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Commit 7da73d1e authored by Eduardo E. R. Junior's avatar Eduardo E. R. Junior
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Corrige tópicos da documentação e exemplos

 - Modifica keywords seguinte estrutura dos dados;
 - Modifica algumas representações gráficas;
 - Complementa documentação.
parent b54551ac
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1 merge request!111Bruno148 - Adiciona 8 tabelas do Andrade.
#' @name AndradeEg2.1
#' @title Estudo do Crescimento de Pastagem Relacionado a Temperatura
#' @description Estudo do tipo de relacionamento entre a taxa de
#' @title Relação entre Crescimento de Pastagem e Temperatura
#' @description Estudo sobre o relacionamento entre a taxa de
#' crescimento de uma pastagem cultivada no Planalto catarinense e a
#' temperatura do solo a 10 cm de profundidade, no período de junho
#' a novembro.
......@@ -11,25 +11,25 @@
#' \item{\code{temp}}{Temperatura do solo a 10 cm de profundidade, em
#' ºC.}
#'
#' \item{\code{tc}}{Taxa de crescimento da pastagem, em kg/hadia.}
#' \item{\code{tc}}{Taxa de crescimento da pastagem, em kg ha\eqn{^-1}
#' por dia.}
#'
#' }
#' @keywords AAS
#' @keywords RS
#' @source Estatística para as ciências agrárias e biológicas: com
#' noções de experimentação / Dalton F. Andrade, Paulo J. Ogliari.
#' 2. ed. rev. e ampl. - Florianópolis: Ed. da UFSC, 2010. (Exemplo
#' 2.1, pág. 60)
#' @examples
#'
#' library(lattice)
#'
#' data(AndradeEg2.1)
#' str(AndradeEg2.1)
#'
#' library(lattice)
#' xyplot(tc ~ temp,
#' data = AndradeEg2.1,
#' type = c("p", "r"),
#' xlab = "Temperatura do solo (ºC)",
#' ylab = "Taxa de crescimento (kg/hadia)")
#' ylab = expression(Taxa~de~crescimento~(kg~ha^{-1}~dia)))
#'
NULL
#' @name AndradeTb1.1
#' @title Estudo da Duração do Quinto Estádio Ninfal de Triatoma Klugi
#' @title Estudo da Duração do Quinto Estádio Ninfal de \emph{Triatoma
#' Klugi}
#' @description Foi feito um experimento, na Universidade Federal de
#' Santa Catarina, para estudar a duração, em dias, do quinto
#' estádio ninfal de Triatoma klugi com alimentação em galo.
#' estádio ninfal de \emph{Triatoma klugi} com alimentação em galo.
#' @format Um \code{vetor} numérico com 35 observações.
#' @keywords AAS
#' @source Estatística para as ciências agrárias e biológicas: com
......@@ -12,6 +13,7 @@
#' @examples
#'
#' data(AndradeTb1.1)
#' str(AndradeTb1.1)
#'
#' hist(AndradeTb1.1,
#' prob = TRUE,
......@@ -23,16 +25,13 @@
#' ylim = c(0, 0.062))
#'
#' lines(density(AndradeTb1.1), lwd = 2)
#'
#' rug(AndradeTb1.1)
#'
#' boxplot(AndradeTb1.1,
#' ylab = "Duração do Quinto Estádio Ninfal (em dias)")
#'
#' mean(AndradeTb1.1)
#'
#' sd(AndradeTb1.1)
#'
#' fivenum(AndradeTb1.1)
#'
NULL
#' @name AndradeTb1.2
#' @title Experimento de Produção de Milho em função do Nitrogênio
#' @title Experimento de Produção de Milho em Função do Nitrogênio
#' @description Experimento que tem como objetivo verificar o
#' comportamento da produção de milho sob o efeito de diferentes
#' doses de nitrogênio. Para cada dose de nitrogênio foram plantados
#' cinco canteiros de terra de \eqn{10m^{2}} cada. Portanto o
#' tamanho da amostra para cada dose de nitrogênio é cinco.
#' cinco canteiros de terra de \eqn{10m^{2}} cada. Portanto, são
#' cinco observações para cada dose de nitrogênio.
#' @format Um \code{data.frame} com 25 observações e 3 variáveis, em que
#'
#' \describe{
#'
#' \item{\code{trat}}{Fator de 5 níveis qualitativos que são as dosagens
#' de Nitrogênio, em \eqn{kg.ha^{-1}}.}
#' \item{\code{trat}}{Fator de 5 níveis que são as dosagens de
#' Nitrogênio, em \eqn{kg\ ha^{-1}}.}
#'
#' \item{\code{rept}}{Fator de 5 níveis qualitativos que são as
#' repetições do experimento.}
#'
#' \item{\code{prod}}{Produção de milho, em \eqn{kg.ha^{-1}}.}
#' \item{\code{prod}}{Produção de milho, em \eqn{kg\ ha^{-1}}.}
#'
#' }
#' @keywords DBC
#' @keywords DIC
#' @source Estatística para as ciências agrárias e biológicas: com
#' noções de experimentação / Dalton F. Andrade, Paulo J. Ogliari.
#' 2. ed. rev. e ampl. - Florianópolis: Ed. da UFSC, 2010. (Tabela
#' 1.2, pág. 40)
#' @examples
#'
#' library(lattice)
#'
#' data(AndradeTb1.2)
#' str(AndradeTb1.2)
#'
#' library(lattice)
#' xyplot(prod ~ trat,
#' groups = rept,
#' data = AndradeTb1.2,
#' type = c("p", "a"),
#' auto.key = list(title = "Repetições",
#' cex.title = 1.1,
#' columns = 5),
#' xlab = "Dosagem de Nitrogênio (em kg/ha)",
#' ylab = "Produção de Milho (em kg/ha)")
#' xlab = expression(Dosagem~de~Nitrogênio~(em~kg~ha^{-1})),
#' ylab = expression(Produção~de~Milho~(em~kg~ha^{-1})))
#'
NULL
#' @name AndradeTb2.1
#' @title Experimento de Competição de Híbridos de Milho
#' @description Um pesquisador instalou um experimento, na região de
#' Chapecó, SC, para avaliação do comportamento de híbridos de
#' milho.
#' @title Competição de Híbridos de Milho
#' @description Um pesquisador avaliou, na região de Chapecó, SC, o
#' comportamento de híbridos de milho mensurados pelo rendimento
#' médio de milho, ciclo de vida, altura da planta e altura da
#' espiga.
#' @format Um \code{data.frame} com 32 observações e 7 variáveis, em que
#'
#' \describe{
......@@ -11,7 +12,7 @@
#' híbridos de milho.}
#'
#' \item{\code{rm}}{Rendimento médio do híbrido de milho, em
#' \eqn{kg.ha^{-1}}.}
#' \eqn{kg\ ha^{-1}}.}
#'
#' \item{\code{ciclo}}{Ciclo de vida do híbrido de milho, em dias.}
#'
......@@ -23,11 +24,12 @@
#' de grão.}
#'
#' \item{\code{resist}}{Fator de 4 níveis qualitativos que indica a
#' resistência à ferrugem, sendo: r = resistente; mr = moderadamente
#' resistente; ms = moderadamente susceptível; s = susceptível.}
#' resistência à ferrugem, sendo \code{r}: resistente; \code{mr}:
#' moderadamente resistente; \code{ms}: moderadamente susceptível; e
#' \code{s}: susceptível.}
#'
#' }
#' @keywords AAS
#' @keywords AASM
#' @source Estatística para as ciências agrárias e biológicas: com
#' noções de experimentação / Dalton F. Andrade, Paulo J. Ogliari.
#' 2. ed. rev. e ampl. - Florianópolis: Ed. da UFSC, 2010. (Tabela
......@@ -35,73 +37,78 @@
#' @examples
#'
#' library(lattice)
#' library(plyr)
#'
#' data(AndradeTb2.1)
#' str(AndradeTb2.1)
#'
#' xyplot(rm ~ hibr,
#' groups = grao,
#' type = "b",
#' data = AndradeTb2.1,
#' auto.key = list(title = "Tipo de Grão",
#' cex.title = 1.1,
#' columns = 3),
#' ylab = "Rendimendo Médio (em kg/ha)",
#' xlab = "Híbrido de Milho")
#' levels_resist <- c("Resistente", "Moderadamente Resistente",
#' "Moderadamente Susceptível", "Susceptível")
#'
#' xyplot(rm ~ hibr,
#' # Comportamento do rendimento médio
#' xyplot(rm ~ hibr | grao,
#' groups = resist,
#' type = "b",
#' layout = c(NA, 1),
#' data = AndradeTb2.1,
#' auto.key = list(title = "Resistência à Ferrugem",
#' auto.key = list(title = "Resistência à ferrugem",
#' cex.title = 1.1,
#' columns = 4),
#' columns = 2,
#' text = levels_resist),
#' ylab = "Rendimendo Médio (em kg/ha)",
#' xlab = "Híbrido de Milho")
#'
#' xyplot(ciclo ~ hibr,
#' groups = grao,
#' type = "b",
#' data = AndradeTb2.1,
#' auto.key = list(title = "Tipo de Grão",
#' cex.title = 1.1,
#' columns = 3),
#' ylab = "Ciclo (em dias)",
#' xlab = "Híbrido de Milho")
#'
#' xyplot(ciclo ~ hibr,
#' # Compartamento do ciclo de vida
#' xyplot(ciclo ~ hibr | grao,
#' groups = resist,
#' type = "b",
#' layout = c(NA, 1),
#' data = AndradeTb2.1,
#' auto.key = list(title = "Resistência à Ferrugem",
#' auto.key = list(title = "Resistência à ferrugem",
#' cex.title = 1.1,
#' columns = 4),
#' columns = 2,
#' text = levels_resist),
#' ylab = "Ciclo (em dias)",
#' xlab = "Híbrido de Milho")
#'
#' xyplot(ap + ae ~ hibr,
#' groups = grao,
#' # Comportamento das alturas
#' library(latticeExtra)
#' useOuterStrips(
#' xyplot(ap + ae ~ hibr | grao,
#' groups = resist,
#' type = "b",
#' strip = strip.custom(factor.levels = c("Altura da Planta",
#' "Altura da Espiga")),
#' data = AndradeTb2.1,
#' auto.key = list(title = "Tipo de Grão",
#' auto.key = list(title = "Resistência à ferrugem",
#' cex.title = 1.1,
#' columns = 3),
#' columns = 2,
#' text = levels_resist),
#' ylab = "Altura (em cm)",
#' xlab = "Híbrido de Milho")
#'
#' xyplot(ap + ae ~ hibr,
#' xlab = "Híbrido de Milho"),
#' strip.left = strip.custom(factor.levels = c("Planta", "Espiga"))
#' )
#'
#' # Comportamento geral
#' vars <- c("Rendimento", "Ciclo de vida", "Altura planta", "Altura espiga")
#' useOuterStrips(
#' xyplot(rm + ciclo + ap + ae ~ hibr | grao,
#' groups = resist,
#' type = "b",
#' strip = strip.custom(factor.levels = c("Altura da Planta",
#' "Altura da Espiga")),
#' data = AndradeTb2.1,
#' auto.key = list(title = "Resistência à Ferrugem",
#' type = "b",
#' as.table = TRUE,
#' xlab = "Híbrido de Milho",
#' ylab = "",
#' scales = list(y = "free", x = list(rot = 90)),
#' auto.key = list(
#' title = "Resistência à Ferrugem",
#' cex.title = 1.1,
#' columns = 4),
#' ylab = "Altura (em cm)",
#' xlab = "Híbrido de Milho")
#' columns = 2,
#' text = levels_resist)
#' ),
#' strip.left = strip.custom(factor.levels = vars)
#' )
#'
#' # Relação entre as variáveis de interesse
#' splom(~AndradeTb2.1[, c("rm", "ciclo", "ap", "ae")],
#' type = c("p", "smooth"),
#' data = AndradeTb2.1)
#'
NULL
#' @name AndradeTb2.11
#' @title Experimento de Contagem de Plantas
#' @title Relação entre Ciclo e Virescência em Plantas
#' @description Experimento que tem por objetivo verificar se os
#' caracteres ciclo e virescência, de uma progênie da espécie "X",
#' segregam de forma independente.
......@@ -8,32 +8,33 @@
#' \describe{
#'
#' \item{\code{ciclo}}{Fator de 2 níveis qualitativos que indica o
#' caractere ciclo (Tardio e Precoce).}
#' caractere ciclo (tardio e precoce).}
#'
#' \item{\code{vir}}{Fator de 3 níveis qualitativos que indica o
#' caractere virescência (Normal e Virescente).}
#' caractere virescência (normal e virescente).}
#'
#' \item{\code{cont}}{Contagem de plantas segregando para dois
#' caracteres numa progênie da espécie "X".}
#'
#' }
#' @keywords AAS
#' @keywords contingência
#' @source Estatística para as ciências agrárias e biológicas: com
#' noções de experimentação / Dalton F. Andrade, Paulo J. Ogliari.
#' 2. ed. rev. e ampl. - Florianópolis: Ed. da UFSC, 2010. (Tabela
#' 2.11, pág. 80)
#' @examples
#'
#' library(lattice)
#'
#' data(AndradeTb2.11)
#' str(AndradeTb2.11)
#'
#' tb <- xtabs(cont~ciclo + vir, data= AndradeTb2.11)
#' (tb <- xtabs(cont~ciclo + vir, data= AndradeTb2.11))
#'
#' mosaicplot(tb)
#'
#' barplot(t(tb),
#' beside = TRUE,
#' legend.text = TRUE,
#' args.legend = list(x = "topleft"),
#' col = c("darkturquoise", "lawngreen"),
#' ylim = c(0, 3500),
#' xlab = "Ciclo",
......
#' @name AndradeTb2.12
#' @title Estudo de Alimentação de Pássaros
#' @description Estudo do número de pássadors de uma particular espécie,
#' classificados de acordo com o local da floresta onde se
#' alimentam, para duas estações do ano.
#' @title Relação do Número de Pássaros com Local de Alimentação
#' @description Estudo sobre o número de pássaros de uma particular
#' espécie observados em diferentes locais de alimentação na
#' floresta. O estudo foi realizado em duas estações do ano.
#' @format Um \code{data.frame} com 6 observações e 3 variáveis, em que
#'
#' \describe{
#'
#' \item{\code{estacao}}{Fator de 2 níveis qualitativos que são as
#' estações do ano (Primavera e Outono).}
#' estações do ano (primavera e outono).}
#'
#' \item{\code{local}}{Fator de 3 níveis qualitativos que são os locais
#' da Floresta (Árvores, Arbusto e Chão).}
#' da Floresta (árvores, arbusto e chão).}
#'
#' \item{\code{passaros}}{Número de pássaros de uma particular espécie.}
#'
#' }
#' @keywords AAS
#' @keywords contingência
#' @source Estatística para as ciências agrárias e biológicas: com
#' noções de experimentação / Dalton F. Andrade, Paulo J. Ogliari.
#' 2. ed. rev. e ampl. - Florianópolis: Ed. da UFSC, 2010. (Tabela
#' 2.12, pág. 81)
#' @examples
#'
#' library(lattice)
#'
#' data(AndradeTb2.12)
#' str(AndradeTb2.12)
#'
#' xyplot(passaros ~ estacao,
#' groups = local,
#' data = AndradeTb2.12,
#' type = "b",
#' auto.key = list(title = "Local da Floresta",
#' (tb <- xtabs(passaros ~ estacao + local, data= AndradeTb2.12))
#'
#' mosaicplot(tb)
#'
#' library(lattice)
#' barchart(tb,
#' stack = FALSE,
#' horizontal = FALSE,
#' auto.key = list(
#' title = "Local de alimentação",
#' cex.title = 1.1,
#' columns = 3),
#' xlab = "Estação do Ano",
#' ylab = "Número de Pássaros")
#' columns = 3))
#'
NULL
......@@ -12,28 +12,34 @@
#' mandioca.}
#'
#' }
#' @keywords AAS
#' @keywords tabfreq
#' @source Estatística para as ciências agrárias e biológicas: com
#' noções de experimentação / Dalton F. Andrade, Paulo J. Ogliari.
#' 2. ed. rev. e ampl. - Florianópolis: Ed. da UFSC, 2010. (Tabela
#' 2.15, pág. 89)
#' @examples
#'
#' library(lattice)
#'
#' data(AndradeTb2.15)
#' str(AndradeTb2.15)
#'
#' bp <- barplot(AndradeTb2.15$freq * (100/sum(AndradeTb2.15$freq)),
#' names.arg = AndradeTb2.15$plantas,
#' # Gráfico de barras
#' with(AndradeTb2.15, {
#' fr <- paste0("(", round(100 * freq / sum(freq)), "% )")
#' bp <- barplot(freq,
#' names.arg = plantas,
#' col = "darkturquoise",
#' beside = TRUE,
#' ylim = c(0, 50),
#' ylim = extendrange(freq),
#' xlab = "Número de Plantas Colhidas Sadias",
#' ylab = "Porcentagem do Número de Parcelas")
#'
#' text(bp, 0,
#' round(AndradeTb2.15$freq * (100/sum(AndradeTb2.15$freq)), 1),
#' cex= 1, pos = 3)
#' text(bp, freq + 0.3, labels = paste(freq, fr))
#' })
#'
#' # Gráfico de setores
#' with(AndradeTb2.15, {
#' fr <- paste0("(", round(100 * freq / sum(freq)), "%)")
#' pie(freq, labels = paste(plantas, "plantas\nsadias", fr),
#' col = gray.colors(length(freq)))
#' })
#'
NULL
......@@ -8,37 +8,35 @@
#' \describe{
#'
#' \item{\code{H}}{Fator de 2 níveis qualitativos que são os hábitos de
#' crescimento, sendo: 3 = "indeterminado trepador"; 4 =
#' "indeterminado prostrado".}
#' crescimento, sendo \code}{3}: "indeterminado trepador"; e
#' \code{4}: "indeterminado prostrado".}
#'
#' \item{\code{P}}{Fator de 3 níveis qualitativos que são os portes,
#' sendo: Tr = "trepador"; EB = "ereto na base"; Pr = "prostrado".}
#' sendo \code{Tr}: "trepador"; \code{EB}: "ereto na base"; e
#' \code{Pr}: "prostrado".}
#'
#' }
#' @keywords AAS
#' @keywords contingência
#' @source Estatística para as ciências agrárias e biológicas: com
#' noções de experimentação / Dalton F. Andrade, Paulo J. Ogliari.
#' 2. ed. rev. e ampl. - Florianópolis: Ed. da UFSC, 2010. (Tabela
#' 2.6, pág. 74)
#' @examples
#'
#' library(lattice)
#' library(plyr)
#'
#' data(AndradeTb2.6)
#' str(AndradeTb2.6)
#'
#' tb <- xtabs(~H+P, data= AndradeTb2.6)
#' (tb <- xtabs(~H+P, data= AndradeTb2.6))
#'
#' mosaicplot(tb)
#'
#' barplot(t(tb), names.arg = c("Prostrado", "Trepador"),
#' beside = TRUE,
#' space = c(0.2, 1),
#' col = c("darkturquoise", "lawngreen", "blue"),
#' ylim = c(0, 30))
#'
#' legend("topleft",
#' legend = c("Eb", "Pr", "Tr"),
#' col = c("darkturquoise", "lawngreen","blue"),
#' pch = 8)
#' legend = levels(AndradeTb2.6$P),
#' fill = c("darkturquoise", "lawngreen", "blue"))
#'
NULL
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