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README.md

-# Modelo COM-Poisson: Extensões e Aplicações
+<img src = "https://gitlab.c3sl.ufpr.br/eerj12/tccDocument/raw/master/docs/images/tccDocument.png" width=150px align="right" display="block">
+
+# Extensões e Aplicações dos Modelos de Regressão COM-Poisson
 -------------------------------------------
 
  > [Eduardo Elias Ribeiro Junior](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/eerj12) &
    [Walmes Marques Zeviani](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/walmes)
 
-Este repositório tem por objetivo gerenciar os arquivos elaborados em
-meu trabalho de conclusão de curso na Universidade Federal do Paraná
-para a obtenção do título de bacharel em Estatística.
-
-O trabalho compreenderá a avaliação e comparação dos modelos de
-regressão **COM-Poisson**, nome dado em homenagem ao seus autores
-Richard Conway e Willian Maxwell, com aplicações e extensões (inclusão
-de efeitos aleatórios e acomodação de inflação de zeros).
-
-### Lista de afazeres ###
-
-- [x] Criar o repositório GIT para gerenciamento de arquivos do TCC;
-- [x] Análise crítica de artigo científico;
-- [ ] Programar método de estimação do modelo de regressão com
-  efeito fixo e aleatório;
-- [ ] Elaboração do projeto de pesquisa;
-    * Entrega do pré-projeto, **19/11**
-    * Apresentação do projeto **26/11**
-- [ ] Análise dos dados de desfolha em capulhos de agodão
-  (`defoliation`);
-- [ ] Análise do conjunto de dados `aviurba`, do pacote `ade4`
-  (**D**ata **A**nalysis functions to analyse **E**cological and
-  **E**nvironmental data in the framework of **E**uclidean
-  **E**xploratory methods);
-- [ ] Descrever a organização do repositório no README;
+Este repositório tem por objetivo gerenciar os arquivos textuais
+elaborados em meu trabalho de conclusão de curso na Universidade Federal
+do Paraná para a obtenção do título de bacharel em Estatística. O
+trabalho compreenderá a avaliação e comparação dos modelos de regressão
+**COM-Poisson**, nome dado em homenagem ao seus autores Richard Conway e
+Willian Maxwell, com aplicações e extensões (inclusão de efeitos
+aleatórios e acomodação de inflação de zeros). A elaboração dos
+documentos neste repositório é realizada em conjunto com o repositório
+[tccPackage], que possui a implementação computacional para ajuste
+desses modelos em formato de pacote R.
+
+***
+
+### Introdução ###
+
+Dados de contagem não raramente são analisados utilizando a distribuição
+Poisson como distribuição associada a um modelo linear generalizado, no
+caso de modelos de regressão. A distribuição Poisson possui somente um
+parâmetro, que representa a média e variância. Essa propriedade, chamada
+de equidispersão, é particularidade do modelo Poisson e pode não ser
+adequada a diversas situações. Quando o modelo Poisson é aplicado sob
+negligência desta suposição, o modelo apresenta erros padrões
+inconsistentes para as estimativas dos parâmetros e, por consequência,
+para toda função desses parâmetros.
+
\ No newline at end of file
+A distribuição COM-Poisson é uma distribuição que contempla os casos de
+sub e superdispersão devido a adição de mais um parâmetro e pode ser
+adapatada em modelos de regressão. Este trabalho apresenta uma revisão
+bibliográfica desses modelos, métodos baseados em verossimilhança para
+ajuste e comparação de modelos COM-Poisson, extensões para os casos de
+excesso de zeros e estrutura com efeitos aleatórios, aplicações dos
+modelos COM-Poisson e uma discussão sobre o emprego desses modelos na
+análise de dados de contagem.
+
+### Organização do repositório ###
+
+Os arquivos de documentação do projeto de pesquisa e da pesquisa
+propriamente dita são mantidos no diretório `docs/` onde estão os
+arquivos `00-projeto` e `01-tcc`. Neste diretório todos são elaborados
+utilizando o [LaTeX] com o pacote [abnTeX2], para diagramação de texto,
+em arquivos de extensão `.Rnw`, que mesclam macros LaTeX com códigos
+R. Assim são armazenados somente os arquivos fontes, `.Rnw`. Ainda para o
+relatório da pesquisa, em `01-tcc`, decidiu-se trabalhar com partições
+do documento sendo essas partições os capítulos do arquivo que são
+incluídos no arquivo geral via recursos do [knitr]. 
+
+Nesse repositório de documentação os slides elaborados para
+apresentações sobre a pesquisa também são mantido. O diretório
+`presentations/` é dedidaco a este fim. Neste diretório os fontes tem
+extensão `.Rmd`, que compilados geram um `.pdf`. Os arquivos
+`abntcite.csl` e `preambulo-beamer.tex` são utilizados para configuração
+do estilo de bibliografia e _layout_/estrutura dos slides respectivamente.
+
+
+```
+
+.
+├── docs
+│   ├── 00-projeto.pdf
+│   ├── 00-projeto.Rnw
+│   ├── 01-tcc.pdf
+│   ├── 01-tcc.Rnw
+│   ├── cap01_introducao.Rnw
+│   ├── cap02_revisao-de-literatura.Rnw
+│   ├── cap03_materiais-e-metodos.Rnw
+│   ├── cap04_resultados-e-discussao-concordance.tex
+│   ├── cap04_resultados-e-discussao.log
+│   ├── cap04_resultados-e-discussao.Rnw
+│   ├── cap04_resultados-e-discussao.tex
+│   ├── cap05_consideracoes-finais.Rnw
+│   ├── compois.bib
+│   ├── images
+│   │   ├── tccDocument.png
+│   │   ├── tccDocument.svg
+│   │   └── ufpr_bg.pdf
+│   └── _setup.R
+├── examples
+│   ├── moscaBranca.txt
+│   ├── ovos.txt
+│   ├── Ultimate_Gamma_Count.html
+│   └── Ultimate_Gamma_Count.Rmd
+├── presentations
+│   ├── abntcite.csl
+│   ├── images
+│   │   ├── logoR.png
+│   │   └── regressao.pdf
+│   ├── preambulo-beamer.tex
+│   ├── slides-projeto.pdf
+│   └── slides-projeto.Rmd
+├── README.md
+└── vignettes
+    ├── 1-consRendGraosSoja12-13.csv
+    ├── CG_COM.R
+    ├── defoliation.pdf
+    ├── defoliation.Rnw
+    ├── defoliation.tex
+    ├── mexilhao.R
+    ├── mexilhao.txt
+    └── SojaComponentesProd.Rmd
+
+```
+
+
+Para uma visualização rápida dos documentos resultantes, os arquivos
+`.pdf` (resultados de compilação) também são mantidos sob versionamento.
+
+[tccPackage]: https://gitlab.c3sl.ufpr.br/eerj12/tccPackage/
+[LaTeX]: https://www.latex-project.org/
+[abnTex2]: http://www.abntex.net.br/
+[knitr]: http://yihui.name/knitr/