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legTools
Commits
85df240c
Commit
85df240c
authored
9 years ago
by
Walmes Marques Zeviani
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'wgpigs' -> 'wgPigs'.
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efa94b16
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vignettes/PimentelGomes.Rmd
+25
-18
25 additions, 18 deletions
vignettes/PimentelGomes.Rmd
with
25 additions
and
18 deletions
vignettes/PimentelGomes.Rmd
+
25
−
18
View file @
85df240c
...
@@ -100,12 +100,19 @@ install_git("http://git.leg.ufpr.br/leg/legTools.git")
...
@@ -100,12 +100,19 @@ install_git("http://git.leg.ufpr.br/leg/legTools.git")
```
```
```{r, error=FALSE, message=FALSE, warning=FALSE}
```{r,
eval=FALSE,
error=FALSE, message=FALSE, warning=FALSE}
library(legTools)
library(legTools)
packageVersion("legTools")
packageVersion("legTools")
```
```
```{r, echo=FALSE, error=FALSE, message=FALSE, warning=FALSE}
library(legTools, lib.loc="~/R/")
packageVersion("legTools")
```
****
****
## Delineamento Inteiramente Casualizado
## Delineamento Inteiramente Casualizado
...
@@ -122,23 +129,23 @@ o ganho de peso (kg, diferença entre o peso final e inicial) dos animais
...
@@ -122,23 +129,23 @@ o ganho de peso (kg, diferença entre o peso final e inicial) dos animais
após um período de consumo das rações.
após um período de consumo das rações.
Esses dados fazem parte do pacote `legTools` e estão no *data frame*
Esses dados fazem parte do pacote `legTools` e estão no *data frame*
`wg
p
igs`. Alternativamente, pode-se fazer o download do mesmo no formato
`wg
P
igs`. Alternativamente, pode-se fazer o download do mesmo no formato
texto separado por tabulação.
texto separado por tabulação.
```{r}
```{r}
##----------------------------------------------------------------------
##----------------------------------------------------------------------
## Para carregar da cópia web.
## Para carregar da cópia web.
## url <- "http://blog.leg.ufpr.br/~leg/legTools/dataset/wg
p
igs.txt"
## url <- "http://blog.leg.ufpr.br/~leg/legTools/dataset/wg
P
igs.txt"
## browseURL(url)
## browseURL(url)
## wg
p
igs <- read.table(file=url, header=TRUE, sep="\t")
## wg
P
igs <- read.table(file=url, header=TRUE, sep="\t")
## str(wg
p
igs)
## str(wg
P
igs)
##----------------------------------------------------------------------
##----------------------------------------------------------------------
## Para carregar do pacote legTools.
## Para carregar do pacote legTools.
data(wg
p
igs)
data(wg
P
igs)
str(wg
p
igs)
str(wg
P
igs)
```
```
...
@@ -161,9 +168,9 @@ library(latticeExtra)
...
@@ -161,9 +168,9 @@ library(latticeExtra)
## Valores observados de ganho de peso (wg) em função do tipo de ração
## Valores observados de ganho de peso (wg) em função do tipo de ração
## (ft).
## (ft).
unstack(x=wg
p
igs, form=wg~ft)
unstack(x=wg
P
igs, form=wg~ft)
xyplot(wg~ft, data=wg
p
igs,
xyplot(wg~ft, data=wg
P
igs,
ylab="Ganho de peso (kg)",
ylab="Ganho de peso (kg)",
xlab="Tipo de ração")
xlab="Tipo de ração")
...
@@ -213,7 +220,7 @@ vantajoso pela maior disponibilidade de métodos.
...
@@ -213,7 +220,7 @@ vantajoso pela maior disponibilidade de métodos.
## Ajuste do modelo.
## Ajuste do modelo.
## Especificação e ajuste do modelo.
## Especificação e ajuste do modelo.
m0 <- lm(wg~ft, data=wg
p
igs)
m0 <- lm(wg~ft, data=wg
P
igs)
## Verificação dos pressupostos.
## Verificação dos pressupostos.
par(mfrow=c(2,2)); plot(m0); layout(1)
par(mfrow=c(2,2)); plot(m0); layout(1)
...
@@ -241,12 +248,12 @@ head(X)
...
@@ -241,12 +248,12 @@ head(X)
## Contrastes considerados.
## Contrastes considerados.
m0$contrasts
m0$contrasts
contrasts(wg
p
igs$ft)
contrasts(wg
P
igs$ft)
##----------------------------------------------------------------------
##----------------------------------------------------------------------
## Estimativas das médias.
## Estimativas das médias.
L <- cbind(1, contrasts(wg
p
igs$ft))
L <- cbind(1, contrasts(wg
P
igs$ft))
L
L
L%*%coef(m0)
L%*%coef(m0)
...
@@ -259,7 +266,7 @@ colnames(L) <- names(coef(m0))
...
@@ -259,7 +266,7 @@ colnames(L) <- names(coef(m0))
pred <- estimable(obj=m0, cm=L, conf.int=0.95)
pred <- estimable(obj=m0, cm=L, conf.int=0.95)
pred
pred
pred <- cbind(ft=levels(wg
p
igs$ft), pred)
pred <- cbind(ft=levels(wg
P
igs$ft), pred)
segplot(ft~Lower.CI+Upper.CI, data=pred,
segplot(ft~Lower.CI+Upper.CI, data=pred,
centers=Estimate, draw=FALSE,
centers=Estimate, draw=FALSE,
...
@@ -267,7 +274,7 @@ segplot(ft~Lower.CI+Upper.CI, data=pred,
...
@@ -267,7 +274,7 @@ segplot(ft~Lower.CI+Upper.CI, data=pred,
ylab="Tipos de ração")
ylab="Tipos de ração")
## Valores observados sobrepostos as médias estimadas.
## Valores observados sobrepostos as médias estimadas.
xyplot(wg~ft, data=wg
p
igs,
xyplot(wg~ft, data=wg
P
igs,
ylab="Ganho de peso (kg)",
ylab="Ganho de peso (kg)",
xlab="Tipo de reação")+
xlab="Tipo de reação")+
as.layer(segplot(ft~Lower.CI+Upper.CI, data=pred,
as.layer(segplot(ft~Lower.CI+Upper.CI, data=pred,
...
@@ -364,11 +371,11 @@ nesse sentido.
...
@@ -364,11 +371,11 @@ nesse sentido.
##----------------------------------------------------------------------
##----------------------------------------------------------------------
## Ajuste do modelo.
## Ajuste do modelo.
wg
p
igs$wg[1] <- NA
wg
P
igs$wg[1] <- NA
unstack(x=wg
p
igs, form=wg~ft)
unstack(x=wg
P
igs, form=wg~ft)
## Especificação e ajuste do modelo.
## Especificação e ajuste do modelo.
m0 <- lm(wg~ft, data=wg
p
igs)
m0 <- lm(wg~ft, data=wg
P
igs)
## Verificação dos pressupostos.
## Verificação dos pressupostos.
par(mfrow=c(2,2)); plot(m0); layout(1)
par(mfrow=c(2,2)); plot(m0); layout(1)
...
@@ -386,7 +393,7 @@ colnames(L) <- names(coef(m0))
...
@@ -386,7 +393,7 @@ colnames(L) <- names(coef(m0))
pred <- estimable(obj=m0, cm=L, conf.int=0.95)
pred <- estimable(obj=m0, cm=L, conf.int=0.95)
pred
pred
pred <- cbind(ft=levels(wg
p
igs$ft), pred)
pred <- cbind(ft=levels(wg
P
igs$ft), pred)
##----------------------------------------------------------------------
##----------------------------------------------------------------------
## Comparações múltiplas.
## Comparações múltiplas.
...
...
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