZ(!(xS7n;T<pNsz`!8I?9<Ea6nur3fmuP$gMop8fl;K>U&(|aLyB2}!Gzbugx_<K zq9C(Sk7NVq#HngU&J!3N_qm=@s*O?oXXtuec6HRw*$0@DW-Q3fQe4a9TcfzL&4Wie zWP-Hp@dNy#3&htlo?$;`yZ@e`*xTsOhS7VQdS8eH75b>GagA8wt+jGXLr{-K<5BJi zLz7m&o1W7*7-(vXoZQF5HE;S;gG4SxiB_?HT+fy~vMIQEhLK<C!~_*l#_VVbBLRa8 zY|pOl{cz$>nZhQ;K7G60KesfW{na$1M$19Pn}PEOlS8Qyzw*Py-qV5wmga6fYuN5Q yrMXl4c(7NBr{=3YA)1aUs;!s8bDy&qF<;}YWXRhyS@oaZldgh=iiiL1mIDCkU4xnc literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/PaulinoTb11.10.Rd b/man/PaulinoTb11.10.Rd new file mode 100644 index 00000000..0bda103c --- /dev/null +++ b/man/PaulinoTb11.10.Rd @@ -0,0 +1,59 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/PaulinoTb11.10.R +\name{PaulinoTb11.10} +\alias{PaulinoTb11.10} +\title{Número de Animais Mortos por Contaminação do Petróleo} +\format{Um \code{data.frame} com 48 observações e 4 variáveis, em que + +\describe{ + +\item{\code{grupo}}{grupo em que pertnce o animal (petróleo ou + controle).} + +\item{\code{salin}}{Salinidade de aclimatação (0.8\%, 1.4\%, 2.4\%, + 3.4\%).} + +\item{\code{tempo}}{Tempo de exposição dos animais, em horas.} + +\item{\code{animais}}{Número de animais sobreviventes.} + +}} +\source{ +PAULINO; SINGER (2006), Tabela 11.10, pág. 400. +} +\description{ +Estudo cuja finalidade é avaliar o efeito da + contaminação de um estuário por derramamento de petróleo na fauna + local. Cada animal foi submetido a um tratamento obtido da + classificação cruzada dos níveis contaminação por petróleo (sim + ou controle) e salinidade de aclimatação. Os animais foram + observados por 72 horas e o número de sobreviventes foi + registrado a cada 12 horas. +} +\examples{ + +data(PaulinoTb11.10) + +str(PaulinoTb11.10) + +xt <- xtabs(animais ~ ., data = PaulinoTb11.10) +ftable(xt) + +library(lattice) + +barchart(animais ~ factor(tempo) | factor(salin), groups = grupo, + horizontal = FALSE, + data = PaulinoTb11.10, + auto.key = list(space = "top", columns = 2, + cex.title = 1, rectangles = TRUE, + points = FALSE, + title = "Grupo de animais"), + xlab = "Tempo de exposição", + strip = strip.custom( + strip.names = TRUE, + var.name = "Salinidade"), + ylab = "Frequência") + +} +\keyword{TC} + -- GitLab From 9e41716d03b1cf69e6a1ddbfaa33f394a913204a Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: Jhenifer Caetano <jhenicaet@gmail.com> Date: Tue, 11 Oct 2016 14:34:42 -0300 Subject: [PATCH 7/7] =?UTF-8?q?Adiciona=20dados=20do=20exerc=C3=ADcio=209.?= =?UTF-8?q?31=20ao=20pacote?= MIME-Version: 1.0 Content-Type: text/plain; charset=UTF-8 Content-Transfer-Encoding: 8bit --- R/PaulinoEx9.31.R | 47 +++++++++++++++++++++++++++++++ data-raw/PaulinoEx9.31.txt | 25 +++++++++++++++++ data/PaulinoEx9.31.rda | Bin 0 -> 331 bytes man/PaulinoEx9.31.Rd | 55 +++++++++++++++++++++++++++++++++++++ 4 files changed, 127 insertions(+) create mode 100644 R/PaulinoEx9.31.R create mode 100644 data-raw/PaulinoEx9.31.txt create mode 100644 data/PaulinoEx9.31.rda create mode 100644 man/PaulinoEx9.31.Rd diff --git a/R/PaulinoEx9.31.R b/R/PaulinoEx9.31.R new file mode 100644 index 00000000..d8625b8e --- /dev/null +++ b/R/PaulinoEx9.31.R @@ -0,0 +1,47 @@ +#' @name PaulinoEx9.31 +#' @title Efeito de Dois Agentes Sexualmente Transmissíveis em Dois +#' Grupos de Mulheres +#' @description Estudo envolvendo um grupo de mulheres com displasia +#' historicamente confirmada (os casos) e um outro grupo de mulheres +#' com ausência da mesma (os controles). Cada uma destas mulheres +#' foi então analisada em termos da exposição a cada um dos agentes +#' sexualmente transmissíveis (o vírus tipo 2 da herpes simples e a +#' \emph{Clamídia trachomatis}, na etiologia da displasia cervical), +#' categorizados em dois níveis (1 para uma maior prevalência de +#' anticorpos e 2 para uma menor prevalência), analisando os +#' possíveis efeitos desses agentes nessas mulheres. +#' @format Um \code{data.frame} com 24 observações e 5 variáveis, em que +#' +#' \describe{ +#' +#' \item{\code{parc}}{Fator sócio-comportamental definido pelo número +#' total de parceiros sexuais categorizado em 3 níveis (1-3, 4-10 e +#' > 10).} +#' +#' \item{\code{herpes}}{Vírus do tipo 2 do herpes simples (1 para maior +#' prevalência e 2 para menor).} +#' +#' \item{\code{calmid}}{Vírus do tipo \emph{Clamídia trachomatis} (1 +#' para maior prevalência e 2 para menor).} +#' +#' \item{\code{grupo}}{Grupo em que foi dividido as mulheres (casos ou +#' controles).} +#' +#' \item{\code{freq}}{Frequências observadas.} +#' +#' } +#' @keywords retrospetivo +#' @source PAULINO; SINGER (2006), Exercício 9.31, pág. 345. +#' @examples +#' +#' data(PaulinoEx9.31) +#' +#' str(PaulinoEx9.31) +#' +#' xt <- xtabs(freq ~., PaulinoEx9.31) +#' ftable(xt) +#' +#' library(vcd) +#' doubledecker(xt) +#' +NULL \ No newline at end of file diff --git a/data-raw/PaulinoEx9.31.txt b/data-raw/PaulinoEx9.31.txt new file mode 100644 index 00000000..2fab32f8 --- /dev/null +++ b/data-raw/PaulinoEx9.31.txt @@ -0,0 +1,25 @@ +parc herpes clamid grupo freq +1-3 1 1 casos 56 +1-3 1 1 controles 42 +1-3 1 2 casos 14 +1-3 1 2 controles 28 +1-3 2 1 casos 54 +1-3 2 1 controles 78 +1-3 2 2 casos 34 +1-3 2 2 controles 83 +4-10 1 1 casos 47 +4-10 1 1 controles 57 +4-10 1 2 casos 8 +4-10 1 2 controles 29 +4-10 2 1 casos 46 +4-10 2 1 controles 74 +4-10 2 2 casos 18 +4-10 2 2 controles 48 +> 10 1 1 casos 43 +> 10 1 1 controles 80 +> 10 1 2 casos 4 +> 10 1 2 controles 16 +> 10 2 1 casos 44 +> 10 2 1 controles 56 +> 10 2 2 casos 12 +> 10 2 2 controles 23 diff --git a/data/PaulinoEx9.31.rda b/data/PaulinoEx9.31.rda new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..b2549bfdf96421abb9d8b5ed376deba5ea16007d GIT binary patch literal 331 zcmZ>Y%CIzaj8qGboZR_Lgn@B!{lWj`5yt}L|0c2tMmXp{|9`-Nfx&@+aRZ~IZ*!oj zQBtl{!-dO=%dSW=Fc|ULI<A_1)g+18S%LY=2?IAZjtd!8OfH?KMk%&xj*A_RBr>r1 znlMb!TIQt0BwWa($eeRS;)cM4V{JwO0tdHzeV(-`#Os{rflv#_)-`tbx8C`o{%2;$ zbvcFFzv>eOULO=GP&Ha=!s@V+!+}vrlR+!hurW9N?75PnniCAJyh^!RRUiLEuJtQV zoO#DIf%Tk1l92XBE`bBS8#{xZ9BKISzQrSxw?Wx~<CA#Ymzx|tnWuFhnTZ@&vHVPL z`?o3g_+J$KvzITFDpOvt`H<aSubF=m9xq*^f6sD8EYn-pOb6aAUF)K%wjR`+5IlFm o@1<$CUTK$!DeFu;P&y~J)YnHrMdHByqjx6yiKwVNs%&Kd0FHx;mH+?% literal 0 HcmV?d00001 diff --git a/man/PaulinoEx9.31.Rd b/man/PaulinoEx9.31.Rd new file mode 100644 index 00000000..12a83972 --- /dev/null +++ b/man/PaulinoEx9.31.Rd @@ -0,0 +1,55 @@ +% Generated by roxygen2: do not edit by hand +% Please edit documentation in R/PaulinoEx9.31.R +\name{PaulinoEx9.31} +\alias{PaulinoEx9.31} +\title{Efeito de Dois Agentes Sexualmente Transmissíveis em Dois + Grupos de Mulheres} +\format{Um \code{data.frame} com 24 observações e 5 variáveis, em que + +\describe{ + +\item{\code{parc}}{Fator sócio-comportamental definido pelo número + total de parceiros sexuais categorizado em 3 níveis (1-3, 4-10 e + > 10).} + +\item{\code{herpes}}{Vírus do tipo 2 do herpes simples (1 para maior + prevalência e 2 para menor).} + +\item{\code{calmid}}{Vírus do tipo \emph{Clamídia trachomatis} (1 + para maior prevalência e 2 para menor).} + +\item{\code{grupo}}{Grupo em que foi dividido as mulheres (casos ou + controles).} + +\item{\code{freq}}{Frequências observadas.} + +}} +\source{ +PAULINO; SINGER (2006), Exercício 9.31, pág. 345. +} +\description{ +Estudo envolvendo um grupo de mulheres com displasia + historicamente confirmada (os casos) e um outro grupo de mulheres + com ausência da mesma (os controles). Cada uma destas mulheres + foi então analisada em termos da exposição a cada um dos agentes + sexualmente transmissíveis (o vírus tipo 2 da herpes simples e a + \emph{Clamídia trachomatis}, na etiologia da displasia cervical), + categorizados em dois níveis (1 para uma maior prevalência de + anticorpos e 2 para uma menor prevalência), analisando os + possíveis efeitos desses agentes nessas mulheres. +} +\examples{ + +data(PaulinoEx9.31) + +str(PaulinoEx9.31) + +xt <- xtabs(freq ~., PaulinoEx9.31) +ftable(xt) + +library(vcd) +doubledecker(xt) + +} +\keyword{retrospetivo} + -- GitLab