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eys16
labestData
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a36fc1a1
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a36fc1a1
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8 years ago
by
Walmes Marques Zeviani
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163 deletions
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+
133
−
163
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a36fc1a1
...
...
@@ -20,126 +20,41 @@ Build status for the development version (`devel` branch)
## O que o *labestData*?
O
*labestData*
é um projeto coletivo do PET Estatística UFPR para
desenvolver um pacote R com conjuntos de dados para ensino de
Estatística.
O
*labestData*
é pacote R com conjuntos de dados para ensino de
Estatística desenvolvido pelo [PET Estatística UFPR]. Os dados extraídos
de livros e apostila, mantidos juntos no
*labestData*
forma uma galeria
de dados TODO
O nome
*labest*
vem de LABoratório de ESTatística.
## Por que fazer um pacote com conjuntos de dados?
A excelência na análise de dados vem com a prática. Facilitar o acesso
dos estudantes aos dados é incentivar que façam mais análises, que
aprendam mais ou fixem melhor os conteúdos de sala de aula. Dados de
livros, por exemplo, são um excelente ponto de partida pois são bem
documentados. Inclusive alguns são análisos nas próprias obras. Dessa
maneira, o aluno além de poder reproduzir os resultados exibidos na obra
pode tentar novas maneiras de analisar os dados. Por fim, cada conjunto
de dados tem um história por traz e o estudante em contato com isso
desenvolve uma maior capacidade de compreender os problemas reais de
estatística e de buscar soluções para eles.
## Quais são os objetivos do projeto *labestaData*?
O projeto tem dois objetivos principais:
1.
Capacitar os membros do PET Estatística (bolsistas e voluntários)
1.
Contribuir a comunidade científica em geral, com o Departamento de
Estatística, por reunir, organizar, manter e disponibilizar
conjuntos de dados para o ensino-apredizagem de Estatística.
2.
Capacitar os membros do PET Estatística (bolsistas e voluntários)
a desenvolver pacote R com versionamento Git;
2.
Contribuir com o Departamento de Estatística, e a comunidade
científica em geral, por reunir, organizar, manter e disponibilizar
conjuntos de dados na forma de um pacote R de tal forma que possam
ser usados para o ensino de Estatística.
Nesta primeira fase do projeto foram definidas algumas obras nacionais
para transcrição e documentação de suas tabelas de dados ao pacote. As
obras escolhidas estão descritas abaixo e compreendem as disciplinas de
Planejamento de Experimentos, Análise de Regressão Linear e Análise
Estatística Multivariada.
<!-- Inserir links das milestones que representam os livros -->
1.
Banzatto, D. A., Kronka, S. D. (2013).
**Experimentação Agrícola**
(4th ed.). Jaboticabal, SP: Funep.
[
_Milestone_ Banzatto
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/1
)
<!-- [*Walmes Zeviani*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/walmes) -->
2.
Mingoti, S.A. (2005).
**
Análise de dados através de métodos de
estatística multivariada - uma abordagem aplicada
**
. Belo
Horizonte, MG: Editora UFMG.
[
_Milestone_ Mingoti
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/2
)
<!-- [*Paula Alessandra*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pazd11) e -->
<!-- [*Ângela Legey*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/alcl12) -->
3.
Ramalho, M. A. P., Ferreira, D. F., Oliveira,
A. C. (2005).
**
Experimentação em Genética e Melhoramento de
Plantas
**
(2th ed.). Lavras, MG: Editora UFLA.
[
_Milestone_ Ramalho
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/3
)
<!-- [*Jhenifer Veloso*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/jcv12) -->
4.
Barros, W. S., Dias, L. A. S. (2009).
**
Biometria
Experimental
**
. Viçosa, MG: Editora UFV.
[
_Milestone_ Barros
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/4
)
<!-- [*Altamiro Basiewics*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/aab15) -->
6.
Zimmermann, F.J. (2004),
**Estatística aplicada à pesquisa agrícola**
(1st ed.). Santo Antônio de Goiás, GO: Embrapa Arroz e Feijão.
[
_Milestone_ Zimmermann
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/6
)
<!-- [*Bruna Wundervald*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/bdw13) -->
7.
Pimentel-Gomes, F. (2009).
**Curso de Estatística Experimental**
(15th ed.). Piracicaba, SP: FEALQ.
[
_Milestone_ Pimentel-Gomes
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/7
)
<!-- [*Bruno Geronymo*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/bg15) -->
8.
Ferreira, D. F. (2011).
**Estatística Multivariada**
(2nd
ed.). Lavras, MG: Editora UFLA.
[
_Milestone_ Ferreira
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/8
)
<!-- [*Eduardo Junior*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/eerj12) -->
9.
Manly, B. J. F. (2005).
**
Métodos Estatísticos Multivariados- uma
introdução
**
. Porto Alegre, RS: Bookman
[
_Milestone_ Manly
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/9
)
<!-- [*Gabriel Klostermann*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/gsk12) -->
10.
Storck, L., Garcia, B. C., Lopes, S. J., Estefanel,
V. (2011).
**Experimentação Vegetal**
(3th ed.). Santa Maria, RS:
Editora UFSM.
[
_Milestone_ Storck
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/10
)
<!-- [*Mônica Ludmilla*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/mlho15) -->
11.
Charnet, R., de Luna Freire, C.A., Charnet, E.M.R., Bonvino,
H. (2008).
**Análise de modelos de regressão linear com aplicações**
(2nd ed.). Campinas, SP: Editora Unicamp
[
_Milestone_ Charnet
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/11
)
<!-- [*Daniel Ikenaga*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/di12) -->
12.
Demétrio, C. G. B., & Zocchi, S. S. (2011).
**
Modelos de
Regressão
**
. Piracicaba: ESALQ.
[
_Milestone_ Demetrio
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/12
)
<!-- [*Alcides Neto*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/acn13) -->
13.
Ramos, E. M. L. S., & Almeida, S. S, & Araújo,
A. R. (2013).
**Controle Estatístico da Qualidade**
(1th ed.). Porto
Alegre, RS: Bookman.
[
_Milestone_ Ramos
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/13
)
<!-- [*Ângela Legey*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/alcl12) -->
14.
Costa, A. F. B., Epprecht, E. K., Carpinetti, L. (2010).
**
Controle
Estatístico de Qualidade
**
(2nd ed.). São Paulo - SP: Editora
Atlas.
[
_Milestone_ Epprecht
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/14
)
<!-- [*Paula Alessandra*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pazd11) -->
15.
Barbin, D. (2013).
**
Planejamento e Análise Estatística de
Experimentos Agronômicos
**
(2nd ed.). Londrina, PR: Mecenas.
[
_Milestone_ Barbin
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/15
)
<!-- [*Walmes Zeviani*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/walmes) -->
16.
Paula, G. A. (2004).
**
Modelos de regressão: com apoio
computacional
**
. São Paulo, SP: IME-USP.
[
_Milestone_ Paula
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/16
)
<!-- [*Eduardo Junior*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/eerj12) -->
17.
Vieira, S.(1999).
**Estatística experimental**
(2th ed.). São Paulo, SP: Atlas.
[
_Milestone_ Vieira
](
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData/milestones/17
)
<!-- [*Ângela Legey*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/alcl12) e -->
<!-- [*Alcides Neto*](https://gitlab.c3sl.ufpr.br/acn13) -->
Ao término desta primeira fase pretende-se ter todos os conjuntos de
dados relevantes destas obras disponíveis para usuários do pacote. Ainda
*vignettes*
(vinhetas), exemplificando a análise de dados (em códigos R)
referentes a cada disciplina compreendida, serão elaboradas para
servirem de inspiração ou roteiro para análise dos demais dados do
pacote.
## Quem são os desenvolvedores do *labestData*?
Os colaboradores do
*labestData*
são os bolsistas do PET, voluntários e
professores.
professores.
A tabela abaixo exibe todos os colaboradores.
| | Tipo | 1 etapa | 2 etapa |
|----------------------------------|------------|---------|---------|
...
...
@@ -160,8 +75,8 @@ professores.
## Como fazer para ser colaborar do *labestData*?
Colaborações são muito bem vindas. Para colaborar, entre em contato com
PET Estatística (
<pet.estatistica.ufpr@gmail.com>
, PC09,
0
4133613261)
ou
com o Tutor (
<walmes@ufpr.br>
.
0
4133613573) comunicando a
PET Estatística (
<pet.estatistica.ufpr@gmail.com>
, PC09,
(
41
)
3361
-
3261)
ou
com o Tutor (
<walmes@ufpr.br>
.
(
41
)
3361
-
3573) comunicando a
intenção. Antes, no entanto, leia o Guia de Contribuição:
[
CONTRIBUTING.md
](
./CONTRIBUTING.md
)
.
...
...
@@ -177,18 +92,21 @@ primeira etapa inicia em 29/02/2016 com duração de 10 semanas (fim em
Os dados a serem incluídos no pacote serão provenientes de 4 principais
fontes:
1.
Livros. Os livros que exibem aplicações normalmente contém dados em
formas de tabela, em CD-Rom que acompanha o livro, pacote ou em
site com materiais suplementares. Essa será a maior fonte de dados
para o pacote labestData.
2.
Internet. A internet está repleta de dados. Existem dados prontos
em formas de tabela (páginas pessoais, órgãos públicos, instituições
de pesquisa, resultados de enquetes, etc) e também dados não
tabulados/organizados que podem ser capturados (com
*web scrap*
,
por exemplo) e processados.
3.
Arquivos pessoais. Alunos, professores, pesquisadores também podem
disponibilizar os dados de suas pesquisas para inclusão no pacote.
4.
Simulação. Embora sejam artificiais, dados provenientes de
1.
**Livros**
. Os livros que exibem aplicações normalmente contém
dados em formas de tabela, em CD-Rom que acompanha o livro, pacote
ou em site com materiais suplementares. Essa será a maior fonte de
dados para o pacote labestData. Isso porque os dados dos livros
geralmente estão documentados e alguns possuem aplicação com
solução na própria obra.
2.
**Internet**
. A internet está repleta de dados. Existem dados
prontos em formas de tabela (páginas pessoais, órgãos públicos,
instituições de pesquisa, resultados de enquetes, etc) e também
dados não tabulados/organizados que podem ser capturados (com
*
web
scrap
*
, por exemplo) e processados.
3.
**Arquivos pessoais**
. Alunos, professores, pesquisadores também
podem disponibilizar os dados de suas pesquisas para inclusão no
pacote.
4.
**Simulação**
. Embora sejam artificiais, dados provenientes de
simulação podem ser considerados pois, muitas vezes, são
deliberadamente feitos com uma particular característica relevante
para um problema. No pacote labestData essa será a menor fonte de
...
...
@@ -214,7 +132,7 @@ semestre para o Curso de Estatística da UFPR.
Embora sejam esses os contextos de prioridade, dados de outras áreas são
igualmente bem vindos, como dados espaciais, séries temporais, de
análise de sobrevivência, de questionário, etc.
análise de sobrevivência, de questionário,
análise sensorial,
etc.
Os dados reais devem possuir uma boa descrição das variáveis (nome,
unidade de medida, instrumento de medida usado, definição da unidade
...
...
@@ -224,8 +142,8 @@ condições de contorno do experimento, etc.
## O que o *labestData* possui além dos conjuntos de dados?
Além dos dados, o pacote possui vinhetas (
**vignettes**
)
com estudos de
caso com
os dados do pacote. Essas vinhetas são um guia simples de como
Além dos dados, o pacote possui vinhetas (
**vignettes**
)
que fazem
análise d
os dados do pacote. Essas vinhetas são um guia simples de como
coordenar funções do R para analisar os dados. Embora as vinhetas sejam
para alguns dados, elas servem de inspiração ou roteiro para os demais
dados do pacote.
...
...
@@ -235,61 +153,102 @@ dados do pacote.
O
*labestData*
é um pacote livre para o uso. O estudante pode usar (e
deve) para praticar a execução de análises, os cientistas podem usar
como referência para análise dos dados de suas pesquisas e os
professores podem usar
como ferra
ment
a
de ensino. Ao
tornar público
qualquer material que use elementos do pacote,
solicitamos que faça
citação do mesmo.
professores podem usar
principalmente como instru
ment
o
de ensino. Ao
tornar público
qualquer material que use elementos do pacote,
solicitamos que faça
citação do mesmo.
## Como citar o pacote *labestData*?
PET Estatística UFPR (2016).
**
labestData: conjuntos de dados para
ensino de estatística
**
. R package version x.y-z.
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labesData
Digite
`citation("labestData")`
no R. Usa saída semelhante e que está
abaixo será exibida. Lembre-se que a versão pode ser diferente.
@Manual{labestData2016,
title = {labestData: conjuntos de dados para ensino de estatística},
author = {PET Estatística UFPR},
year = {2016},
note = {R package version x.y-z},
url = {https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labesData},
}
```
> citation("labestData")
**Atenção**
: x.y-z deve ser substituído pela versão considerada do
pacote.
Para citar o pacote 'labestData' use:
## Como usar os conjuntos de dados do *labestData*?
PET Estatística UFPR (2016). labestData: Conjuntos de Dados para
Ensino de Estatística. R package version 0.0-16.451.
Para usar os conjuntos de dados você precisa instalar o pacote. Existem
duas formas de fazer isso:
A BibTeX entry for LaTeX users is
1.
Instalando o pacote pelos arquivos fonte: você precisar baixar o
arquivo com os fontes (
`labestData.tar.gz`
para Linux e
`labestData.zip`
para Windows) e, de dentro de uma sessão R,
instalar com
@Manual{,
title = {labestData: Conjuntos de Dados para Ensino de Estatística},
author = {PET Estatística UFPR},
year = {2016},
note = {R package version 0.0-16.451},
url = {http://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData,
https://github.com/pet-estatistica/labestData},
}
```
## Como o *labestData* é desenvolvido
O
*labestData*
é desenvolvido com controle de versão usando o Git. Ele é
mantido em duas plataformas de versionamento Git, o [GitLab] e o
[GitHub]. O GitLab é mantido pelo [C3SL] e é onde de fato o pacote é
desenvolvido. Lá estão as milestones e issues de desenvolvimento do
projeto. O projeto é espelhado para o GitHub para que mais pessoas
tenham acesso, tanto para instalação, quanto para poder colaborar com o
projeto.
O fluxo de trabalho do
*labestData*
é semanal e contém vários elementos
de trabalho em equipe do [Scrum] e das [4 Disciplinas da Execução]. Tal
forma de trabalhar foi admitida para potencialar o desenvolvimento do
projeto, pois aumentam o engajamento da equipe.
Para o desenvolvimento da parte R propriamente dita, foi usado o pacote
`devtools`
e
`roxygen2`
. Esses pacotes combinados facilitam o
desenvolvimento do pacote pois permitem que a documentação seja escrita
de uma forma mais legível e junto com a definição dos objetos exportados
(ou não) pelo pacote.
## Como instalar o *labestData*?
Para usar os conjuntos de dados você precisa instalar o
*labestData*
. Instale a partir do endereço de um dos repositórios. Para
isso você precisa ter o pacote
`devtools`
instalado (com todas as suas
dependências). De dentro de uma sessão R, instale com alguma das duas
opções abaixo.
```
library(devtools)
install.packages("labestData.tar.gz", repos = NULL)
2.
Instalando a partir do endereço do repositório. Para isso você
precisa ter o pacote
`devtools`
instalado (com todas as suas
dependências). De dentro de uma sessão R, instale com
# Do GitLab.
install_git(url = "https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labestData.git",
branch = "master")
library(devtools)
install_git("https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labesData.git")
# Do GitHub.
install_github(repo = "pet-estatistica/labestData",
branch = "master")
```
O ramo
`devel`
é o de desenvolvimento do pacote. Você pode instalar do
ramo
`devel`
também, mas esteja ciente que pode não ser uma versão
estável do pacote.
Depois de instalado, basta carregar o pacote e chamar o conjunto de
dados que deseja usar.
library(labestData) # Carrega o pacote para sessão.
ls("package:labestData") # Lista os objetos do pacote.
data(dados) # Traz para área de trabalho um dataset.
str(dados) # Mostra a estrutura do dataset.
help(dados) # Mostra as informações de ajuda do dataset
```
library(labestData) # Carrega o pacote.
ls("package:labestData") # Mostra os objetos do pacote.
help(package = "labestData") # Abre a home da documentação do pacote.
data(PimentelEg5.2) # Traz para área de trabalho um dataset.
str(PimentelEg5.2) # Mostra a estrutura do dataset.
help(PimentelEg5.2) # Mostra as informações de ajuda do dataset.
labestDataView() # Abre aplicação shiny para navegar pelos dados.
```
## Como reportar sugestões ou erros ao projeto *labestData*?
Você pode abrir
*issues*
no projeto
*labestData*
em
dois repositórios:
Você pode abrir
*issues*
no projeto
*labestData*
nos
dois repositórios:
1.
No repositório principal dentro do GitLab do
c3sl
:
1.
No repositório principal dentro do GitLab do
C3SL
:
<https://gitlab.c3sl.ufpr.br/pet-estatistica/labesData/issues>
.
Apenas usuários com conta no GitLab do
c3sl
podem abrir
*issue*
.
Apenas usuários com conta no GitLab do
C3SL
podem abrir
*issue*
.
2.
No repositório espelho no GitHub:
<https://github.com/pet-estatistica/labestData/issues>
. Qualquer
usuário do GitHub pode abrir
*issue*
.
...
...
@@ -299,3 +258,14 @@ em abrir uma conta, envie sua sugestão/bug para o endereço
<pet.estatistica.ufpr@gmail.com>
. Coloque no início título da mensagem
(
*subject*
) a palavra
`[labestData]`
, e.g.
`[labesData] Dados com número
incorreto de observações`
.
<!------------------------------------------- -->
[
PET Estatística UFPR
]:
http://www.pet.est.ufpr.br/
[
C3SL
]:
www.c3sl.ufpr.br
[
GitLab
]:
https://gitlab.c3sl.ufpr.br/explore
[
GitHub
]:
https://github.com/
[
Scrum
]:
https://www.amazon.com.br/Scrum-fazer-dobro-trabalho-metade-ebook/dp/B00OEI3TKM
[
4 Disciplinas da Execução
]:
http://franklincovey.com.br/execucao/as-4-disciplinas-da-execucao/
[
`devtools`
]:
https://cran.r-project.org/web/packages/devtools/index.html
[
`roxygen2`
]:
https://cran.r-project.org/web/packages/roxygen2/index.html
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